EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000019171 (Gene tree)
Gene ID: 106959466
Gene Symbol: ctif
Alias: -
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 63703 bases
Position: chrKQ546399.1:43970-107672
Accession: 106959466
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000029138	MIF4G	PF02854.19	2e-27	1	1
ENSPLAP00000015254	MIF4G	PF02854.19	2.6e-27	1	1
ENSPLAP00000029157	MIF4G	PF02854.19	2.8e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000023804	-	1842	-	ENSPLAP00000029138	613 (aa)	-	-
ENSPLAT00000023849	-	5800	XM_015052047	ENSPLAP00000029157	708 (aa)	XP_014907533	UPI00072DD35C
ENSPLAT00000024062	-	5719	XM_015052048	ENSPLAP00000015254	681 (aa)	XP_014907534	UPI00072EA996

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.294	ENSG00000134030	CTIF	100	62.590	Homo_sapiens
ENSPLAG00000019171	ctif	90	83.333	ENSAPOG00000020192	ctif	100	81.645	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000019171	ctif	88	56.624	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	55.978	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000019171	ctif	100	78.059	ENSACIG00000017099	ctif	100	78.340	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000019171	ctif	100	75.141	ENSAOCG00000014275	ctif	100	74.718	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000019171	ctif	100	81.780	ENSAPEG00000016975	ctif	100	82.085	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000019171	ctif	100	81.791	ENSATEG00000016752	ctif	100	81.938	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.601	ENSACAG00000018006	CTIF	99	54.436	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.439	ENSANAG00000024925	CTIF	99	58.121	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000019171	ctif	100	79.883	ENSACLG00000005956	ctif	100	80.176	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000019171	ctif	89	62.873	ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.136	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.280	ENSBTAG00000018901	CTIF	99	57.962	Bos_taurus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.895	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.576	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000019171	ctif	97	56.981	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	57.165	Canis_familiaris
ENSPLAG00000019171	ctif	97	57.655	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	57.937	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.820	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	57.504	Capra_hircus
ENSPLAG00000019171	ctif	91	55.282	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	54.833	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000019171	ctif	99	53.577	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	53.155	Cavia_aperea
ENSPLAG00000019171	ctif	99	56.698	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	56.386	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.095	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	57.778	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.758	ENSCATG00000038134	CTIF	98	65.000	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.643	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	57.325	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.609	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	57.298	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000019171	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.413	ENSCANG00000030916	CTIF	99	58.505	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	59.429	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	59.113	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000019171	ctif	99	54.839	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	54.531	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000019171	ctif	100	77.518	ENSCSEG00000019857	ctif	100	78.102	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000019171	ctif	100	86.864	ENSCVAG00000017158	ctif	100	87.853	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	63.585	ENSDARG00000090617	ctif	100	65.460	Danio_rerio
ENSPLAG00000019171	ctif	72	57.650	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	57.871	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.400	ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.920	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.460	ENSEASG00005016094	CTIF	99	57.143	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.521	ENSECAG00000020473	CTIF	100	58.106	Equus_caballus
ENSPLAG00000019171	ctif	91	55.338	ENSEEUG00000012451	CTIF	99	54.982	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	63.328	ENSELUG00000008733	ctif	100	64.486	Esox_lucius
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.054	ENSFCAG00000000664	CTIF	99	57.735	Felis_catus
ENSPLAG00000019171	ctif	97	57.000	ENSFALG00000008943	CTIF	98	56.931	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.188	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	56.875	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000019171	ctif	100	90.113	ENSFHEG00000004334	ctif	100	94.915	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.184	ENSGALG00000035912	-	99	57.759	Gallus_gallus
ENSPLAG00000019171	ctif	100	95.015	ENSGAFG00000011896	ctif	100	98.305	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000019171	ctif	66	55.422	ENSGAGG00000020663	CTIF	91	56.777	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.095	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	57.778	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000019171	ctif	100	80.029	ENSHBUG00000018092	ctif	100	80.323	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.347	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	58.029	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.188	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	57.870	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000019171	ctif	99	66.343	ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000019171	ctif	99	63.885	ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.552	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.080	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	57.920	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	56.916	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	56.709	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000019171	ctif	100	80.764	ENSKMAG00000014651	ctif	100	81.378	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	71.757	ENSLBEG00000018277	ctif	99	86.441	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000019171	ctif	99	65.173	ENSLOCG00000011697	ctif	100	64.441	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	50.758	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	76.136	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.758	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	58.439	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.758	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	58.439	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.758	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	58.439	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.571	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	58.254	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000019171	ctif	100	81.057	ENSMAMG00000014741	ctif	100	80.910	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000019171	ctif	90	77.516	ENSMZEG00005019767	ctif	90	77.997	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000019171	ctif	88	40.354	ENSMGAG00000001378	CTIF	61	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.506	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	58.188	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.254	ENSMICG00000010167	CTIF	99	58.080	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	59.040	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	58.720	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000019171	ctif	100	76.648	ENSMMOG00000000831	ctif	100	76.305	Mola_mola
ENSPLAG00000019171	ctif	99	54.416	ENSMODG00000003464	CTIF	99	54.777	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000019171	ctif	86	69.392	ENSMALG00000020553	ctif	99	82.051	Monopterus_albus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.362	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	57.055	Mus_caroli
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.339	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	57.034	Mus_musculus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	59.141	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	58.824	Mus_pahari
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.622	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	76.471	Mus_spretus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.803	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	57.484	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.508	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	57.097	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	59.113	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	58.720	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000019171	ctif	100	80.029	ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.323	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.095	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	57.778	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000019171	ctif	99	51.768	ENSMEUG00000000218	CTIF	85	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.675	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	58.517	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000019171	ctif	99	55.640	ENSODEG00000018390	CTIF	99	55.283	Octodon_degus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	75.772	ENSONIG00000007750	ctif	94	82.011	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000019171	ctif	85	47.279	ENSOANG00000001337	CTIF	99	47.279	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.654	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	58.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000019171	ctif	100	77.433	ENSORLG00000005786	ctif	100	77.433	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000019171	ctif	100	76.446	ENSORLG00020005385	ctif	100	76.446	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000019171	ctif	100	76.728	ENSORLG00015011872	ctif	100	76.728	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000019171	ctif	100	77.715	ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.715	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.188	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	57.778	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.070	ENSOARG00000003754	CTIF	99	57.753	Ovis_aries
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.294	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	65.000	Pan_paniscus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.870	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	57.552	Panthera_pardus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.643	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	57.325	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.070	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	65.000	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.571	ENSPANG00000017087	CTIF	99	58.254	Papio_anubis
ENSPLAG00000019171	ctif	85	59.542	ENSPKIG00000011234	ctif	98	63.889	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000019171	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000019171	ctif	100	71.690	ENSPMGG00000022958	ctif	100	71.690	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.626	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	58.307	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000019171	ctif	77	55.102	ENSPCIG00000026247	CTIF	99	59.531	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000019171	ctif	100	99.576	ENSPFOG00000009243	ctif	100	99.576	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000019171	ctif	100	99.576	ENSPMEG00000020089	ctif	100	99.576	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000019171	ctif	100	95.198	ENSPREG00000017326	ctif	100	95.198	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000019171	ctif	85	58.240	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	57.865	Pongo_abelii
ENSPLAG00000019171	ctif	99	56.151	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	55.836	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.895	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	57.576	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000019171	ctif	100	80.029	ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.323	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000019171	ctif	99	64.095	ENSPNAG00000029174	ctif	100	65.266	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.983	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.665	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.393	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	57.234	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.234	ENSRROG00000006039	CTIF	99	57.075	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.054	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	57.735	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000019171	ctif	99	54.531	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	54.896	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000019171	ctif	99	65.843	ENSSFOG00015022594	ctif	100	65.936	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000019171	ctif	96	87.108	ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.232	Scophthalmus_maximus
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ENSPLAG00000019171	ctif	100	69.276	ENSSLDG00000007282	ctif	100	81.791	Seriola_lalandi_dorsalis
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