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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000000356 (Gene tree)
Gene ID: 106962366
Gene Symbol: xpo1a
Alias: -
Full Name: exportin-1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15576 bases
Position: chrKQ546718.1:127349-142924
Accession: 106962366
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000027057	CRM1_C	PF08767.11	4.4e-131	1	1
ENSPLAP00000027068	CRM1_C	PF08767.11	6e-131	1	1
ENSPLAP00000027068	Xpo1	PF08389.12	8.8e-42	1	1
ENSPLAP00000027057	Xpo1	PF08389.12	1.1e-29	1	1
ENSPLAP00000027068	IBN_N	PF03810.19	6.9e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000029441	-	2757	-	ENSPLAP00000027057	918 (aa)	-	-
ENSPLAT00000019713	-	4749	XM_015056748	ENSPLAP00000027068	1066 (aa)	XP_014912234	UPI0004448760

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.530	ENSPLAG00000018279	-	100	92.530

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.943	ENSG00000082898	XPO1	100	90.943	Homo_sapiens
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.213	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	95.936	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.717	ENSAPOG00000004984	-	100	92.717	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.604	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	91.604	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.128	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.861	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	88.148	ENSACIG00000010818	-	100	93.617	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	98.030	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	98.030	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.624	ENSAOCG00000010121	-	100	92.624	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.447	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	98.240	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.624	ENSAPEG00000007038	-	100	92.624	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	97.655	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	97.655	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.624	ENSATEG00000008816	-	100	92.624	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.970	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	91.970	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.970	ENSACAG00000002501	XPO1	100	91.970	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.943	ENSANAG00000020802	XPO1	100	90.943	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.743	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	98.182	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.530	ENSACLG00000015192	-	100	92.530	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.997	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	92.997	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	89.524	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.326	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.690	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	91.690	Bos_taurus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	99	51.840	WBGene00002078	xpo-1	98	52.072	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.943	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	90.943	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.690	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	91.690	Canis_familiaris
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	87.580	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	92.184	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.690	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	91.690	Capra_hircus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.690	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	91.690	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000000356	xpo1a	61	88.298	ENSCAPG00000006454	-	100	88.298	Cavia_aperea
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.289	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	90.289	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	73.840	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.026	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	89.199	ENSCATG00000032674	XPO1	100	91.809	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.503	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.503	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.943	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.943	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	83	92.866	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	92.866	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.970	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.970	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000000356	xpo1a	99	80.359	ENSCING00000024562	-	99	80.359	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000000356	xpo1a	99	78.839	ENSCSAVG00000005965	-	99	78.839	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	87.208	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.943	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.943	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.943	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	90.943	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	87.196	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.660	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	98.593	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	98.593	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.437	ENSCVAG00000016788	-	100	92.437	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	93.277	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.046	Danio_rerio
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	93.184	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	93.184	Danio_rerio
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.783	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	91.783	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	91	88.802	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	88.802	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000000356	xpo1a	99	69.426	FBgn0020497	emb	99	69.426	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000000356	xpo1a	94	90.775	ENSETEG00000018045	XPO1	94	90.775	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	79.870	ENSEBUG00000012580	-	100	86.340	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.690	ENSEASG00005007223	XPO1	100	91.690	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.690	ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.413	Equus_caballus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	89.524	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.223	Esox_lucius
ENSPLAG00000000356	xpo1a	99	84.984	ENSELUG00000014306	-	99	90.578	Esox_lucius
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.690	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	91.690	Felis_catus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.783	ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.783	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.103	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	90.103	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000000356	xpo1a	57	94.588	ENSFHEG00000018974	-	100	94.588	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	98.499	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	98.499	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	87.115	ENSGMOG00000019063	-	100	87.115	Gadus_morhua
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	94.653	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	94.653	Gadus_morhua
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.970	ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.970	Gallus_gallus
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	88.148	ENSGAFG00000003355	-	98	93.100	Gambusia_affinis
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	97.280	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	97.280	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.877	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.877	Gopherus_agassizii
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	98.030	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	98.030	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.410	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	91.410	Heterocephalus_glaber_female
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	86.984	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.340	Hippocampus_comes
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	93.744	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.744	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.503	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.503	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.503	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	91.503	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	98.874	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	98.874	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.344	ENSKMAG00000016218	-	100	92.344	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.011	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.314	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.624	ENSLBEG00000005740	-	100	92.624	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	71.429	ENSLACG00000018213	XPO1	100	71.429	Latimeria_chalumnae
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.597	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	91.597	Loxodonta_africana
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	90.943	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	90.943	Macaca_nemestrina
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	97.749	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	97.749	Mastacembelus_armatus
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ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	92.530	ENSMZEG00005018158	-	98	93.100	Maylandia_zebra
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