EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000003846 (Gene tree)
Gene ID: 106959874
Gene Symbol: ftsj3
Alias: -
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8122 bases
Position: chrKQ546441.1:157052-165173
Accession: 106959874
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000002555	FtsJ	PF01728.19	8.8e-57	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000012840	-	3014	XM_015052704	ENSPLAP00000002555	852 (aa)	XP_014908190	UPI00072DBC4F

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000003846's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000003846's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.735	ENSG00000108592	FTSJ3	100	87.879	Homo_sapiens
ENSPLAG00000003846	ftsj3	78	81.490	ENSAPOG00000005543	ftsj3	92	82.619	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.412	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	100	60.941	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000003846	ftsj3	63	73.285	ENSACIG00000012880	ftsj3	100	68.648	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	80.706	ENSAOCG00000023196	ftsj3	98	80.824	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	80.585	ENSAPEG00000004250	ftsj3	99	80.824	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000003846	ftsj3	91	80.282	ENSATEG00000010069	ftsj3	98	80.051	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	90	54.023	ENSAPLG00000010362	-	99	53.342	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000003846	ftsj3	87	56.842	ENSACAG00000017930	FTSJ3	100	56.933	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.144	ENSANAG00000033774	FTSJ3	100	60.798	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000003846	ftsj3	95	78.261	ENSACLG00000019137	ftsj3	98	87.363	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000003846	ftsj3	100	74.007	ENSAMXG00000021571	ftsj3	96	75.265	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.888	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	100	61.294	Bos_taurus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.763	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	100	59.696	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.124	ENSCAFG00000012770	FTSJ3	100	60.987	Canis_familiaris
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.105	ENSCAFG00020026630	FTSJ3	100	61.131	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	62.620	ENSCHIG00000025676	FTSJ3	100	61.566	Capra_hircus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	94	57.037	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	99	56.119	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000003846	ftsj3	63	66.146	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	76	77.727	Cavia_aperea
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.137	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	100	60.844	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.545	ENSCCAG00000023533	-	97	66.667	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.246	ENSCATG00000018510	FTSJ3	100	59.930	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.476	ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	61.131	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	59.255	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	100	59.790	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	60.895	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	98	65.185	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	56	60.458	ENSCSAVG00000003607	-	71	58.434	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.456	ENSCANG00000042921	FTSJ3	100	60.140	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.283	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	100	60.702	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.283	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	100	60.702	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	78.029	ENSCSEG00000013468	ftsj3	98	76.815	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	88.599	ENSCVAG00000007484	ftsj3	99	88.599	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	73.747	ENSDARG00000104938	ftsj3	99	73.554	Danio_rerio
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	59.977	ENSDNOG00000002392	FTSJ3	100	58.899	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.317	ENSDORG00000004200	Ftsj3	100	61.484	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	59.651	ENSETEG00000019228	FTSJ3	100	59.977	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000003846	ftsj3	100	53.567	ENSEBUG00000007828	ftsj3	98	52.824	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.520	ENSEASG00005013565	FTSJ3	91	73.182	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.465	ENSECAG00000011995	FTSJ3	99	60.875	Equus_caballus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	72.320	ENSELUG00000013501	ftsj3	98	71.644	Esox_lucius
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	59.086	ENSFCAG00000013983	FTSJ3	100	59.835	Felis_catus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	63.152	ENSFALG00000013635	FTSJ3	99	62.222	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.577	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	100	60.331	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	100	89.227	ENSFHEG00000007639	ftsj3	99	88.757	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	51	79.819	ENSGMOG00000017184	ftsj3	98	79.859	Gadus_morhua
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	62.901	ENSGALG00000032993	FTSJ3	100	62.881	Gallus_gallus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	51	79.032	ENSGACG00000009841	ftsj3	98	78.302	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	61.547	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	99	61.005	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.854	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	100	60.329	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	81.807	ENSHBUG00000022331	ftsj3	98	81.690	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.410	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	100	61.647	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.621	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	100	61.647	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000003846	ftsj3	100	75.660	ENSHCOG00000018770	ftsj3	99	75.723	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	73.436	ENSIPUG00000024942	ftsj3	96	72.293	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.335	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	100	59.835	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.548	ENSJJAG00000012822	Ftsj3	100	60.689	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	83.790	ENSKMAG00000021997	ftsj3	98	83.019	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	78.878	ENSLBEG00000027142	ftsj3	98	78.842	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000003846	ftsj3	80	49.574	ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	48.864	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	67.637	ENSLOCG00000008979	ftsj3	99	68.464	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.602	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	100	60.613	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.242	ENSMFAG00000003764	FTSJ3	100	59.813	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.198	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	100	59.419	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.834	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	100	60.280	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	73.515	ENSMAMG00000006408	ftsj3	99	75.119	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	82.262	ENSMZEG00005001992	ftsj3	98	81.455	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.999	ENSMAUG00000015688	Ftsj3	100	60.468	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.548	ENSMICG00000045996	FTSJ3	100	60.681	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.203	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	100	60.188	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	75.532	ENSMMOG00000019522	ftsj3	91	76.824	Mola_mola
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	62.763	ENSMODG00000009901	FTSJ3	99	62.529	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.735	MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	60.981	Mus_caroli
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.973	ENSMUSG00000020706	Ftsj3	100	60.864	Mus_musculus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.210	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	100	60.864	Mus_pahari
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.592	MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	60.490	Mus_spretus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.575	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	100	61.059	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.170	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	100	60.471	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.364	ENSNGAG00000005899	Ftsj3	100	60.844	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000003846	ftsj3	96	78.490	ENSNBRG00000017453	ftsj3	99	87.368	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.164	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	100	59.672	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	58.235	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	99	57.362	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.285	ENSOPRG00000014985	FTSJ3	100	60.422	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.332	ENSODEG00000008167	FTSJ3	67	65.789	Octodon_degus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	82.283	ENSONIG00000001654	ftsj3	98	81.829	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.150	ENSOCUG00000004319	FTSJ3	100	60.118	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	79.078	ENSORLG00000005910	ftsj3	98	79.314	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	78.749	ENSORLG00020021255	ftsj3	92	85.204	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	79.433	ENSORLG00015018416	ftsj3	98	79.408	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	80.526	ENSOMEG00000014432	ftsj3	98	79.976	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	59.415	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	100	59.181	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.859	ENSOARG00000013637	FTSJ3	100	60.517	Ovis_aries
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.331	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	100	59.602	Pan_paniscus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	59.437	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	100	58.726	Panthera_pardus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	58.617	ENSPTIG00000012576	FTSJ3	100	59.117	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.377	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	100	59.766	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.242	ENSPANG00000020978	FTSJ3	100	59.930	Papio_anubis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	74.341	ENSPKIG00000012838	ftsj3	98	73.068	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000003846	ftsj3	59	79.545	ENSPSIG00000004632	FTSJ3	70	79.208	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	68.892	ENSPMGG00000012959	ftsj3	100	67.104	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	61.511	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	100	61.520	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	62.045	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	99	61.782	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	100	99.531	ENSPFOG00000023101	ftsj3	100	99.531	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000003846	ftsj3	100	99.297	ENSPMEG00000012692	ftsj3	100	99.297	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000003846	ftsj3	100	96.973	ENSPREG00000014874	ftsj3	100	96.973	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.714	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	100	59.320	Pongo_abelii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	60.238	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	99	60.024	Procavia_capensis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.808	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	100	60.798	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	60.093	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	100	60.187	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	95	78.719	ENSPNYG00000005108	ftsj3	98	88.298	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000003846	ftsj3	94	73.854	ENSPNAG00000022474	ftsj3	96	73.462	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	62.040	ENSRNOG00000009857	Ftsj3	99	61.566	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.005	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	66	64.675	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.242	ENSRROG00000045002	FTSJ3	66	64.851	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	35.650	YCL054W	-	61	49.003	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	59.767	ENSSBOG00000031794	FTSJ3	93	60.093	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.601	ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	61.047	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	72.057	ENSSFOG00015018053	ftsj3	98	71.665	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	77.327	ENSSMAG00000002863	ftsj3	99	78.205	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	82.220	ENSSDUG00000003385	ftsj3	98	81.081	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	82.220	ENSSLDG00000017970	ftsj3	98	80.846	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	91	60.948	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	99	60.563	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	81.412	ENSSPAG00000002390	ftsj3	98	81.294	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.473	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	100	60.353	Sus_scrofa
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	78.462	ENSTRUG00000017550	ftsj3	98	77.529	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000003846	ftsj3	99	75.117	ENSTNIG00000015549	ftsj3	100	75.822	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	56.718	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	100	57.311	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	59.810	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	100	60.563	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	81	86.567	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	95	86.567	Ursus_americanus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	62.000	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	100	61.059	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.457	ENSVVUG00000006106	FTSJ3	100	61.157	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000003846	ftsj3	95	56.517	ENSXETG00000006939	ftsj3	90	61.215	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	87.861	ENSXCOG00000002999	ftsj3	99	86.690	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	95.793	ENSXMAG00000018139	ftsj3	99	95.171	Xiphophorus_maculatus