EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000016285 (Gene tree)
Gene ID: 106954734
Gene Symbol: mrto4
Alias: -
Full Name: MRT4 homolog%2C ribosome maturation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2866 bases
Position: chrKQ545990.1:274813-277678
Accession: 106954734
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000012880	Ribosomal_L10	PF00466.20	8e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000020712	-	1367	XM_015044458	ENSPLAP00000012880	238 (aa)	XP_014899944	UPI000443CA4B

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000016285's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000016285's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.339	ENSG00000053372	MRTO4	92	77.169	Homo_sapiens
ENSPLAG00000016285	mrto4	68	87.730	ENSAPOG00000013189	-	80	88.535	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	91.150	ENSAPOG00000011387	mrto4	92	91.818	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000016285	mrto4	68	87.730	ENSAPOG00000013290	-	80	88.535	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	49.772	ENSAMEG00000014981	-	100	49.772	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSAMEG00000003014	MRTO4	92	76.256	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	88.053	ENSACIG00000008213	mrto4	92	89.091	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000016285	mrto4	91	89.862	ENSAOCG00000006483	mrto4	84	90.995	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000016285	mrto4	98	89.700	ENSAPEG00000004866	mrto4	94	91.818	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	88.938	ENSATEG00000024976	mrto4	92	89.545	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000016285	mrto4	68	73.292	ENSAPLG00000013861	MRTO4	88	75.484	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.893	ENSANAG00000029674	MRTO4	92	76.712	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	89.823	ENSACLG00000016523	mrto4	92	90.909	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000016285	mrto4	93	85.135	ENSAMXG00000003899	mrto4	92	85.455	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.339	ENSBTAG00000011951	MRTO4	92	77.169	Bos_taurus
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	73.418	ENSCJAG00000006812	MRTO4	92	76.712	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSCAFG00000015189	-	91	75.342	Canis_familiaris
ENSPLAG00000016285	mrto4	91	53.704	ENSCAFG00000009080	-	98	53.704	Canis_familiaris
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	67.411	ENSCAFG00000000532	-	91	67.580	Canis_familiaris
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSCAFG00020008173	MRTO4	91	75.342	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.339	ENSCHIG00000014751	MRTO4	92	77.169	Capra_hircus
ENSPLAG00000016285	mrto4	89	55.660	ENSCHIG00000010639	-	91	55.660	Capra_hircus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.554	ENSTSYG00000013413	MRTO4	92	75.342	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000016285	mrto4	84	71.859	ENSCAPG00000012648	MRTO4	85	73.196	Cavia_aperea
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSCPOG00000033237	MRTO4	91	76.256	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.893	ENSCCAG00000036206	MRTO4	92	76.712	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000016285	mrto4	97	66.379	ENSCATG00000030492	-	89	71.154	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.107	ENSCLAG00000001997	MRTO4	91	75.342	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	73.661	ENSCSAG00000018596	-	92	74.429	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.606	ENSCSAG00000000876	-	91	76.606	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	79.909	ENSCPBG00000023562	MRTO4	90	79.909	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	60.000	ENSCSAVG00000011770	-	78	61.009	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	69.196	ENSCANG00000005353	-	91	69.863	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSCANG00000002395	-	92	76.256	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	97	67.521	ENSCGRG00001001286	-	90	72.512	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	77.064	ENSCGRG00001005758	-	91	77.064	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	74.771	ENSCGRG00000010649	-	91	74.771	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000016285	mrto4	97	67.521	ENSCGRG00000001527	-	90	72.512	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	90.455	ENSCSEG00000021629	mrto4	92	90.455	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	97.717	ENSCVAG00000012249	mrto4	93	97.717	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	98	80.769	ENSDARG00000007130	mrto4	90	84.018	Danio_rerio
ENSPLAG00000016285	mrto4	96	55.794	ENSDNOG00000045395	-	89	58.605	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000016285	mrto4	87	75.481	ENSDNOG00000030871	-	87	75.481	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.339	ENSDNOG00000010119	-	92	77.169	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	75.229	ENSDORG00000025382	Mrto4	91	75.229	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	71.369	ENSETEG00000001675	MRTO4	91	75.799	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSEASG00005014967	MRTO4	92	75.799	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSECAG00000012598	MRTO4	92	75.799	Equus_caballus
ENSPLAG00000016285	mrto4	90	58.411	ENSEEUG00000013520	MRTO4	92	59.048	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000016285	mrto4	100	80.753	ENSELUG00000011152	mrto4	92	83.562	Esox_lucius
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	73.640	ENSFCAG00000008771	MRTO4	92	76.712	Felis_catus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	73.973	ENSFALG00000010619	MRTO4	92	73.973	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.107	ENSFDAG00000013300	MRTO4	91	75.342	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	97.248	ENSFHEG00000022920	mrto4	94	96.818	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000016285	mrto4	89	85.446	ENSGMOG00000001422	mrto4	95	84.932	Gadus_morhua
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	74.545	ENSGALG00000003991	MRTO4	93	74.545	Gallus_gallus
ENSPLAG00000016285	mrto4	100	97.059	ENSGAFG00000012570	mrto4	100	97.059	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	88.938	ENSGACG00000001672	mrto4	93	90.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	89	77.830	ENSGAGG00000012997	MRTO4	88	78.095	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000016285	mrto4	97	72.917	ENSGGOG00000000533	MRTO4	92	77.169	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000016285	mrto4	90	52.804	ENSGGOG00000036991	-	83	53.110	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000016285	mrto4	87	64.423	ENSGGOG00000042625	-	88	64.423	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	89.381	ENSHBUG00000009670	mrto4	92	90.455	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.107	ENSHGLG00000012157	MRTO4	92	75.342	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.107	ENSHGLG00100014484	MRTO4	92	75.342	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	82.979	ENSHCOG00000019894	mrto4	93	85.909	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000016285	mrto4	96	85.153	ENSIPUG00000002957	mrto4	91	87.215	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.554	ENSSTOG00000028112	MRTO4	92	75.342	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	73.973	ENSJJAG00000017998	Mrto4	91	73.973	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	91.150	ENSKMAG00000010148	mrto4	93	92.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	91.364	ENSLBEG00000025010	mrto4	94	91.364	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	79.909	ENSLACG00000019155	MRTO4	92	79.909	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000016285	mrto4	91	84.259	ENSLOCG00000004468	mrto4	88	84.259	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.339	ENSLAFG00000010416	MRTO4	92	77.169	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSMFAG00000033225	-	92	76.256	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSMMUG00000038335	MRTO4	92	76.256	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	57.589	ENSMMUG00000044851	-	90	57.991	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSMNEG00000032783	-	92	76.256	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSMLEG00000023273	-	92	76.256	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	89.381	ENSMAMG00000014839	mrto4	92	90.909	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	89.823	ENSMZEG00005013929	mrto4	92	90.909	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.256	ENSMGAG00000005361	MRTO4	92	76.256	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.606	ENSMAUG00000019627	-	91	76.606	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000016285	mrto4	86	66.829	ENSMICG00000033640	-	100	66.829	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.554	ENSMICG00000004019	MRTO4	91	75.342	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000016285	mrto4	73	73.563	ENSMOCG00000018413	Mrto4	89	74.269	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	88.393	ENSMMOG00000010735	mrto4	90	90.521	Mola_mola
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	78.082	ENSMODG00000015874	MRTO4	90	78.082	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	90.909	ENSMALG00000007769	mrto4	98	90.868	Monopterus_albus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.606	MGP_CAROLIEiJ_G0026711	Mrto4	91	76.606	Mus_caroli
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.606	ENSMUSG00000028741	Mrto4	100	80.328	Mus_musculus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.147	MGP_PahariEiJ_G0029042	Mrto4	91	76.147	Mus_pahari
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.606	MGP_SPRETEiJ_G0027691	Mrto4	91	76.606	Mus_spretus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.554	ENSMPUG00000016181	MRTO4	92	75.342	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.786	ENSMLUG00000001566	-	92	77.626	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSMLUG00000025001	-	92	75.799	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	72.689	ENSNGAG00000011660	Mrto4	91	76.147	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	89.381	ENSNBRG00000021435	mrto4	92	90.909	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	68.220	ENSNLEG00000018006	-	92	71.233	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000016285	mrto4	68	70.988	ENSNLEG00000034965	-	84	72.436	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	67.857	ENSNLEG00000027896	-	91	68.493	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000016285	mrto4	69	79.268	ENSMEUG00000000027	MRTO4	100	79.268	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	77.626	ENSOPRG00000012746	MRTO4	92	77.626	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	69.643	ENSODEG00000011537	-	91	70.776	Octodon_degus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	73.661	ENSODEG00000019157	-	91	74.886	Octodon_degus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	68.750	ENSODEG00000014387	-	91	69.863	Octodon_degus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.554	ENSODEG00000015379	-	91	75.799	Octodon_degus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	62.946	ENSODEG00000014016	-	80	63.927	Octodon_degus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	90.265	ENSONIG00000014318	mrto4	92	91.364	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	70.306	ENSOANG00000015345	MRTO4	88	73.810	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000016285	mrto4	98	71.548	ENSOCUG00000000274	MRTO4	92	75.799	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	92.273	ENSORLG00000027922	mrto4	92	92.273	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	92.273	ENSORLG00020019412	mrto4	92	92.273	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	92.273	ENSORLG00015015309	mrto4	92	92.273	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000016285	mrto4	98	90.129	ENSOMEG00000021110	mrto4	98	91.775	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.446	ENSOGAG00000010713	-	92	76.256	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000016285	mrto4	98	52.301	ENSOGAG00000027996	-	90	54.338	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	53.125	ENSPPAG00000039572	-	90	53.425	Pan_paniscus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.786	ENSPPAG00000043731	MRTO4	92	77.626	Pan_paniscus
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	72.385	ENSPPRG00000024765	MRTO4	92	75.342	Panthera_pardus
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	73.640	ENSPTIG00000016208	MRTO4	92	76.712	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	53.571	ENSPTRG00000046027	-	90	53.881	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.339	ENSPTRG00000000262	MRTO4	92	77.169	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	70.320	ENSPANG00000011596	-	96	70.320	Papio_anubis
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	66.518	ENSPANG00000017838	-	91	67.123	Papio_anubis
ENSPLAG00000016285	mrto4	89	86.854	ENSPKIG00000017917	mrto4	90	86.574	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000016285	mrto4	72	77.907	ENSPSIG00000015125	MRTO4	89	77.907	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	81.818	ENSPMGG00000013461	mrto4	91	81.818	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	76.606	ENSPEMG00000010459	-	91	76.606	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	71.041	ENSPEMG00000023720	-	91	71.041	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	72.314	ENSPCIG00000003652	MRTO4	90	76.712	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000016285	mrto4	100	100.000	ENSPFOG00000013266	mrto4	100	100.000	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000016285	mrto4	100	99.160	ENSPMEG00000003539	mrto4	100	99.160	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000016285	mrto4	100	97.899	ENSPREG00000006249	mrto4	100	97.899	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	76.339	ENSPPYG00000001795	MRTO4	92	77.169	Pongo_abelii
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	69.863	ENSPCAG00000001458	MRTO4	92	69.863	Procavia_capensis
ENSPLAG00000016285	mrto4	98	71.130	ENSPCOG00000014182	MRTO4	92	74.886	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.554	ENSPVAG00000005775	MRTO4	91	75.342	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	89.381	ENSPNYG00000018672	mrto4	92	90.455	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000016285	mrto4	96	83.772	ENSPNAG00000027733	mrto4	92	85.000	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000016285	mrto4	72	73.684	ENSRNOG00000017979	Mrto4	89	73.684	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000016285	mrto4	82	68.878	ENSRBIG00000036159	-	90	69.634	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSRBIG00000036806	-	92	75.799	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	62.500	ENSRBIG00000013434	-	91	63.014	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSRROG00000042838	-	92	75.799	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	74.554	ENSRROG00000011593	-	88	75.342	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	71.429	ENSRROG00000037374	-	91	72.146	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000016285	mrto4	100	71.967	ENSSBOG00000022924	MRTO4	92	76.256	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000016285	mrto4	88	76.190	ENSSHAG00000008423	MRTO4	90	76.190	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	85.202	ENSSFOG00015006887	mrto4	92	86.239	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	89.381	ENSSMAG00000014393	mrto4	92	90.455	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	90.708	ENSSDUG00000015362	mrto4	92	91.818	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	90.708	ENSSLDG00000015813	mrto4	92	91.818	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	72.199	ENSSARG00000012700	MRTO4	91	76.256	Sorex_araneus
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	78.814	ENSSPUG00000001110	MRTO4	93	81.735	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	98	90.171	ENSSPAG00000007811	mrto4	92	92.273	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000016285	mrto4	97	72.650	ENSSSCG00000034814	MRTO4	98	72.340	Sus_scrofa
ENSPLAG00000016285	mrto4	76	74.176	ENSTGUG00000016935	MRTO4	98	74.586	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	86.726	ENSTRUG00000019838	mrto4	92	87.727	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000016285	mrto4	95	88.496	ENSTNIG00000014802	mrto4	92	89.091	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSTTRG00000014203	MRTO4	92	75.799	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000016285	mrto4	90	74.419	ENSUAMG00000026191	MRTO4	84	75.238	Ursus_americanus
ENSPLAG00000016285	mrto4	99	72.385	ENSUMAG00000018964	MRTO4	92	76.256	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000016285	mrto4	94	75.000	ENSVVUG00000029432	MRTO4	91	75.342	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000016285	mrto4	92	74.886	ENSXETG00000020828	mrto4	91	74.886	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000016285	mrto4	97	99.134	ENSXCOG00000013521	mrto4	99	99.134	Xiphophorus_couchianus