EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000009910 (Gene tree)
Gene ID: 106947716
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC106947716
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7889 bases
Position: chrKQ545568.1:292617-300505
Accession: 106947716
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000007541	Isy1	PF06246.12	1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000004388	-	1689	XM_015032905	ENSPLAP00000007541	304 (aa)	XP_014888391	UPI00072E7101

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000009910's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000009910's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	63.810	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	63.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	58.442	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	58.442	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	57.980	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	57.980	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	61.783	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	61.783	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	60.390	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	60.390	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	59.609	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	59.810	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	47.697	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	47.697	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	52.077	ENSCSEG00000007482	-	99	52.077	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	70.227	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	70.227	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	47.841	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	47.841	Danio_rerio
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	48.428	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	48.428	Esox_lucius
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	80.130	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	80.130	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	76	92.241	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	92.241	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	59.283	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.494	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	48.185	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	100	48.185	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	67.857	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	67.857	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	52.203	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	52.824	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	35.583	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	100	35.583	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	45.695	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	100	45.364	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	61.392	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	61.392	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	59.609	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	59.810	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	57.705	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	57.705	Mola_mola
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	58.387	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.289	Monopterus_albus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	55.116	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	55.449	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	58.224	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	58.466	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	59.554	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	59.554	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	58.786	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	58.786	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	59.048	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	59.048	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	55.911	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	56.051	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	42.384	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	100	42.384	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	50.654	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	99	50.654	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	99.342	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	99.342	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	97.697	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	97.697	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	74.013	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	74.013	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	59.609	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.810	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	49.508	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	100	49.508	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	99	44.625	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	100	44.625	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	96	57.383	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	99	57.605	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	61.250	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	61.250	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	60.625	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	60.625	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	67.314	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	67.314	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	54.605	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	54.605	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	67.105	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	67.105	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	91.447	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	91.447	Xiphophorus_maculatus