EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000003709 (Gene tree)
Gene ID: 106944566
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC106944566
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13232 bases
Position: chrKQ545419.1:440028-453259
Accession: 106944566
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000020637	MMR_HSR1	PF01926.23	7.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000013038	-	1997	XM_015027623	ENSPLAP00000020637	448 (aa)	XP_014883109	UPI00072DF9AD

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	60.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	58.537	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Amphiprion_percula
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ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	99	57.366	ENSACAG00000028632	-	99	57.366	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	58.850	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.692	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.692	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	79.510	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.510	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	79	60.112	ENSCING00000020807	-	94	60.112	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	98	54.545	ENSCSAVG00000009987	-	98	54.773	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	87.500	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	84.906	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	94.643	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	94.643	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	72.959	Danio_rerio
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	98	82.500	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	Danio_rerio
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	79	55.650	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	55.650	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	99	79.821	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.821	Esox_lucius
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	94.420	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	94.420	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.202	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	89	54.863	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.863	Gadus_morhua
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	98.214	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	98.214	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	85	63.969	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.940	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	99	83.784	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.784	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	76.837	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.837	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	96	59.353	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.353	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	81	59.003	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	59.003	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Kryptolebias_marmoratus
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ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Labrus_bergylta
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ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	99	72.483	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.483	Lepisosteus_oculatus
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ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Mola_mola
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