EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000014280 (Gene tree)
Gene ID: 106942715
Gene Symbol: mtrf1
Alias: -
Full Name: peptide chain release factor 1%2C mitochondrial-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7579 bases
Position: chrKQ549596.1:5521-13099
Accession: 106942715
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000026480	RF-1	PF00472.20	4.2e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000018541	-	4465	XM_015026047	ENSPLAP00000026480	439 (aa)	XP_014881533	UPI00072ED666

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000014280	mtrf1	85	43.850	ENSPLAG00000014010	mtrf1l	86	43.850

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSG00000120662	MTRF1	85	55.526	Homo_sapiens
ENSPLAG00000014280	mtrf1	88	76.471	ENSAPOG00000010181	mtrf1	95	76.471	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.168	ENSAMEG00000008696	MTRF1	85	56.168	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000014280	mtrf1	55	81.452	ENSACIG00000001495	mtrf1	100	81.452	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	97	76.279	ENSAOCG00000002832	mtrf1	96	76.279	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000014280	mtrf1	97	75.814	ENSAPEG00000014844	mtrf1	96	75.814	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000014280	mtrf1	91	74.074	ENSATEG00000017403	mtrf1	97	74.074	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	96	51.667	ENSAPLG00000009317	MTRF1	95	51.667	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000014280	mtrf1	92	52.184	ENSACAG00000000897	MTRF1	93	52.184	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	52.231	ENSANAG00000023063	-	84	52.231	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000014280	mtrf1	76	57.612	ENSANAG00000025310	-	92	57.612	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	74.713	ENSACLG00000023945	mtrf1	97	74.713	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000014280	mtrf1	53	75.000	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	75.000	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	90	54.408	ENSBTAG00000012260	MTRF1	88	55.946	Bos_taurus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSCJAG00000017739	MTRF1	96	65.269	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.283	ENSCAFG00000004795	MTRF1	86	56.283	Canis_familiaris
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.283	ENSCAFG00020018178	MTRF1	86	56.283	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	55.526	Capra_hircus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.579	ENSTSYG00000006976	MTRF1	85	56.579	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000014280	mtrf1	88	55.065	ENSCAPG00000013163	MTRF1	89	55.065	Cavia_aperea
ENSPLAG00000014280	mtrf1	88	54.805	ENSCPOG00000005264	MTRF1	86	54.805	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.316	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	56.316	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.906	ENSCATG00000009909	MTRF1	86	55.906	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.263	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	55.263	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.643	ENSCSAG00000017835	MTRF1	86	55.643	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	80	54.857	ENSCHOG00000011915	-	86	54.857	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	54.331	ENSCPBG00000007969	MTRF1	85	54.331	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	55.526	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	57.447	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	85	57.447	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	57.447	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	85	57.447	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	66.438	ENSCSEG00000005667	mtrf1	96	66.438	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	78.005	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	78.005	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	53	65.086	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	65.086	Danio_rerio
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	53.786	ENSDNOG00000034196	MTRF1	96	61.745	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.579	ENSDORG00000016429	Mtrf1	85	56.579	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.643	ENSETEG00000014811	MTRF1	85	55.643	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000014280	mtrf1	52	55.895	ENSEBUG00000000778	mtrf1	94	55.895	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSEASG00005015715	MTRF1	85	55.526	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.263	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	55.263	Equus_caballus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	44.271	ENSEEUG00000004450	-	86	43.864	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	99	64.155	ENSELUG00000006544	mtrf1	98	64.155	Esox_lucius
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.955	ENSFCAG00000031635	MTRF1	85	56.955	Felis_catus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	88	52.835	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	52.835	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.789	ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.789	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	79.953	ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	79.953	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	66.402	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	66.402	Gadus_morhua
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	55.145	ENSGALG00000016951	MTRF1	83	55.145	Gallus_gallus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	93.424	ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	93.424	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	85	75.597	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	75.597	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	72	57.962	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	57.962	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.789	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	55.789	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	54.474	ENSHGLG00000003210	MTRF1	85	54.474	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	54.474	ENSHGLG00100011843	MTRF1	85	54.474	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000014280	mtrf1	94	68.127	ENSHCOG00000009449	mtrf1	93	68.127	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	55.851	ENSSTOG00000021682	MTRF1	85	55.851	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	96	51.376	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	98	51.376	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	99	73.636	ENSKMAG00000003231	mtrf1	97	73.636	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	53	84.914	ENSLBEG00000027169	-	93	84.914	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000014280	mtrf1	53	84.914	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	84.914	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	60.053	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	60.053	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	61.376	ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.376	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	43.045	ENSLAFG00000030499	-	84	43.045	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSLAFG00000022177	-	85	55.526	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.906	ENSMFAG00000037972	MTRF1	86	55.906	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.906	ENSMNEG00000035487	MTRF1	86	55.906	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.906	ENSMLEG00000033582	MTRF1	86	55.906	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	74.769	ENSMAMG00000022048	mtrf1	97	74.769	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	74.713	ENSMZEG00005017922	mtrf1	97	74.713	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	55.409	ENSMGAG00000014971	MTRF1	91	55.409	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000014280	mtrf1	88	55.584	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	86	55.584	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	91	55.276	ENSMICG00000033131	MTRF1	89	55.276	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	95	53.125	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	92	53.125	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000014280	mtrf1	53	70.259	ENSMMOG00000013394	mtrf1	95	70.259	Mola_mola
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	55.319	ENSMODG00000014772	MTRF1	85	55.319	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	75.000	ENSMALG00000013274	mtrf1	99	75.000	Monopterus_albus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	94	52.113	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	95	52.113	Mus_caroli
ENSPLAG00000014280	mtrf1	90	55.473	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	90	55.473	Mus_musculus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	94	52.336	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	96	52.336	Mus_pahari
ENSPLAG00000014280	mtrf1	89	55.779	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	89	55.779	Mus_spretus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.430	ENSMPUG00000001874	MTRF1	86	56.430	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.842	ENSMLUG00000017237	MTRF1	85	56.842	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	97	52.681	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	95	52.681	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000014280	mtrf1	53	86.207	ENSNBRG00000004634	mtrf1	98	86.207	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSNLEG00000001236	MTRF1	85	55.526	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	53.684	ENSMEUG00000001846	MTRF1	86	53.684	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000014280	mtrf1	62	33.456	ENSOPRG00000006450	-	83	33.456	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.263	ENSODEG00000005782	MTRF1	85	55.263	Octodon_degus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	80.890	ENSONIG00000012476	mtrf1	98	80.890	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	69	58.824	ENSOANG00000003383	-	97	58.824	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.316	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	56.316	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	70.470	ENSORLG00000003225	mtrf1	100	70.470	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	70.379	ENSORLG00020021048	mtrf1	100	70.379	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	70.022	ENSORLG00015020957	mtrf1	100	70.022	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	69.820	ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	69.820	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000014280	mtrf1	80	58.571	ENSOGAG00000009719	-	78	58.571	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000014280	mtrf1	74	50.464	ENSOGAG00000026411	-	99	50.464	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSOARG00000006994	MTRF1	85	55.526	Ovis_aries
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	55.526	Pan_paniscus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.955	ENSPPRG00000009511	MTRF1	85	56.955	Panthera_pardus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	56.955	ENSPTIG00000006673	MTRF1	85	56.955	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.526	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	55.526	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.906	ENSPANG00000010809	MTRF1	86	55.906	Papio_anubis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	85	59.517	ENSPKIG00000015711	mtrf1	87	59.517	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	53.806	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	53.806	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000014280	mtrf1	53	81.897	ENSPMGG00000006724	mtrf1	94	81.897	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	96	53.318	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	93	53.318	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000014280	mtrf1	76	50.146	ENSPMAG00000009849	mtrf1	98	50.437	Petromyzon_marinus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	55.703	ENSPCIG00000012940	MTRF1	86	55.409	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	99.544	ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	99.544	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	98.405	ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	98.405	Poecilia_mexicana
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ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.000	ENSPPYG00000005313	MTRF1	85	55.000	Pongo_abelii
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