EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000007532 (Gene tree)
Gene ID: 106955699
Gene Symbol: htatsf1
Alias: -
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5554 bases
Position: chrKQ546076.1:258873-264426
Accession: 106955699
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000005589	RRM_1	PF00076.22	1.4e-14	1	1
ENSPLAP00000005593	RRM_1	PF00076.22	1.6e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000007683	-	2271	XM_015046016	ENSPLAP00000005593	459 (aa)	XP_014901502	UPI00072E0634
ENSPLAT00000007677	-	2673	XM_015046017	ENSPLAP00000005589	444 (aa)	XP_014901503	UPI00072E5993

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.757	ENSG00000102241	HTATSF1	100	60.300	Homo_sapiens
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	82.301	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	82.301	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	79.476	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	81.938	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	81.046	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	81.699	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	81.798	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	82.675	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000007532	htatsf1	94	81.100	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	81.100	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	91	62.233	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	62.143	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000007532	htatsf1	81	61.247	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.603	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	80.396	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	81.278	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	69.348	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	69.848	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	63.054	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	50	63.547	Bos_taurus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	90	60.341	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	52	60.837	Bos_taurus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	63.054	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	50	63.547	Bos_taurus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	78	38.418	WBGene00022025	Y65B4A.1	78	38.227	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000007532	htatsf1	81	63.315	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	64.083	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.315	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	52	62.315	Canis_familiaris
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.315	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	50	62.315	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	63.300	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	51	63.793	Capra_hircus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.779	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	51	62.808	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000007532	htatsf1	81	62.703	ENSCCAG00000025329	-	57	61.576	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	81	63.587	ENSCCAG00000022701	-	50	64.341	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.963	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	63.728	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000007532	htatsf1	92	60.427	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.900	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.963	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	63.728	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	61.707	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	62.144	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000007532	htatsf1	87	46.467	ENSCING00000005914	-	88	46.196	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000007532	htatsf1	90	39.323	ENSCSAVG00000000371	-	99	38.689	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.492	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	64.232	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.808	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	50	62.808	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	88.288	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	88.288	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	68.202	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	68.421	Danio_rerio
ENSPLAG00000007532	htatsf1	87	44.529	FBgn0037081	barc	69	44.784	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000007532	htatsf1	90	55.257	ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.676	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	62.876	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	65.106	Esox_lucius
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	61.576	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	52	61.576	Felis_catus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	59.957	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	59.957	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000007532	htatsf1	97	60.592	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	61.827	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	89.462	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.462	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	76.374	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	76.374	Gadus_morhua
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	60.566	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.917	Gallus_gallus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	95.270	ENSGAFG00000003041	htatsf1	99	94.655	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	78.300	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	78.300	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.757	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	64.484	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	80.617	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	81.498	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	70.946	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	71.847	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	65.401	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	67.161	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	63.145	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	53	63.145	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	84.855	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	84.855	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	77.753	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.462	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	61.419	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.419	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	45.435	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.378	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	86	63.706	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.706	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.963	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	63.728	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.963	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	63.728	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.963	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	63.728	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.963	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	50	63.728	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	78.781	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	78.781	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	80.617	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	81.498	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000007532	htatsf1	95	61.009	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	61.098	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.808	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	62.808	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	91	60.382	ENSMICG00000009348	HTATSF1	53	60.382	Microcebus_murinus
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ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.299	ENSMOCG00000022370	-	50	62.563	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	77.354	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	77.354	Mola_mola
ENSPLAG00000007532	htatsf1	57	61.654	ENSMODG00000000199	-	99	61.654	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	61.623	ENSMODG00000014087	-	98	61.488	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	77.728	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	77.728	Monopterus_albus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.636	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.377	Mus_caroli
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ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	62.133	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	50	62.944	Mus_spretus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.103	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	50	62.103	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000007532	htatsf1	87	60.354	ENSMLUG00000009234	-	52	60.354	Myotis_lucifugus
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ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	80.310	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	81.195	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.492	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	50	64.232	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000007532	htatsf1	87	65.152	ENSMEUG00000004133	-	91	65.152	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	82.159	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	82.819	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	91	59.286	ENSOANG00000011674	-	99	59.286	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	61.481	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	51	61.481	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	77.093	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	77.313	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	76.754	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.974	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	76.991	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.212	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	79.029	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.029	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	63.547	ENSOARG00000011215	-	50	63.793	Ovis_aries
ENSPLAG00000007532	htatsf1	88	60.902	ENSOARG00000000481	-	50	60.902	Ovis_aries
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.757	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	50	64.484	Pan_paniscus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.069	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	52	62.562	Panthera_pardus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.757	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	50	64.484	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	67.982	ENSPKIG00000024852	htatsf1	100	67.834	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000007532	htatsf1	75	67.052	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	97	67.826	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	74.222	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	74.222	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.539	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	63.980	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSPLAG00000007532	htatsf1	96	61.187	ENSPCIG00000030173	-	96	61.187	Phascolarctos_cinereus
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ENSPLAG00000007532	htatsf1	85	58.031	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	53	57.431	Procavia_capensis
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