EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000024621 (Gene tree)
Gene ID: 111854898
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: EH domain-containing protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12993 bases
Position: chrPGUA01000282.1:3194-16186
Accession: 111854898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000009554	MMR_HSR1	PF01926.23	4.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000033666	-	1624	-	ENSPKIP00000009554	449 (aa)	XP_023689159	UPI000CD5CC11
ENSPKIT00000033680	-	1251	-	ENSPKIP00000009568	416 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	57.684	ENSPKIG00000023918	-	98	57.684
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.754	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.754	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.060	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	77.060	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	78.174	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	78.174	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	59.382	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	59.382	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.976	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.976	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.976	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.976	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	61.333	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	77.506	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	59.823	ENSACAG00000028632	-	99	59.823	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	77.506	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.278	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	75.278	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	77	61.449	ENSCING00000020807	-	91	61.449	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	98	55.455	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.682	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	76.404	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	95	76.585	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.940	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.056	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	75.056	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.532	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.604	Danio_rerio
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	98	76.591	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	76.591	Danio_rerio
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	81	53.444	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	53.444	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Esox_lucius
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.724	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	75.724	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	90	55.941	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	100	55.941	Gadus_morhua
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.754	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.754	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.724	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	75.724	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	58	86.873	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	86.873	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	85	64.491	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	100	62.469	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.728	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	77.728	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	71.622	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	71.622	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	89	56.784	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	88	56.784	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	96	60.046	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.046	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	73.719	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	73.719	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.532	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.532	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.060	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	77.060	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.056	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	75.056	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	65.410	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	65.410	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.356	ENSLACG00000004899	-	99	60.356	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	61.124	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.022	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	72.931	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.931	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	96	61.290	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	61.290	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	77.506	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	57.860	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.860	Mola_mola
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	98	75.000	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	76.136	Monopterus_albus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Monopterus_albus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.508	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	77.506	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	78.619	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	78.619	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	73.497	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	73.497	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	61.197	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.197	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	78.396	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	78.396	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	61.197	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	61.197	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.501	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	75.501	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	74.558	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	74.558	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	74.833	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	74.833	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	61.060	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.278	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	75.278	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	98	74.773	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	74.773	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	94	58.237	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.237	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.728	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	100	77.728	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	76.169	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	76.169	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	58.575	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	94	58.575	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	76.629	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	76.629	Scophthalmus_maximus
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