EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000020787 (Gene tree)
Gene ID: 106956113
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11679 bases
Position: chrKQ546105.1:14942-26620
Accession: 106956113
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000016573	eRF1_2	PF03464.15	1.6e-34	1	1
ENSPLAP00000016573	eRF1_3	PF03465.15	1.4e-25	1	1
ENSPLAP00000016573	eRF1_1	PF03463.15	1e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000031103	-	1693	XM_015046718	ENSPLAP00000016573	385 (aa)	XP_014902204	UPI0004A4C2F8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	ENSG00000152684	PELO	100	81.558	Homo_sapiens
ENSPLAG00000020787	pelo	64	92.713	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000020787	pelo	64	92.713	ENSAPOG00000023700	-	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	92.468	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000020787	pelo	97	89.276	ENSACIG00000014386	pelo	97	94.083	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	92.727	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.727	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000020787	pelo	100	92.727	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.727	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000020787	pelo	100	94.026	ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000020787	pelo	77	73.154	ENSAPLG00000013265	PELO	100	73.154	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000020787	pelo	97	80.800	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.260	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.818	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.169	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000020787	pelo	97	92.493	ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.169	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	Bos_taurus
ENSPLAG00000020787	pelo	99	61.417	WBGene00011280	pelo-1	100	61.417	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.299	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	Capra_hircus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.338	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.338	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.338	ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.338	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.558	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.818	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.818	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.338	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.338	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000020787	pelo	97	81.600	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000020787	pelo	97	64.879	ENSCING00000001979	-	100	65.195	Ciona_intestinalis
ENSPLAG00000020787	pelo	100	67.013	ENSCSAVG00000006158	-	100	67.013	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000020787	pelo	97	82.306	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.338	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000020787	pelo	97	83.110	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	83.117	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.948	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.948	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000020787	pelo	100	98.701	ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.701	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	88.571	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	Danio_rerio
ENSPLAG00000020787	pelo	100	78.756	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.756	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	83.636	ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.636	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000020787	pelo	96	68.649	FBgn0011207	pelo	96	68.074	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000020787	pelo	71	80.117	ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.117	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	ENSEASG00005013348	PELO	100	82.078	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	90.390	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	Esox_lucius
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	ENSFCAG00000032341	PELO	100	82.078	Felis_catus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	ENSFALG00000004559	PELO	100	82.078	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000020787	pelo	74	83.451	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.451	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000020787	pelo	100	96.623	ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.623	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000020787	pelo	98	88.594	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.312	Gadus_morhua
ENSPLAG00000020787	pelo	100	98.442	ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.442	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.169	ENSGACG00000007245	pelo	100	91.169	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000020787	pelo	97	81.600	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.818	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.169	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.597	ENSHGLG00000005932	PELO	100	82.597	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000020787	pelo	100	80.519	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.519	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000020787	pelo	100	89.351	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	Hippocampus_comes
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ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.078	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSPLAG00000020787	pelo	100	83.117	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	83.117	Mus_spretus
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ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.078	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.429	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.429	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.688	ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.688	ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000020787	pelo	100	93.506	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.506	Oryzias_melastigma
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ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.558	Ovis_aries
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ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	ENSPTIG00000019988	PELO	100	82.078	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.818	Papio_anubis
ENSPLAG00000020787	pelo	100	88.831	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSPLAG00000020787	pelo	67	89.535	ENSPMGG00000014561	pelo	95	89.535	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	ENSPCIG00000004880	PELO	100	81.558	Phascolarctos_cinereus
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ENSPLAG00000020787	pelo	98	32.727	YNL001W	-	98	32.727	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSPLAG00000020787	pelo	63	77.459	ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.459	Sarcophilus_harrisii
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