EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000018304 (Gene tree)
Gene ID: 106958848
Gene Symbol: skiv2l
Alias: -
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28613 bases
Position: chrKQ546337.1:97272-125884
Accession: 106958848
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000014503	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.6e-30	1	1
ENSPLAP00000028638	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.2e-26	1	1
ENSPLAP00000028638	DEAD	PF00270.29	2.2e-16	1	1
ENSPLAP00000014503	DEAD	PF00270.29	2.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000022838	-	4706	XM_015050978	ENSPLAP00000014503	1245 (aa)	XP_014906464	UPI00072E3BD5
ENSPLAT00000022811	-	3687	-	ENSPLAP00000028638	1228 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000018304's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000018304's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000018304	skiv2l	76	36.232	ENSPLAG00000021311	mtrex	92	34.711

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.396	ENSG00000204351	SKIV2L	99	61.203	Homo_sapiens
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.406	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	89.406	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.365	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.410	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	86.964	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.449	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.807	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	89.807	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.647	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	89.647	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.807	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	89.807	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	62.715	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	62.998	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.958	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	61.758	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.486	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.486	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	82.414	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.654	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.396	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	61.362	Bos_taurus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	96	41.067	WBGene00008502	skih-2	99	41.172	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.362	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.236	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	61.283	Canis_familiaris
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.236	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	61.283	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.717	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	61.758	Capra_hircus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.995	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	61.094	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.470	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	61.355	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.717	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	61.520	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	61.441	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.285	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.094	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.637	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	61.441	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	89	58.684	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	59.203	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000018304	skiv2l	93	50.684	ENSCING00000005576	-	99	50.684	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.477	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.556	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.897	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	61.618	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	86.404	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	86.484	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	94.222	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	94.251	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	83.773	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	83.773	Danio_rerio
ENSPLAG00000018304	skiv2l	92	65.469	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	93	65.578	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	93	45.546	FBgn0039117	tst	97	45.599	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000018304	skiv2l	68	69.620	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	69.620	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000018304	skiv2l	91	55.055	ENSEBUG00000013680	-	98	54.628	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000018304	skiv2l	93	62.511	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	63.333	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	93	61.102	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	61.706	Equus_caballus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	52	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	84.480	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	86.842	Esox_lucius
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	61.599	Felis_catus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	59.984	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.270	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	93.018	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.018	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	80.853	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	80.853	Gadus_morhua
ENSPLAG00000018304	skiv2l	76	56.726	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.612	Gallus_gallus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	97.753	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	97.753	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.090	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.090	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	61.362	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.486	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	89.486	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.995	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	60.808	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	59.390	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	59.224	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000018304	skiv2l	98	81.321	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	81.321	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	81.920	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	82.439	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.380	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.618	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	56	63.946	ENSLACG00000002986	-	60	63.946	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.464	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.648	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	61.599	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	61.599	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.599	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.477	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	61.520	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.807	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.807	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.486	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	89.486	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000018304	skiv2l	61	59.512	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	49.676	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.483	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.301	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.477	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	61.599	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.499	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.476	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	84.634	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	84.634	Mola_mola
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.398	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.776	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	83.881	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.881	Monopterus_albus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	62.188	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	61.905	Mus_caroli
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.947	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	61.905	Mus_musculus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	62.349	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	62.302	Mus_pahari
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.786	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	61.746	Mus_spretus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.754	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	61.124	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.254	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	61.063	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	85.173	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	85.657	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.628	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.478	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000018304	skiv2l	78	61.062	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	61.062	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.772	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.825	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.093	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	60.904	Octodon_degus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.888	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.888	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.847	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	61.886	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.221	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	88.221	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.061	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	88.061	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.061	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	88.061	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.452	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	88.452	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	61.362	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	58.105	ENSOARG00000002411	-	99	58.192	Ovis_aries
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.894	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	60.821	Pan_paniscus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.717	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	61.758	Panthera_pardus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.316	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.362	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.477	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	61.283	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.623	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	60.632	Papio_anubis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	78.679	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.679	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	84.932	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	85.012	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.545	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	61.508	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.155	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	61.472	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	99.599	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	99.599	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	99.197	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	99.197	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	90.411	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	90.411	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.236	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	61.045	Pongo_abelii
ENSPLAG00000018304	skiv2l	76	63.725	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	63.725	Procavia_capensis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.396	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	61.441	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.817	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	61.618	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	81.723	ENSPNYG00000017853	skiv2l	100	80.791	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	84.172	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	83.894	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	62.188	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	61.905	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.606	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	60.616	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.717	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	61.599	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000018304	skiv2l	87	48.706	YLR398C	-	84	49.412	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	62.199	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.995	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.921	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.349	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	81.963	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.963	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.283	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.340	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.807	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	89.807	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	82.998	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.998	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	59.722	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	60.093	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	95	89.746	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.746	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.203	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.441	Sus_scrofa
ENSPLAG00000018304	skiv2l	70	86.096	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.633	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	83.747	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.987	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	93	62.945	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.945	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	57.303	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.482	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.396	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.441	Ursus_americanus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	93	62.596	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	62.852	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.236	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	61.398	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	58.425	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.721	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	95.729	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	95.729	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	97.191	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	97.191	Xiphophorus_maculatus