EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000002220 (Gene tree)
Gene ID: 106951217
Gene Symbol: ireb2
Alias: -
Full Name: iron responsive element binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14648 bases
Position: chrKQ545762.1:434598-449245
Accession: 106951217
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000001215	Aconitase	PF00330.20	8.1e-154	1	2
ENSPLAP00000001215	Aconitase	PF00330.20	8.1e-154	2	2
ENSPLAP00000019786	Aconitase	PF00330.20	8.3e-153	1	2
ENSPLAP00000019786	Aconitase	PF00330.20	8.3e-153	2	2
ENSPLAP00000001215	Aconitase_C	PF00694.19	2.9e-37	1	1
ENSPLAP00000019786	Aconitase_C	PF00694.19	2.9e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000015149	-	2973	-	ENSPLAP00000019786	990 (aa)	-	-
ENSPLAT00000015127	-	5249	XM_015038602	ENSPLAP00000001215	989 (aa)	XP_014894088	UPI00072DAAAD

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000002220's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000002220's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000002220	ireb2	81	59.467	ENSPLAG00000023422	aco1	97	59.467

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.295	ENSG00000136381	IREB2	97	72.973	Homo_sapiens
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.843	ENSAPOG00000020564	ireb2	100	88.843	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.843	ENSAPOG00000016684	ireb2	99	90.267	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.843	ENSAPOG00000015501	-	100	88.843	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	67.632	ENSAMEG00000012645	IREB2	99	67.632	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	89.577	ENSACIG00000012557	ireb2	99	89.855	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	89.928	ENSAOCG00000000407	ireb2	100	89.928	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	90.041	ENSAPEG00000009121	ireb2	100	90.041	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	82.834	ENSATEG00000021210	ireb2	99	82.834	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	84.385	ENSATEG00000021145	ireb2	99	84.385	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	67.045	ENSAPLG00000016388	IREB2	99	67.045	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.503	ENSANAG00000021994	IREB2	99	68.503	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.592	ENSACLG00000024688	ireb2	100	88.592	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	78.199	ENSAMXG00000008756	ireb2	100	78.301	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	68.008	ENSBTAG00000002504	IREB2	99	68.219	Bos_taurus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.399	ENSCJAG00000010259	IREB2	99	68.399	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.191	ENSCAFG00000001766	IREB2	99	68.191	Canis_familiaris
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.872	ENSCAFG00020021072	IREB2	99	69.066	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	68.215	ENSCHIG00000023111	IREB2	99	68.427	Capra_hircus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.662	ENSTSYG00000011729	IREB2	99	68.050	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000002220	ireb2	85	65.493	ENSCAPG00000011854	IREB2	99	65.554	Cavia_aperea
ENSPLAG00000002220	ireb2	85	67.820	ENSCPOG00000013905	IREB2	99	67.820	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.503	ENSCCAG00000021202	IREB2	99	68.503	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	ENSCATG00000033462	IREB2	99	68.711	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.607	ENSCLAG00000008985	IREB2	99	68.607	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	ENSCSAG00000014904	IREB2	99	68.711	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	65.938	ENSCHOG00000004107	IREB2	99	65.938	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	68.074	ENSCPBG00000024247	IREB2	99	69.061	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.607	ENSCANG00000029420	IREB2	99	68.607	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.399	ENSCGRG00001019234	Ireb2	99	68.399	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.399	ENSCGRG00000016786	Ireb2	99	68.399	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	82.136	ENSCSEG00000003080	ireb2	100	82.649	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	90.214	ENSCVAG00000010739	ireb2	99	90.622	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	75.359	ENSDARG00000021466	ireb2	99	75.230	Danio_rerio
ENSPLAG00000002220	ireb2	94	68.162	ENSDNOG00000009614	IREB2	99	68.162	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000002220	ireb2	89	64.424	ENSDORG00000014339	Ireb2	99	60.499	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000002220	ireb2	73	70.732	ENSETEG00000012717	IREB2	74	70.732	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.854	ENSEASG00005015622	IREB2	99	68.854	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.854	ENSECAG00000016731	IREB2	99	71.600	Equus_caballus
ENSPLAG00000002220	ireb2	91	66.481	ENSEEUG00000007999	IREB2	99	66.481	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	81.641	ENSELUG00000023666	ireb2	100	82.154	Esox_lucius
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.905	ENSFCAG00000001921	IREB2	99	68.224	Felis_catus
ENSPLAG00000002220	ireb2	89	69.159	ENSFALG00000010640	IREB2	99	69.159	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.815	ENSFDAG00000009355	IREB2	99	68.815	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	92.792	ENSFHEG00000017905	ireb2	98	92.792	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	79.321	ENSGMOG00000009184	ireb2	100	79.321	Gadus_morhua
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	67.256	ENSGALG00000035462	IREB2	99	67.256	Gallus_gallus
ENSPLAG00000002220	ireb2	100	93.676	ENSGAFG00000005145	ireb2	100	93.676	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	84.734	ENSGACG00000007341	ireb2	100	84.734	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.456	ENSGAGG00000006117	IREB2	96	67.456	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.295	ENSGGOG00000015650	IREB2	99	68.295	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.592	ENSHBUG00000007184	ireb2	100	88.592	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	69.543	ENSHGLG00000000783	Ireb2	99	69.543	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	69.543	ENSHGLG00100019429	Ireb2	99	69.543	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000002220	ireb2	96	82.180	ENSHCOG00000007424	ireb2	100	82.180	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	76.986	ENSIPUG00000014808	Ireb2	100	76.806	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	68.318	ENSSTOG00000009273	IREB2	99	68.530	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	63.131	ENSJJAG00000019768	Ireb2	99	63.131	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	89.162	ENSKMAG00000016020	ireb2	99	89.162	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	89.026	ENSLBEG00000020371	ireb2	100	89.026	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	62.705	ENSLACG00000001182	IREB2	99	62.705	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	75.866	ENSLOCG00000015029	ireb2	100	75.967	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.300	ENSLAFG00000012839	IREB2	99	68.300	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	ENSMFAG00000039630	IREB2	99	68.711	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	ENSMMUG00000045680	IREB2	99	68.711	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	66.736	ENSMNEG00000039698	IREB2	99	66.736	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	ENSMLEG00000031047	IREB2	99	68.711	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	86.448	ENSMAMG00000023095	ireb2	100	86.448	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.695	ENSMZEG00005010935	ireb2	100	88.695	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	67.427	ENSMGAG00000003688	IREB2	99	67.427	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.191	ENSMICG00000005757	IREB2	99	68.191	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.191	ENSMOCG00000010784	Ireb2	99	68.191	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	88.382	ENSMMOG00000001385	ireb2	97	88.382	Mola_mola
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.783	ENSMODG00000011768	IREB2	99	68.783	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	85.670	ENSMALG00000015314	ireb2	99	85.907	Monopterus_albus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	MGP_CAROLIEiJ_G0032235	Ireb2	99	68.711	Mus_caroli
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	ENSMUSG00000032293	Ireb2	99	68.711	Mus_musculus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.542	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	99	68.542	Mus_pahari
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.711	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	99	68.711	Mus_spretus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.815	ENSMPUG00000010978	IREB2	95	68.705	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	66.701	ENSMLUG00000006783	IREB2	99	66.701	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.750	ENSNGAG00000017333	Ireb2	99	68.750	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.398	ENSNBRG00000017676	ireb2	100	88.398	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.503	ENSNLEG00000008549	IREB2	99	68.503	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000002220	ireb2	73	76.699	ENSMEUG00000001630	-	74	76.699	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	65.172	ENSOPRG00000000340	IREB2	99	65.172	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.503	ENSODEG00000015993	IREB2	99	68.503	Octodon_degus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.706	ENSONIG00000012838	ireb2	100	88.706	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.399	ENSOANG00000013218	-	98	68.399	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000002220	ireb2	92	68.352	ENSOCUG00000009907	IREB2	99	68.352	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	86.925	ENSORLG00000001943	ireb2	93	86.925	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	87.156	ENSORLG00020000623	ireb2	98	87.156	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	87.143	ENSORLG00015014057	ireb2	99	87.143	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	86.701	ENSOMEG00000005120	ireb2	99	86.810	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	65.836	ENSOGAG00000010622	IREB2	99	65.836	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.795	ENSOARG00000000881	IREB2	99	68.004	Ovis_aries
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.295	ENSPPAG00000038956	IREB2	99	68.295	Pan_paniscus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	68.008	ENSPPRG00000003145	IREB2	99	68.328	Panthera_pardus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.835	ENSPTIG00000021418	IREB2	86	68.120	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.905	ENSPTRG00000007342	IREB2	99	68.012	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	68.351	ENSPANG00000015813	IREB2	99	68.711	Papio_anubis
ENSPLAG00000002220	ireb2	99	75.204	ENSPKIG00000012755	ireb2	100	75.204	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000002220	ireb2	88	69.565	ENSPSIG00000009905	IREB2	98	69.565	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	83.058	ENSPMGG00000016828	ireb2	99	83.230	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.503	ENSPEMG00000020204	Ireb2	99	68.503	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.526	ENSPCIG00000019022	IREB2	88	67.526	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000002220	ireb2	100	99.292	ENSPFOG00000014509	ireb2	100	99.292	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000002220	ireb2	100	98.787	ENSPMEG00000010284	ireb2	100	98.787	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000002220	ireb2	100	97.776	ENSPREG00000012857	ireb2	100	97.776	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000002220	ireb2	57	70.232	ENSPPYG00000006696	-	99	70.232	Pongo_abelii
ENSPLAG00000002220	ireb2	87	68.657	ENSPCAG00000001992	IREB2	89	68.657	Procavia_capensis
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.295	ENSPCOG00000021988	IREB2	99	68.295	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000002220	ireb2	85	66.711	ENSPVAG00000014630	IREB2	86	66.711	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.706	ENSPNYG00000008976	ireb2	100	88.706	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	78.506	ENSPNAG00000027252	ireb2	100	78.608	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.191	ENSRNOG00000013271	Ireb2	99	68.191	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.607	ENSRBIG00000033855	IREB2	99	68.607	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.607	ENSRROG00000001424	IREB2	99	69.444	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	68.399	ENSSBOG00000030803	IREB2	99	69.494	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000002220	ireb2	70	67.529	ENSSHAG00000017490	-	99	67.529	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	76.127	ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.264	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	88.338	ENSSMAG00000005657	ireb2	99	89.628	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	90.041	ENSSDUG00000023484	ireb2	100	90.041	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	89.630	ENSSLDG00000001705	ireb2	100	89.630	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000002220	ireb2	94	68.851	ENSSARG00000001203	IREB2	99	68.851	Sorex_araneus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	67.531	ENSSPUG00000006298	IREB2	99	67.531	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	89.733	ENSSPAG00000000877	ireb2	100	89.733	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	68.111	ENSSSCG00000001756	IREB2	99	68.323	Sus_scrofa
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	67.152	ENSTGUG00000003332	IREB2	99	67.152	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	85.258	ENSTRUG00000015902	ireb2	100	85.113	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000002220	ireb2	91	60.515	ENSTBEG00000010922	IREB2	92	60.515	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	59.443	ENSTTRG00000000698	IREB2	99	59.627	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000002220	ireb2	92	69.231	ENSUAMG00000017908	IREB2	99	69.231	Ursus_americanus
ENSPLAG00000002220	ireb2	98	67.149	ENSUMAG00000011242	IREB2	99	67.641	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	67.983	ENSVPAG00000008245	IREB2	99	67.983	Vicugna_pacos
ENSPLAG00000002220	ireb2	92	69.011	ENSVVUG00000007811	IREB2	99	69.011	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000002220	ireb2	97	56.468	ENSXETG00000009774	ireb2	99	56.468	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000002220	ireb2	100	95.960	ENSXCOG00000020858	ireb2	100	95.960	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000002220	ireb2	100	95.960	ENSXMAG00000002195	ireb2	100	95.960	Xiphophorus_maculatus