EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000006691 (Gene tree)
Gene ID: 106948396
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 183968 bases
Position: chrKQ545600.1:40981-224948
Accession: 106948396
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000022299	SYF2	PF08231.12	8.5e-55	1	1
ENSPLAP00000022282	SYF2	PF08231.12	1.1e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000008837	-	1186	XM_015034029	ENSPLAP00000022299	233 (aa)	XP_014889515	-
ENSPLAT00000008826	-	1209	-	ENSPLAP00000022282	289 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000006691's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000006691's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	ENSG00000117614	SYF2	90	80.275	Homo_sapiens
ENSPLAG00000006691	syf2	96	90.583	ENSAPOG00000001174	syf2	98	89.270	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000006691	syf2	84	80.513	ENSAMEG00000010134	-	100	80.513	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.824	ENSAMEG00000010115	-	99	75.309	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	ENSACIG00000023688	syf2	100	84.800	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	ENSAOCG00000022046	syf2	99	89.224	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000006691	syf2	93	88.426	ENSAOCG00000010912	syf2	67	88.426	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	ENSAPEG00000018858	syf2	90	89.270	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000006691	syf2	93	91.244	ENSATEG00000007745	syf2	98	89.700	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000006691	syf2	86	82.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000006691	syf2	71	68.263	ENSACAG00000026777	-	100	68.263	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000006691	syf2	88	81.863	ENSACAG00000013653	-	100	81.863	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000006691	syf2	92	81.395	ENSANAG00000032473	SYF2	98	74.180	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000006691	syf2	96	91.480	ENSACLG00000019916	syf2	98	89.700	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000006691	syf2	96	84.375	ENSAMXG00000004051	syf2	94	84.375	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.021	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	77.021	Bos_taurus
ENSPLAG00000006691	syf2	89	52.381	WBGene00019402	syf-2	90	51.659	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000006691	syf2	92	81.395	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.734	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000006691	syf2	90	76.555	ENSCAFG00000030331	-	92	76.555	Canis_familiaris
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	ENSCAFG00000012895	-	96	75.949	Canis_familiaris
ENSPLAG00000006691	syf2	78	71.429	ENSCAFG00020021094	-	95	71.429	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	ENSCAFG00020021091	-	96	75.949	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.371	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	74.390	Capra_hircus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.271	ENSTSYG00000005114	SYF2	97	76.271	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000006691	syf2	85	80.303	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	Cavia_aperea
ENSPLAG00000006691	syf2	94	80.734	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	80.734	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000006691	syf2	92	81.395	ENSCCAG00000022459	SYF2	98	74.590	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	ENSCATG00000026917	SYF2	99	75.417	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.778	ENSCLAG00000008474	SYF2	96	77.778	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000006691	syf2	94	79.358	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	79.358	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000006691	syf2	76	58.101	ENSCHOG00000005273	-	99	58.101	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000006691	syf2	96	81.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	79.399	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000006691	syf2	95	52.915	ENSCING00000003017	-	93	53.363	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000006691	syf2	91	50.935	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.935	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000006691	syf2	99	67.083	ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.083	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.447	ENSCGRG00001020733	Syf2	97	77.447	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000006691	syf2	84	81.633	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.818	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000006691	syf2	94	86.239	ENSCSEG00000000117	syf2	97	84.549	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000006691	syf2	96	95.516	ENSCVAG00000019543	syf2	99	92.017	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000006691	syf2	98	84.649	ENSDARG00000004706	syf2	96	84.649	Danio_rerio
ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.215	ENSDNOG00000047605	SYF2	97	77.215	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000006691	syf2	98	79.221	ENSDORG00000001274	Syf2	95	79.221	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000006691	syf2	96	55.310	FBgn0033556	CG12343	99	55.310	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000006691	syf2	89	66.667	ENSETEG00000015729	SYF2	99	62.996	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000006691	syf2	85	56.853	ENSEBUG00000015402	syf2	95	56.853	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.298	ENSEASG00005004224	-	96	78.298	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	69.957	ENSEASG00005004232	-	96	69.957	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	78.541	ENSECAG00000012023	-	95	76.891	Equus_caballus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.298	ENSECAG00000010440	-	98	78.298	Equus_caballus
ENSPLAG00000006691	syf2	74	65.698	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	66.471	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000006691	syf2	95	86.036	ENSELUG00000003465	syf2	93	86.425	Esox_lucius
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.788	ENSFCAG00000010324	-	78	78.788	Felis_catus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.119	ENSFCAG00000043095	-	96	77.119	Felis_catus
ENSPLAG00000006691	syf2	88	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	94	76.395	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.695	ENSFDAG00000008310	SYF2	97	76.695	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000006691	syf2	97	80.531	ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.531	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000006691	syf2	92	86.977	ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.977	Gadus_morhua
ENSPLAG00000006691	syf2	95	81.532	ENSGALG00000013639	SYF2	96	75.403	Gallus_gallus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	96.121	ENSGAFG00000019435	syf2	98	95.708	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000006691	syf2	95	89.189	ENSGACG00000007305	syf2	97	86.695	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000006691	syf2	96	81.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.828	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	80.275	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.700	ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.129	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.350	ENSHGLG00000014393	SYF2	96	77.350	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000006691	syf2	95	70.270	ENSHGLG00000004304	-	93	70.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.350	ENSHGLG00100014722	SYF2	96	77.350	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000006691	syf2	100	88.412	ENSHCOG00000012904	syf2	83	82.677	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000006691	syf2	98	85.088	ENSIPUG00000019859	syf2	95	85.088	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000006691	syf2	63	73.973	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000006691	syf2	85	80.905	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	91.739	ENSKMAG00000013856	syf2	97	91.739	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000006691	syf2	93	92.166	ENSLBEG00000014425	syf2	98	89.700	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.826	ENSLACG00000012064	SYF2	97	77.826	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000006691	syf2	99	85.217	ENSLOCG00000002728	syf2	92	85.217	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000006691	syf2	79	53.261	ENSLAFG00000030814	-	100	53.261	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000006691	syf2	100	78.112	ENSLAFG00000023150	-	96	77.872	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	75.417	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	79.358	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	75.417	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	75.417	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000006691	syf2	93	91.244	ENSMAMG00000010403	syf2	97	89.700	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.700	ENSMZEG00005006429	syf2	98	89.700	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000006691	syf2	85	81.910	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.541	ENSMAUG00000018974	Syf2	96	78.541	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000006691	syf2	85	80.905	ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.872	ENSMOCG00000022938	Syf2	97	77.872	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000006691	syf2	99	87.826	ENSMMOG00000002396	syf2	98	86.809	Mola_mola
ENSPLAG00000006691	syf2	95	75.893	ENSMODG00000013951	-	98	75.893	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000006691	syf2	99	87.879	ENSMALG00000010706	syf2	96	88.312	Monopterus_albus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.541	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	96	78.541	Mus_caroli
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.541	ENSMUSG00000028821	Syf2	96	78.541	Mus_musculus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.541	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	96	78.541	Mus_pahari
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.541	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	96	78.541	Mus_spretus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	75.630	ENSMPUG00000015801	-	97	76.050	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	ENSMPUG00000015802	-	96	75.847	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.253	ENSMLUG00000001885	SYF2	100	72.332	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.253	ENSNGAG00000007912	Syf2	93	77.253	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000006691	syf2	100	79.747	ENSNBRG00000010720	syf2	97	79.747	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	80.275	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000006691	syf2	98	77.489	ENSOPRG00000012870	SYF2	95	77.489	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000006691	syf2	99	67.521	ENSODEG00000014338	-	100	65.966	Octodon_degus
ENSPLAG00000006691	syf2	95	78.378	ENSODEG00000017664	-	93	78.378	Octodon_degus
ENSPLAG00000006691	syf2	96	91.480	ENSONIG00000008213	syf2	98	89.700	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000006691	syf2	87	81.188	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.350	ENSOCUG00000013050	SYF2	96	77.350	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	ENSORLG00000028820	syf2	100	89.270	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000006691	syf2	98	90.393	ENSORLG00020018333	syf2	99	88.511	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000006691	syf2	98	90.830	ENSORLG00015014665	syf2	99	88.936	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000006691	syf2	97	91.556	ENSOMEG00000013911	syf2	99	88.085	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.205	ENSOGAG00000009962	SYF2	96	78.205	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.949	ENSOARG00000006348	-	96	75.949	Ovis_aries
ENSPLAG00000006691	syf2	84	54.359	ENSOARG00000006269	-	100	54.359	Ovis_aries
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	80.275	Pan_paniscus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.788	ENSPPRG00000001638	-	93	77.311	Panthera_pardus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.119	ENSPPRG00000001651	-	96	77.119	Panthera_pardus
ENSPLAG00000006691	syf2	92	81.860	ENSPTIG00000005711	-	80	81.193	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.119	ENSPTIG00000007036	-	96	77.119	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	80.275	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	ENSPANG00000008139	SYF2	99	75.417	Papio_anubis
ENSPLAG00000006691	syf2	95	83.258	ENSPKIG00000008130	syf2	94	83.258	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000006691	syf2	98	78.970	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	76.543	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000006691	syf2	99	85.345	ENSPMGG00000008755	syf2	94	82.305	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.447	ENSPEMG00000008283	Syf2	97	77.447	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000006691	syf2	95	80.631	ENSPCIG00000014235	SYF2	95	77.637	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	99.569	ENSPFOG00000004116	syf2	99	97.500	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000006691	syf2	99	94.828	ENSPMEG00000011684	syf2	99	94.348	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000006691	syf2	99	97.414	ENSPREG00000003009	syf2	98	96.996	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000006691	syf2	94	80.275	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	80.275	Pongo_abelii
ENSPLAG00000006691	syf2	100	53.814	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	52.263	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000006691	syf2	99	69.231	ENSPVAG00000005841	SYF2	96	69.231	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000006691	syf2	96	91.480	ENSPNYG00000004979	syf2	98	89.700	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000006691	syf2	99	83.043	ENSPNAG00000015570	syf2	97	83.043	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.541	ENSRNOG00000060597	Syf2	96	78.541	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000006691	syf2	99	73.333	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	73.333	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	ENSRROG00000001347	SYF2	99	75.417	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	ENSSBOG00000020184	SYF2	98	74.180	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000006691	syf2	88	80.583	ENSSHAG00000007152	-	100	80.583	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000006691	syf2	95	79.279	ENSSHAG00000015630	-	92	76.824	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000006691	syf2	95	84.615	ENSSFOG00015023647	syf2	93	84.615	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	86.266	ENSSMAG00000009867	syf2	98	86.266	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000006691	syf2	94	91.284	ENSSDUG00000013072	syf2	98	88.412	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000006691	syf2	94	91.284	ENSSLDG00000012677	syf2	98	88.412	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000006691	syf2	98	60.345	ENSSARG00000012889	SYF2	95	60.345	Sorex_araneus
ENSPLAG00000006691	syf2	98	81.034	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.189	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	88.841	ENSSPAG00000009626	syf2	98	88.841	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000006691	syf2	98	77.155	ENSSSCG00000037481	SYF2	95	77.155	Sus_scrofa
ENSPLAG00000006691	syf2	72	52.353	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	51.429	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000006691	syf2	97	86.784	ENSTRUG00000001499	syf2	91	87.168	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000006691	syf2	95	86.937	ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.937	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000006691	syf2	100	58.798	ENSTBEG00000017370	SYF2	95	58.798	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.371	ENSTTRG00000003550	SYF2	97	76.793	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.253	ENSUAMG00000002897	SYF2	93	77.253	Ursus_americanus
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	ENSUMAG00000013108	SYF2	93	77.253	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.371	ENSVPAG00000005705	SYF2	97	76.371	Vicugna_pacos
ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	ENSVVUG00000027175	-	96	75.949	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000006691	syf2	88	80.000	ENSVVUG00000027181	-	96	73.984	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.966	ENSXETG00000022797	syf2	94	75.966	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000006691	syf2	99	95.259	ENSXMAG00000022698	syf2	98	94.850	Xiphophorus_maculatus