EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000006738 (Gene tree)
Gene ID: 106949293
Gene Symbol: snrpd1
Alias: -
Full Name: small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2613 bases
Position: chrKQ545650.1:181806-184418
Accession: 106949293
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000004927	LSM	PF01423.22	4.6e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000008792	-	342	XM_015035443	ENSPLAP00000004927	113 (aa)	XP_014890929	UPI0004439FFF

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000006738's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000006738's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSG00000167088	SNRPD1	81	95.833	Homo_sapiens
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSAPOG00000019446	snrpd1	65	94.958	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	93.617	ENSAMEG00000002576	SNRPD1	80	93.617	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000006738	snrpd1	94	94.643	ENSACIG00000011263	snrpd1	100	94.643	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSAOCG00000007406	snrpd1	100	94.958	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000006738	snrpd1	94	94.643	ENSAPEG00000012539	SNRPD1	100	94.643	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	94.792	ENSAPEG00000014961	snrpd1	80	94.792	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSATEG00000014399	snrpd1	100	94.958	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	81	95.652	ENSAPLG00000012256	SNRPD1	77	95.652	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSACAG00000006364	SNRPD1	81	95.833	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSANAG00000025641	SNRPD1	81	95.833	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000006738	snrpd1	94	94.643	ENSACLG00000017406	snrpd1	100	94.643	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.118	ENSAMXG00000004589	snrpd1	100	94.118	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSBTAG00000008292	SNRPD1	81	95.833	Bos_taurus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	91.667	ENSBTAG00000047266	-	81	91.667	Bos_taurus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	93.750	ENSBTAG00000012376	-	72	93.750	Bos_taurus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	90.426	ENSBTAG00000055316	-	81	90.426	Bos_taurus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	78	78.409	WBGene00004916	snr-3	76	73.958	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCJAG00000042955	SNRPD1	81	95.833	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCAFG00000018247	SNRPD1	81	95.833	Canis_familiaris
ENSPLAG00000006738	snrpd1	84	95.789	ENSCAFG00020015914	SNRPD1	74	95.789	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	92.708	ENSCHIG00000005557	SNRPD1	79	94.681	Capra_hircus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSTSYG00000030028	SNRPD1	81	95.833	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000006738	snrpd1	81	94.565	ENSCAPG00000008103	SNRPD1	79	94.565	Cavia_aperea
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCPOG00000004679	SNRPD1	81	95.833	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	94.792	ENSCCAG00000020611	-	81	94.792	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCCAG00000032658	SNRPD1	81	95.833	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	92.708	ENSCCAG00000016652	-	81	92.708	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	91.667	ENSCCAG00000005390	-	81	91.667	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCATG00000039978	SNRPD1	81	95.833	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCLAG00000008691	SNRPD1	81	95.833	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCSAG00000017654	SNRPD1	81	95.833	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCPBG00000023143	SNRPD1	81	95.833	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000006738	snrpd1	76	84.884	ENSCING00000024100	-	69	84.884	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	77	83.908	ENSCSAVG00000004578	-	94	68.644	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCGRG00001021055	-	81	95.833	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	71.875	ENSCGRG00001009945	-	85	71.875	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	71.875	ENSCGRG00000006224	-	85	71.875	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSCGRG00000000490	-	81	95.833	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000006738	snrpd1	96	99.083	ENSCSEG00000018141	snrpd1	92	99.083	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSCVAG00000000534	snrpd1	100	94.958	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.118	ENSDARG00000011648	snrpd1	100	94.118	Danio_rerio
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSDNOG00000040310	SNRPD1	81	95.833	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSDORG00000008349	Snrpd1	81	95.833	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	80.851	FBgn0261933	SmD1	76	80.851	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000006738	snrpd1	58	93.846	ENSETEG00000011689	SNRPD1	55	93.846	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	91.667	ENSEBUG00000003170	snrpd1	93	91.489	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000006738	snrpd1	79	95.506	ENSEASG00005002433	SNRPD1	79	95.506	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	79	95.506	ENSECAG00000014373	SNRPD1	79	95.506	Equus_caballus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	79	95.506	ENSEEUG00000004987	SNRPD1	100	95.506	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	88	95.000	ENSELUG00000000088	snrpd1	79	97.872	Esox_lucius
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSFCAG00000012352	SNRPD1	81	95.833	Felis_catus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	79	95.506	ENSFALG00000002646	SNRPD1	79	95.506	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.118	ENSGMOG00000015607	snrpd1	100	94.118	Gadus_morhua
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSGALG00000041334	SNRPD1	81	95.833	Gallus_gallus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSGAFG00000011171	snrpd1	100	94.958	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.118	ENSGACG00000005201	SNRPD1	100	94.118	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSGAGG00000011197	SNRPD1	81	95.833	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	90.625	ENSGGOG00000026706	-	80	90.625	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSGGOG00000041053	SNRPD1	81	95.833	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSHBUG00000003236	snrpd1	100	94.958	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSHGLG00000007152	SNRPD1	81	95.833	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSHGLG00100008618	SNRPD1	81	95.833	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSIPUG00000003576	snrpd1	100	94.958	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSSTOG00000000485	SNRPD1	81	95.833	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSJJAG00000017698	Snrpd1	81	95.833	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSKMAG00000005987	snrpd1	100	94.958	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSLBEG00000003327	snrpd1	100	94.958	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSLACG00000001955	SNRPD1	81	95.833	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	94.681	ENSLOCG00000002003	snrpd1	80	94.681	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	84	93.684	ENSLAFG00000005819	SNRPD1	81	93.684	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSMFAG00000042080	SNRPD1	81	95.833	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	81	95.604	ENSMMUG00000003992	SNRPD1	78	95.604	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSMNEG00000041296	SNRPD1	81	95.833	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSMLEG00000028659	SNRPD1	81	95.833	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSMAMG00000012971	snrpd1	100	94.958	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSMZEG00005004685	snrpd1	100	94.958	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000006738	snrpd1	81	95.652	ENSMGAG00000011598	SNRPD1	76	95.652	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	79.167	ENSMAUG00000016467	-	86	79.167	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	86	90.722	ENSMAUG00000006829	-	59	95.556	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	79.167	ENSMAUG00000016502	-	86	79.167	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSMICG00000044066	SNRPD1	81	95.833	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSMOCG00000017367	Snrpd1	81	95.833	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSMMOG00000019089	snrpd1	100	94.958	Mola_mola
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSMODG00000021487	SNRPD1	81	95.833	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSMALG00000014459	snrpd1	100	94.958	Monopterus_albus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	MGP_CAROLIEiJ_G0021994	Snrpd1	81	95.833	Mus_caroli
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSMUSG00000002477	Snrpd1	81	95.833	Mus_musculus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	MGP_PahariEiJ_G0018731	Snrpd1	81	95.833	Mus_pahari
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	MGP_SPRETEiJ_G0022910	Snrpd1	81	95.833	Mus_spretus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	93.617	ENSMPUG00000005567	-	80	93.617	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000006738	snrpd1	90	95.098	ENSMPUG00000020041	-	86	95.098	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	94.681	ENSMLUG00000009124	SNRPD1	73	94.681	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSNGAG00000023946	Snrpd1	81	95.833	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	100.000	ENSNBRG00000012119	snrpd1	78	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	92.708	ENSNLEG00000031430	SNRPD1	80	92.708	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSODEG00000005764	SNRPD1	81	95.833	Octodon_degus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSONIG00000002486	snrpd1	100	94.958	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	87	86.735	ENSOANG00000004638	-	82	86.735	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	93.617	ENSOCUG00000023761	-	80	93.617	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	90	95.098	ENSOCUG00000014399	-	86	95.098	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	94	94.643	ENSORLG00000012516	snrpd1	100	94.643	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSORLG00020005743	snrpd1	100	94.958	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSORLG00015013402	snrpd1	100	94.958	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSOMEG00000011571	snrpd1	100	94.958	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	93.617	ENSOGAG00000007833	SNRPD1	79	93.617	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	96.460	ENSOARG00000003413	-	85	96.460	Ovis_aries
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPPAG00000042593	SNRPD1	81	95.833	Pan_paniscus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPPRG00000002399	SNRPD1	81	95.833	Panthera_pardus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	90	67.647	ENSPPRG00000005009	-	82	67.647	Panthera_pardus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	81	95.604	ENSPTIG00000013206	SNRPD1	80	95.604	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000006738	snrpd1	86	94.845	ENSPTRG00000009909	SNRPD1	81	95.833	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000006738	snrpd1	90	90.196	ENSPTRG00000050159	-	87	90.196	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPANG00000023478	SNRPD1	81	95.833	Papio_anubis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	93.277	ENSPKIG00000003985	SNRPD1	100	93.277	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000006738	snrpd1	94	93.750	ENSPKIG00000021610	snrpd1	100	93.750	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSPMGG00000001862	snrpd1	100	94.958	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPEMG00000014773	-	81	95.833	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000006738	snrpd1	90	82.692	ENSPMAG00000003938	-	85	82.692	Petromyzon_marinus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPCIG00000020320	SNRPD1	81	95.833	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	100.000	ENSPFOG00000012448	SNRPD1	100	100.000	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	100.000	ENSPMEG00000021942	snrpd1	100	100.000	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSPREG00000007094	snrpd1	100	94.958	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPPYG00000025874	SNRPD1	81	95.833	Pongo_abelii
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPCOG00000013327	SNRPD1	81	95.833	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSPVAG00000005511	SNRPD1	64	95.833	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	93.277	ENSPNAG00000017824	snrpd1	100	93.277	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSRNOG00000013714	Snrpd1	81	95.833	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSRBIG00000022996	SNRPD1	81	95.833	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSRROG00000027640	SNRPD1	81	95.833	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSSBOG00000020998	SNRPD1	81	95.833	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSSHAG00000011791	SNRPD1	81	95.833	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.118	ENSSFOG00015022253	-	100	94.118	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.118	ENSSFOG00015008809	-	100	94.118	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.118	ENSSMAG00000008765	snrpd1	100	94.118	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	97	93.103	ENSSDUG00000010521	snrpd1	98	93.103	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSSLDG00000011858	snrpd1	100	94.958	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	59	97.015	ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	Sorex_araneus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSSPUG00000002824	SNRPD1	81	95.833	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	94	94.643	ENSSPAG00000015229	snrpd1	100	94.643	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSSSCG00000003701	SNRPD1	81	95.833	Sus_scrofa
ENSPLAG00000006738	snrpd1	81	95.652	ENSTGUG00000005095	SNRPD1	77	95.652	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000006738	snrpd1	94	92.857	ENSTRUG00000008977	snrpd1	100	92.857	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000006738	snrpd1	71	95.000	ENSTNIG00000001224	snrpd1	77	95.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	58	93.846	ENSTBEG00000013776	SNRPD1	74	93.846	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000006738	snrpd1	81	95.652	ENSTTRG00000002654	SNRPD1	80	95.652	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	83	95.745	ENSUAMG00000013431	SNRPD1	94	95.745	Ursus_americanus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSUMAG00000019740	SNRPD1	81	95.833	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	95.833	ENSVPAG00000010056	SNRPD1	64	95.833	Vicugna_pacos
ENSPLAG00000006738	snrpd1	79	95.506	ENSVVUG00000004009	SNRPD1	79	95.506	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000006738	snrpd1	85	93.750	ENSXETG00000027354	snrpd1	81	93.750	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSXCOG00000020108	snrpd1	100	94.958	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000006738	snrpd1	100	94.958	ENSXMAG00000003368	snrpd1	100	94.958	Xiphophorus_maculatus