EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000018019 (Gene tree)
Gene ID: 106954084
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: -
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 468 bases
Position: chrKQ545940.1:168563-169030
Accession: 106954084
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000028550	PTH2	PF01981.16	1.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000022637	-	381	XM_015043329	ENSPLAP00000028550	126 (aa)	XP_014898815	UPI0004445122

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000018019's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000018019's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSG00000184924	PTRHD1	90	58.268	Homo_sapiens
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	89.683	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	55.118	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	55.118	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	88.889	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	88.889	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	89.683	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	89.683	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	84.921	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	84.921	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSANAG00000019089	PTRHD1	90	58.268	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	89.683	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	78.740	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	61.417	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	90	61.417	Bos_taurus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	94	48.305	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	48.387	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	90	57.480	Canis_familiaris
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	61.417	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	90	61.417	Capra_hircus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	90	58.268	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.055	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	90	59.055	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	90	58.268	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.730	ENSCATG00000033690	PTRHD1	90	58.730	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	87	58.268	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	90	58.268	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	48.413	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	91	48.413	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	90	56.693	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	93	56.410	ENSCING00000019647	-	99	56.410	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSCANG00000034444	PTRHD1	90	58.268	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	97	58.065	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	59	58.065	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	97	58.065	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	89	58.065	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	85.039	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	85.039	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	92.063	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	92.063	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	78.571	ENSDARG00000016122	ptrhd1	100	78.571	Danio_rerio
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	98	55.200	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	83	55.200	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	91	56.693	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	93	64.103	FBgn0038446	CG14903	98	64.103	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	94	47.458	ENSETEG00000009379	-	87	47.458	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	55	57.143	ENSETEG00000001615	-	82	57.143	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	93	58.120	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.120	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	43.103	ENSEASG00005001302	-	82	43.103	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	43.103	ENSECAG00000005314	-	79	43.103	Equus_caballus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSECAG00000017730	PTRHD1	90	58.268	Equus_caballus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	98	54.400	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	89	54.400	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	76.190	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	76.190	Esox_lucius
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	90	56.693	Felis_catus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.843	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	90	59.843	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	92.063	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	92.063	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	59.130	ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	56.923	Gallus_gallus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	98.413	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	98.413	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	99	85.600	ENSGACG00000006743	ptrhd1	98	85.600	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.055	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	100	59.055	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	57.480	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	89.683	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.055	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	90	59.055	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.843	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	90	59.843	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSHGLG00100004341	-	92	57.480	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	85.039	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	85.039	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	93	74.359	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	98	74.359	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	90	58.268	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.843	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	91	59.843	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	89	83.929	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	83.929	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	84.127	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	84.127	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	72.174	ENSLACG00000018052	PTRHD1	100	69.048	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	76.562	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	100	76.562	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	98	55.200	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	89	55.200	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	90	57.480	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	90	57.480	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	90	57.480	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.143	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	90	57.143	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	85.714	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	85.714	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	89.683	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.055	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	90	59.055	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	59.055	ENSMICG00000001578	PTRHD1	89	57.600	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	85.714	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	85.714	Mola_mola
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	95	55.372	ENSMODG00000015895	PTRHD1	89	55.372	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	84.127	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	84.127	Monopterus_albus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	90	56.693	Mus_caroli
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	Mus_musculus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	90	56.693	Mus_spretus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	55.118	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	90	55.118	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	55.906	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	90	55.906	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	90	57.480	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	89.683	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	55	55.714	ENSMEUG00000010482	-	83	55.714	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	90	58.268	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSODEG00000007805	PTRHD1	87	56.693	Octodon_degus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	88.889	ENSONIG00000015722	ptrhd1	93	88.889	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	90	57.480	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	92	79.487	ENSORLG00000028768	ptrhd1	99	79.487	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	92	79.487	ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	79.487	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	92	79.487	ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	79.487	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	76.378	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	76.378	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	56.034	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	83	56.034	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	61.417	ENSOARG00000018052	PTRHD1	90	61.417	Ovis_aries
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	90	58.268	Pan_paniscus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	90	56.693	Panthera_pardus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	90	56.693	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	90	58.268	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	ENSPANG00000006781	PTRHD1	90	57.480	Papio_anubis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	69.841	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	86	69.841	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	92	87.069	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	87.302	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	89	64.286	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	98	64.228	Petromyzon_marinus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	54.310	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	54.310	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	100.000	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	89	100.000	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	99.206	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	99.206	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	99.206	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	99.206	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	90	58.268	Pongo_abelii
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	98	55.200	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	89	55.200	Procavia_capensis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	90	58.268	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	90	58.268	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	89.683	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	89.683	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	78.740	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	100	78.740	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	97	56.452	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	89	56.452	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSRROG00000029627	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	90	58.268	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	53.543	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	82	53.543	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	96	68.595	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	68.595	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	92	86.207	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	85.039	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	88.889	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	88.889	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	88.889	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	88.889	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	60.345	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	59.055	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	88.889	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	88.889	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	97	47.541	ENSSSCG00000040441	-	92	47.541	Sus_scrofa
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	99	56.349	ENSTGUG00000015169	-	92	56.349	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	82.540	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	82.540	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	81.746	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	81.746	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	55.906	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	90	55.906	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	55.906	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	90	55.906	Ursus_americanus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	55.906	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	91	55.906	Vicugna_pacos
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	88	65.766	ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	98.413	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	98.413	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	98.413	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	98.413	Xiphophorus_maculatus