EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000005232 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: GZF1
Alias: -
Full Name: GDNF inducible zinc finger protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4833 bases
Position: chrKQ545506.1:161017-165849
Accession: 106946440
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000003681	zf-C2H2	PF00096.26	6e-34	1	6
ENSPLAP00000003681	zf-C2H2	PF00096.26	6e-34	2	6
ENSPLAP00000003681	zf-C2H2	PF00096.26	6e-34	3	6
ENSPLAP00000003681	zf-C2H2	PF00096.26	6e-34	4	6
ENSPLAP00000003681	zf-C2H2	PF00096.26	6e-34	5	6
ENSPLAP00000003681	zf-C2H2	PF00096.26	6e-34	6	6
ENSPLAP00000021472	zf-C2H2	PF00096.26	8e-19	1	3
ENSPLAP00000021472	zf-C2H2	PF00096.26	8e-19	2	3
ENSPLAP00000021472	zf-C2H2	PF00096.26	8e-19	3	3
ENSPLAP00000003681	zf-met	PF12874.7	7e-09	1	1
ENSPLAP00000021472	zf-met	PF12874.7	0.00015	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000010910	GZF1-201	3831	-	ENSPLAP00000021472	705 (aa)	-	-
ENSPLAT00000010927	GZF1-202	1926	XM_015030746	ENSPLAP00000003681	641 (aa)	XP_014886232	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000005232	GZF1	53	38.624	ENSPLAG00000023537	-	78	36.364
ENSPLAG00000005232	GZF1	58	41.538	ENSPLAG00000021747	ZBTB14	60	41.538
ENSPLAG00000005232	GZF1	53	38.000	ENSPLAG00000021634	-	94	38.000
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	40.704	ENSPLAG00000004290	-	79	39.683
ENSPLAG00000005232	GZF1	57	40.559	ENSPLAG00000015083	-	91	40.559
ENSPLAG00000005232	GZF1	52	43.925	ENSPLAG00000019775	-	95	43.925
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	38.914	ENSPLAG00000021062	-	88	46.569
ENSPLAG00000005232	GZF1	52	43.816	ENSPLAG00000004735	-	95	42.692
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	46.154	ENSPLAG00000009651	-	95	46.154
ENSPLAG00000005232	GZF1	57	43.701	ENSPLAG00000015587	-	90	43.701
ENSPLAG00000005232	GZF1	54	40.088	ENSPLAG00000016585	-	87	40.088
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	40.529	ENSPLAG00000008557	-	72	40.529
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	47.059	ENSPLAG00000020196	-	90	47.059
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	42.500	ENSPLAG00000015617	-	70	42.500
ENSPLAG00000005232	GZF1	59	43.056	ENSPLAG00000019142	-	97	43.056
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	41.991	ENSPLAG00000010869	-	96	41.991
ENSPLAG00000005232	GZF1	59	42.500	ENSPLAG00000011410	zbtb24	50	42.500
ENSPLAG00000005232	GZF1	50	41.209	ENSPLAG00000008541	-	79	33.908
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	41.608	ENSPLAG00000002838	-	99	43.939
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	37.003	ENSPLAG00000017005	-	75	39.405
ENSPLAG00000005232	GZF1	58	42.604	ENSPLAG00000015958	-	73	41.117
ENSPLAG00000005232	GZF1	52	42.857	ENSPLAG00000006874	-	97	43.750
ENSPLAG00000005232	GZF1	54	41.772	ENSPLAG00000018156	-	94	42.135
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	44.720	ENSPLAG00000014185	-	98	45.128
ENSPLAG00000005232	GZF1	58	45.714	ENSPLAG00000010431	-	65	42.236
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	47.794	ENSPLAG00000004027	-	76	40.741
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	38.783	ENSPLAG00000004448	-	60	40.650
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	39.831	ENSPLAG00000004443	-	55	39.831
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	44.324	ENSPLAG00000000385	-	96	40.000
ENSPLAG00000005232	GZF1	50	39.200	ENSPLAG00000016372	-	95	39.200
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	38.298	ENSPLAG00000008386	-	90	38.710
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	36.741	ENSPLAG00000020760	-	80	36.656
ENSPLAG00000005232	GZF1	52	41.767	ENSPLAG00000008529	-	96	41.228
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	42.414	ENSPLAG00000015192	-	74	47.143
ENSPLAG00000005232	GZF1	52	34.155	ENSPLAG00000000470	-	65	35.119
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	39.526	ENSPLAG00000020864	-	77	39.526
ENSPLAG00000005232	GZF1	52	33.981	ENSPLAG00000014754	hic2	53	39.130
ENSPLAG00000005232	GZF1	57	36.546	ENSPLAG00000016561	zgc:113348	89	42.262
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	43.860	ENSPLAG00000010234	-	91	45.098
ENSPLAG00000005232	GZF1	72	40.566	ENSPLAG00000016823	-	94	46.471
ENSPLAG00000005232	GZF1	57	40.909	ENSPLAG00000018468	-	89	42.735
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	39.041	ENSPLAG00000019073	-	88	37.430
ENSPLAG00000005232	GZF1	59	36.471	ENSPLAG00000016662	-	90	36.471
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	37.545	ENSPLAG00000007581	-	90	37.629
ENSPLAG00000005232	GZF1	59	30.897	ENSPLAG00000017843	-	92	38.532
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ENSPLAG00000005232	GZF1	50	31.120	ENSPLAG00000010425	patz1	59	33.209
ENSPLAG00000005232	GZF1	54	34.448	ENSPLAG00000023509	-	84	34.448
ENSPLAG00000005232	GZF1	57	41.115	ENSPLAG00000011798	-	96	42.169
ENSPLAG00000005232	GZF1	63	36.290	ENSPLAG00000021831	zbtb16b	61	36.290
ENSPLAG00000005232	GZF1	53	43.269	ENSPLAG00000008691	-	68	43.269
ENSPLAG00000005232	GZF1	50	37.631	ENSPLAG00000001315	znf668	85	38.627
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	36.316	ENSPLAG00000006838	-	93	43.359
ENSPLAG00000005232	GZF1	54	36.719	ENSPLAG00000014148	prdm5	84	36.719
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	36.478	ENSPLAG00000020824	-	69	38.953
ENSPLAG00000005232	GZF1	57	41.115	ENSPLAG00000021050	-	96	41.786
ENSPLAG00000005232	GZF1	61	37.124	ENSPLAG00000021057	-	60	37.124
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ENSPLAG00000005232	GZF1	58	45.455	ENSPLAG00000010389	-	89	45.455
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	39.738	ENSPLAG00000005090	-	91	42.857
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ENSPLAG00000005232	GZF1	56	33.333	ENSPLAG00000009662	-	74	35.385
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	49.123	ENSPLAG00000014660	-	74	49.123
ENSPLAG00000005232	GZF1	59	41.767	ENSPLAG00000014105	-	96	44.624
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ENSPLAG00000005232	GZF1	54	40.171	ENSPLAG00000006191	-	61	42.453
ENSPLAG00000005232	GZF1	57	37.500	ENSPLAG00000016013	-	99	46.226
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ENSPLAG00000005232	GZF1	56	42.509	ENSPLAG00000016609	-	96	41.485
ENSPLAG00000005232	GZF1	59	36.562	ENSPLAG00000021218	-	74	45.059
ENSPLAG00000005232	GZF1	55	39.326	ENSPLAG00000004034	-	85	42.616
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	37.548	ENSPLAG00000016384	-	82	40.870
ENSPLAG00000005232	GZF1	61	42.138	ENSPLAG00000008610	-	67	42.138
ENSPLAG00000005232	GZF1	50	37.282	ENSPLAG00000016469	-	94	42.326
ENSPLAG00000005232	GZF1	92	35.789	ENSPLAG00000009179	zbtb41	76	39.024
ENSPLAG00000005232	GZF1	52	41.026	ENSPLAG00000021074	-	70	41.026
ENSPLAG00000005232	GZF1	90	35.510	ENSPLAG00000007917	zbtb47b	80	36.994
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	37.968	ENSPLAG00000010379	-	60	37.968
ENSPLAG00000005232	GZF1	54	39.493	ENSPLAG00000021080	-	65	39.493
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	40.942	ENSPLAG00000018436	-	95	47.024
ENSPLAG00000005232	GZF1	56	41.339	ENSPLAG00000004503	-	90	42.918
ENSPLAG00000005232	GZF1	51	49.091	ENSPLAG00000009568	-	98	49.091

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.069	ENSG00000125812	GZF1	90	46.512	Homo_sapiens
ENSPLAG00000005232	GZF1	92	68.484	ENSAPOG00000012930	GZF1	93	68.475	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	43.125	ENSAMEG00000009853	GZF1	94	35.983	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000005232	GZF1	94	67.044	ENSACIG00000004753	-	99	56.823	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000005232	GZF1	89	69.512	ENSAOCG00000024275	GZF1	91	68.641	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000005232	GZF1	94	71.129	ENSAPEG00000017195	GZF1	100	62.398	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000005232	GZF1	94	61.935	ENSATEG00000018374	GZF1	88	77.169	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.203	ENSANAG00000028240	GZF1	86	45.156	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000005232	GZF1	94	66.992	ENSACLG00000025866	GZF1	99	56.263	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000005232	GZF1	92	48.505	ENSAMXG00000017178	GZF1	99	39.888	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.226	ENSCJAG00000000733	GZF1	86	45.683	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.101	ENSCAFG00000005142	GZF1	86	45.768	Canis_familiaris
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.526	ENSTSYG00000028054	GZF1	86	44.584	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.268	ENSCAPG00000002173	GZF1	88	45.062	Cavia_aperea
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.426	ENSCPOG00000010790	GZF1	88	45.216	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.800	ENSCCAG00000035601	GZF1	86	44.811	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.044	ENSCATG00000039279	GZF1	86	45.625	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	44.838	ENSCLAG00000014714	GZF1	89	44.545	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.203	ENSCSAG00000011054	GZF1	86	45.070	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	43.577	ENSCPBG00000023418	-	56	44.133	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.288	ENSCPBG00000023415	GZF1	86	45.696	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.984	ENSCANG00000041260	GZF1	86	45.383	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.541	ENSCGRG00001003944	Gzf1	87	45.541	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	45.541	ENSCGRG00000012721	Gzf1	87	45.541	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000005232	GZF1	95	61.866	ENSCSEG00000002270	GZF1	99	52.621	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000005232	GZF1	94	78.689	ENSCVAG00000013068	-	99	72.878	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.334	ENSDORG00000011855	Gzf1	87	46.334	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000005232	GZF1	65	64.528	ENSEBUG00000004858	GZF1	77	54.795	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000005232	GZF1	94	50.369	ENSELUG00000013581	GZF1	88	49.727	Esox_lucius
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.334	ENSFCAG00000006484	GZF1	86	46.334	Felis_catus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	44.323	ENSFDAG00000019468	GZF1	92	44.073	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000005232	GZF1	94	77.325	ENSFHEG00000020498	GZF1	100	69.485	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	59.008	ENSGMOG00000011017	GZF1	100	59.536	Gadus_morhua
ENSPLAG00000005232	GZF1	93	47.551	ENSGALG00000053640	GZF1	86	46.994	Gallus_gallus
ENSPLAG00000005232	GZF1	100	89.144	ENSGAFG00000008725	GZF1	100	89.144	Gambusia_affinis
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