EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000011534 (Gene tree)
Gene ID: 106960996
Gene Symbol: ago4
Alias: -
Full Name: protein argonaute-4
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28119 bases
Position: chrKQ546567.1:111390-139508
Accession: 106960996
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000024905	PAZ	PF02170.22	6.1e-28	1	1
ENSPLAP00000008854	PAZ	PF02170.22	6.7e-28	1	1
ENSPLAP00000024905	Piwi	PF02171.17	2.7e-106	1	1
ENSPLAP00000008854	Piwi	PF02171.17	1.1e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000002209	-	2115	-	ENSPLAP00000024905	704 (aa)	-	-
ENSPLAT00000002186	-	5603	XM_015054434	ENSPLAP00000008854	863 (aa)	XP_014909920	UPI0003B38D14

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000011534's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000011534's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000011534	ago4	98	81.187	ENSPLAG00000017432	-	100	77.019
ENSPLAG00000011534	ago4	98	85.673	ENSPLAG00000002848	ago3a	100	79.682
ENSPLAG00000011534	ago4	98	83.792	ENSPLAG00000007911	ago2	97	79.720
ENSPLAG00000011534	ago4	98	87.844	ENSPLAG00000002824	ago1	99	87.699

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSG00000134698	AGO4	100	97.567	Homo_sapiens
ENSPLAG00000011534	ago4	96	98.449	ENSAPOG00000023867	ago4	99	98.449	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	98.408	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	97.096	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000011534	ago4	98	98.003	ENSACIG00000014548	ago4	100	99.874	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	92.725	ENSAPEG00000022426	ago4	100	95.214	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.513	ENSATEG00000006717	ago4	100	98.509	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.757	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	97.757	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000011534	ago4	98	98.263	ENSACAG00000017275	AGO4	99	96.516	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	ENSANAG00000031428	AGO4	100	97.451	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	ENSACLG00000005181	ago4	100	98.627	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.513	ENSAMXG00000010318	ago4	100	98.513	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	96.628	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.628	Bos_taurus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	97.567	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.859	Canis_familiaris
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	97.451	Capra_hircus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.773	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	97.773	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000011534	ago4	91	98.635	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	93.541	Cavia_aperea
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	95.128	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	97.567	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.674	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.538	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	97.538	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	97.567	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000011534	ago4	81	98.760	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	98.760	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.550	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	97.550	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.550	ENSCANG00000016914	AGO4	100	97.550	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	96.987	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	96.987	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.186	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	97.186	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000011534	ago4	98	91.181	ENSCSEG00000010696	ago4	100	93.467	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000011534	ago4	100	99.768	ENSDARG00000100854	ago4	100	99.768	Danio_rerio
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	97.451	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSDORG00000008933	Ago4	100	97.567	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000011534	ago4	63	96.863	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.044	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSEASG00005012079	AGO4	100	97.567	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSECAG00000024686	AGO4	100	97.567	Equus_caballus
ENSPLAG00000011534	ago4	79	94.035	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	94.035	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.836	ENSELUG00000023873	ago4	100	97.836	Esox_lucius
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	97.451	Felis_catus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.773	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	97.773	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000011534	ago4	97	90.550	ENSFHEG00000019658	ago4	100	90.550	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	99.069	ENSGMOG00000009544	ago4	99	99.069	Gadus_morhua
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSGALG00000039713	AGO4	100	97.859	Gallus_gallus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	ENSGAFG00000017239	ago4	100	98.627	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000011534	ago4	99	99.419	ENSGACG00000002683	ago4	99	99.419	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	96.862	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.859	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000011534	ago4	99	93.503	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	94.360	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	ENSHBUG00000001525	ago4	100	98.627	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	97.567	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.765	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	97.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.284	ENSHCOG00000003725	ago4	100	98.284	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.513	ENSIPUG00000015600	ago4	100	98.513	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.564	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	97.564	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000011534	ago4	53	95.349	ENSJJAG00000003401	-	100	97.416	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.741	ENSKMAG00000018602	ago4	100	98.741	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.727	ENSLBEG00000010670	ago4	100	97.727	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.451	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.055	ENSLOCG00000000584	ago4	100	98.055	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.278	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	97.253	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	97.567	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.326	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	96.825	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	97.567	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.655	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	97.655	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.398	ENSMAMG00000003874	ago4	100	98.398	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	ENSMZEG00005026346	ago4	100	98.627	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.200	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	97.200	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000011534	ago4	83	97.213	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	96.898	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.424	ENSMICG00000033507	AGO4	99	97.424	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.103	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	97.103	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000011534	ago4	98	99.710	ENSMMOG00000013473	ago4	100	98.363	Mola_mola
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.683	ENSMODG00000017888	AGO4	100	97.683	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.666	ENSMALG00000011797	ago4	99	97.666	Monopterus_albus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	96.756	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	96.756	Mus_caroli
ENSPLAG00000011534	ago4	100	96.524	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	96.524	Mus_musculus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	96.060	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	96.060	Mus_pahari
ENSPLAG00000011534	ago4	100	96.524	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	96.524	Mus_spretus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	97.859	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000011534	ago4	98	98.266	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	97.086	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.773	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	97.773	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	ENSNBRG00000013492	ago4	100	98.627	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.655	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	97.655	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000011534	ago4	89	96.605	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.605	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000011534	ago4	99	90.504	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	90.504	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.744	Octodon_degus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	ENSONIG00000013603	ago4	100	98.627	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSOANG00000002082	AGO4	100	97.985	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	97.451	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.513	ENSORLG00000009865	ago4	92	98.513	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.513	ENSORLG00020016978	ago4	92	98.513	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.513	ENSORLG00015008800	ago4	92	98.513	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.513	ENSOMEG00000006399	ago4	100	98.513	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000011534	ago4	98	98.119	ENSOGAG00000004233	-	100	96.871	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000011534	ago4	100	88.992	ENSOGAG00000027107	-	100	88.992	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.685	ENSOARG00000019568	AGO4	98	96.632	Ovis_aries
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.655	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	97.655	Pan_paniscus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	97.451	Panthera_pardus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.655	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	97.655	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	97.567	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSPANG00000007232	AGO4	100	97.859	Papio_anubis
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.055	ENSPKIG00000022598	ago4	100	98.055	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.550	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	97.550	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000011534	ago4	98	98.003	ENSPMGG00000023325	ago4	100	99.748	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	86.474	ENSPEMG00000022651	-	97	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.683	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	97.683	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.741	ENSPFOG00000001935	ago4	100	98.741	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.741	ENSPMEG00000005049	ago4	100	98.741	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.741	ENSPREG00000010315	ago4	100	98.741	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.655	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	97.655	Pongo_abelii
ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.541	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	97.541	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000011534	ago4	87	96.970	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	96.970	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	ENSPNYG00000002089	ago4	100	98.627	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000011534	ago4	100	99.189	ENSPNAG00000005191	ago4	100	99.189	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000011534	ago4	83	95.477	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	96.817	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	96.592	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	96.825	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSRROG00000035783	AGO4	100	97.859	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	97.622	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000011534	ago4	99	96.987	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.987	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.284	ENSSFOG00015022028	ago4	100	98.385	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	95.866	ENSSMAG00000000808	ago4	93	97.628	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.508	ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.244	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000011534	ago4	98	98.003	ENSSLDG00000021841	ago4	100	99.874	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000011534	ago4	78	97.257	ENSSARG00000011504	AGO4	79	97.257	Sorex_araneus
ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.335	ENSSPUG00000000889	AGO4	100	97.335	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	92.909	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	92.093	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.169	ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.169	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000011534	ago4	99	99.533	ENSTNIG00000006331	ago4	99	99.533	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000011534	ago4	78	97.143	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	97.143	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000011534	ago4	99	94.021	ENSTTRG00000015086	AGO4	99	94.021	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSUAMG00000027156	-	100	97.859	Ursus_americanus
ENSPLAG00000011534	ago4	99	95.354	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	94.179	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000011534	ago4	98	96.291	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	97.101	Vicugna_pacos
ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	ENSVVUG00000000465	-	100	97.859	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000011534	ago4	100	84.357	ENSXETG00000009664	ago4	100	84.357	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.741	ENSXMAG00000016657	ago4	100	98.741	Xiphophorus_maculatus