EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000020556 (Gene tree)
Gene ID: 106961451
Gene Symbol: ipo4
Alias: -
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11895 bases
Position: chrKQ546618.1:107371-119265
Accession: 106961451
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000016422	IBN_N	PF03810.19	1e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000025368	-	4575	XM_015055191	ENSPLAP00000016422	1090 (aa)	XP_014910677	UPI00072E03CA

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000020556's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000020556's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.764	ENSG00000196497	IPO4	99	44.771	Homo_sapiens
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.349	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	78.899	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.475	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	44.169	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.991	ENSACIG00000004246	ipo4	100	78.991	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	81.651	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	81.651	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	81.743	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	81.743	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000020556	ipo4	92	84.064	ENSATEG00000017082	ipo4	99	84.064	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000020556	ipo4	84	45.415	ENSACAG00000003973	-	97	45.847	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.486	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.679	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.165	ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.165	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	70.092	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.000	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.567	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.475	Bos_taurus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.764	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	44.954	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	45.632	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.546	Canis_familiaris
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	45.227	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.177	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.703	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.659	Capra_hircus
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.590	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.608	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.995	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	44.872	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.671	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.862	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.042	ENSCATG00000040395	IPO4	99	45.046	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.170	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.229	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000020556	ipo4	91	44.244	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.241	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000020556	ipo4	92	36.745	ENSCING00000008639	-	99	36.141	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000020556	ipo4	93	36.285	ENSCSAVG00000011482	-	99	36.477	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.856	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.862	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.226	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	42.962	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.226	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	42.962	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	75.619	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	75.619	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	81.994	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	82.133	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	74.312	ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.291	Danio_rerio
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.926	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.802	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.424	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	44.434	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000020556	ipo4	97	30.499	FBgn0042178	CG32165	97	30.157	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000020556	ipo4	97	30.286	FBgn0042177	CG32164	97	30.230	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.355	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.236	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000020556	ipo4	90	46.714	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.092	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.304	ENSECAG00000009909	IPO4	99	44.749	Equus_caballus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	74.128	ENSELUG00000020628	ipo4	100	74.128	Esox_lucius
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.488	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	45.496	Felis_catus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	41.468	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	41.171	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000020556	ipo4	88	87.719	ENSFHEG00000009351	ipo4	96	88.315	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	74.702	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.702	Gadus_morhua
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	95.325	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	95.325	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.459	ENSGACG00000002276	ipo4	99	80.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.578	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.587	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.716	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	78.716	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.342	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	44.587	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.066	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	44.312	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	75.362	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.725	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	71.560	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.743	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.488	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.538	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	45.302	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	45.129	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.734	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	80.642	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	79.725	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.450	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	49.688	ENSLACG00000001428	IPO4	100	49.776	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000020556	ipo4	79	65.217	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	65.051	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.751	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.904	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.042	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	45.046	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.042	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	45.046	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.949	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.954	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.042	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	45.046	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	79.266	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	79.266	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.807	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	78.807	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.158	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.180	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.145	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.526	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.227	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.876	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.205	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	78.297	Mola_mola
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.134	ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.238	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.807	ENSMALG00000001587	ipo4	100	78.991	Monopterus_albus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.853	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	44.848	Mus_caroli
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.318	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	44.242	Mus_musculus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.358	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	44.567	Mus_pahari
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.594	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	44.485	Mus_spretus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.580	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.722	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.834	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	44.802	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.710	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.853	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	82.018	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	82.018	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.488	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.363	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.262	ENSODEG00000002609	IPO4	99	45.138	Octodon_degus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	82.477	ENSONIG00000014574	ipo4	100	82.477	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.147	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.608	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.133	ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.916	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.385	ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.202	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.477	ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.293	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	78.962	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	78.866	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.290	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	43.985	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	43.843	ENSOARG00000019188	IPO4	98	43.750	Ovis_aries
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.486	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	44.353	Pan_paniscus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.672	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.680	Panthera_pardus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.580	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.588	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.486	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.404	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.134	ENSPANG00000026278	IPO4	99	45.138	Papio_anubis
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	67.371	ENSPKIG00000007683	-	99	66.636	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	65.265	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	65.237	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	71.560	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	71.284	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.842	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.522	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000020556	ipo4	93	45.890	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	45.996	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	99.817	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	99.817	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	99.633	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	99.633	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	98.807	ENSPREG00000017605	ipo4	100	98.807	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.578	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	44.771	Pongo_abelii
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	45.725	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.914	Procavia_capensis
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	43.750	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	43.767	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.683	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.018	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.459	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	80.459	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	73.486	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	73.761	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.974	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	43.327	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.856	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	44.862	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.856	ENSRROG00000011492	IPO4	99	44.862	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.652	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	43.945	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.913	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	45.014	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	66.880	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.152	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	64.706	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	64.927	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	81.227	ENSSMAG00000019912	ipo4	100	81.227	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	77.198	ENSSDUG00000017513	ipo4	100	77.473	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.550	ENSSLDG00000003869	ipo4	100	80.550	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000020556	ipo4	81	45.633	ENSSARG00000010701	IPO4	81	45.633	Sorex_araneus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	82.294	ENSSPAG00000008486	ipo4	100	82.385	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.145	ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.761	Sus_scrofa
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	75.619	ENSTRUG00000012832	ipo4	100	75.688	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	74.449	ENSTNIG00000005191	ipo4	99	74.449	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	42.371	ENSTBEG00000009781	IPO4	99	42.713	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.802	ENSTTRG00000008626	IPO4	99	44.793	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.301	ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.363	Ursus_americanus
ENSPLAG00000020556	ipo4	99	45.188	ENSXETG00000014621	ipo4	99	45.696	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	93.126	ENSXCOG00000005208	ipo4	100	92.308	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000020556	ipo4	100	96.789	ENSXMAG00000006041	ipo4	100	96.789	Xiphophorus_maculatus