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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000018696 (Gene tree)
Gene ID: 106963590
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25892 bases
Position: chrKQ546866.1:53953-79844
Accession: 106963590
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000014866	IBN_N	PF03810.19	1.5e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000023325	-	6857	XM_015058600	ENSPLAP00000014866	893 (aa)	XP_014914086	UPI0004445461

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	86.404	ENSPLAG00000018842	tnpo2	99	86.517
ENSPLAG00000018696	tnpo1	93	86.747	ENSPLAG00000010687	TNPO2	97	86.747

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.760	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.760	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.231	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.342	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	96.654	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.654	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.648	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.648	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.648	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.648	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.648	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.648	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	89.426	ENSAPLG00000009619	-	97	90.493	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.169	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	82.979	ENSANAG00000025351	-	99	82.979	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.721	ENSANAG00000022453	-	99	92.721	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	59.822	ENSANAG00000027118	-	99	60.442	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	95.073	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.073	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	94.407	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.407	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.057	Bos_taurus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.833	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.833	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	93.140	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.140	Canis_familiaris
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	90.705	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.705	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.945	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.945	Capra_hircus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	92.075	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.075	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.721	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.721	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.169	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.945	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.945	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.169	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	94	81.354	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.116	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.833	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.729	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	76.286	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.499	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.169	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.057	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	93.240	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.240	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	95.969	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.969	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	98.096	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.096	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	94.295	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.295	Danio_rerio
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	87.277	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.054	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	93	93.149	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.149	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	58.090	FBgn0035693	CG8219	99	57.865	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000018696	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000018696	tnpo1	94	85.528	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.528	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.169	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.169	Equus_caballus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	88.792	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.683	Esox_lucius
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.169	Felis_catus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.617	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.617	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.833	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.833	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	98.432	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.432	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.057	Gadus_morhua
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.057	Gallus_gallus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	98.432	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.432	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.417	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.417	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.841	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.841	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.169	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	78.387	ENSGGOG00000022535	-	98	78.387	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.865	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.865	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.721	ENSHGLG00000000970	-	99	92.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000018696	tnpo1	97	72.769	ENSHGLG00100000963	-	99	72.422	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	92.782	ENSHGLG00100017090	-	99	92.782	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.393	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.393	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.865	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.865	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	91	93.850	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.850	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	87.022	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.022	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	94.401	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.401	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	97	92.520	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.520	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.169	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.138	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.169	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.169	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.648	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.648	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.417	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.417	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	89.586	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.586	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.057	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	96.911	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.911	Mola_mola
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	94.043	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.305	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.305	Monopterus_albus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.833	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.258	Mus_caroli
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.333	Mus_musculus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.945	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	Mus_pahari
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.833	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.258	Mus_spretus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.169	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	92.923	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.923	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.169	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	96.268	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.268	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.169	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000018696	tnpo1	90	87.935	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.910	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.721	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.721	Octodon_degus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.107	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.107	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	92	94.168	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.168	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	86.962	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.962	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	96.641	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.641	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	96.854	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.854	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	97.191	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.191	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	97.191	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.191	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.169	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.161	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.057	Ovis_aries
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.169	Pan_paniscus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.169	Panthera_pardus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.169	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000018696	tnpo1	94	82.207	ENSPTRG00000047731	-	100	82.207	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.169	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.169	Papio_anubis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	90.705	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.705	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.617	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.617	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.960	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.960	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	93.240	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.240	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.841	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.841	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	100.000	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	100.000	Poecilia_formosa
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ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	99.216	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	99.216	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.057	Pongo_abelii
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