EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000021389 (Gene tree)
Gene ID: 106940580
Gene Symbol: polr1a
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 38153 bases
Position: chrKQ548550.1:9289-47441
Accession: 106940580
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000030338	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	1.4e-99	1	1
ENSPLAP00000030338	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	2.8e-21	1	1
ENSPLAP00000030338	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	3.1e-68	1	1
ENSPLAP00000030338	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	2.6e-36	1	1
ENSPLAP00000030338	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000026150	-	5963	XM_015023360	ENSPLAP00000030338	1689 (aa)	XP_014878846	UPI00072DB7BB

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000021389's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000021389's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000021389	polr1a	62	32.898	ENSPLAG00000000997	polr3a	69	33.007
ENSPLAG00000021389	polr1a	69	34.286	ENSPLAG00000007399	polr2a	60	34.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.701	ENSG00000068654	POLR1A	100	65.759	Homo_sapiens
ENSPLAG00000021389	polr1a	69	84.354	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	84.380	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.962	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	68.367	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	78.356	ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.798	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	83.137	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	83.607	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	83.079	ENSAPEG00000016105	polr1a	100	82.902	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	83.068	ENSATEG00000016773	polr1a	100	83.068	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000021389	polr1a	86	66.644	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	66.329	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	64.631	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	64.261	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.101	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	65.101	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	76.841	ENSACLG00000020541	polr1a	100	76.578	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.389	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	64.730	Bos_taurus
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	39.076	WBGene00012999	rpoa-1	98	38.848	Caenorhabditis_elegans
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.217	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	65.391	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.662	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	64.904	Canis_familiaris
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.858	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	64.716	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.539	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	64.028	Capra_hircus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.157	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.235	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000021389	polr1a	97	62.214	ENSCAPG00000010132	POLR1A	99	62.515	Cavia_aperea
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.076	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	65.447	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.449	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	65.507	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.759	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	65.991	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.058	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.406	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.701	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	65.701	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	66.201	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	65.799	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	47.573	ENSCSAVG00000007184	-	97	51.282	Ciona_savignyi
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	63.057	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	62.942	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	59.988	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	61.208	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000021389	polr1a	60	63.902	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	63.902	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	75.484	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	75.338	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	84.665	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	84.900	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	72.014	ENSDARG00000098375	polr1a	100	71.663	Danio_rerio
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	61.811	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	61.731	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.580	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.730	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000021389	polr1a	79	44.912	FBgn0019938	RpI1	99	43.304	Drosophila_melanogaster
ENSPLAG00000021389	polr1a	72	87.500	ENSETEG00000000412	-	71	87.500	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000021389	polr1a	89	48.267	ENSEBUG00000005667	-	99	48.226	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.512	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	64.988	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.570	ENSECAG00000010092	POLR1A	99	69.534	Equus_caballus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.570	ENSECAG00000030510	-	99	69.534	Equus_caballus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.570	ENSECAG00000036306	-	99	69.534	Equus_caballus
ENSPLAG00000021389	polr1a	84	76.808	ENSEEUG00000000676	POLR1A	84	77.018	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	72.563	ENSELUG00000012769	polr1a	99	72.913	Esox_lucius
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.604	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	65.041	Felis_catus
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	65.335	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	64.651	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.033	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.377	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	82.162	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	81.947	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	67.969	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	67.673	Gadus_morhua
ENSPLAG00000021389	polr1a	89	63.571	ENSGALG00000038160	-	98	63.448	Gallus_gallus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	91.425	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	91.366	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	76.879	ENSGACG00000018791	polr1a	100	76.518	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	89	67.521	ENSGAGG00000004984	-	99	67.408	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.817	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	65.875	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000021389	polr1a	90	77.769	ENSHBUG00000020021	polr1a	98	79.310	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.730	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	64.904	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.542	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	64.716	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	74.749	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	74.439	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	70.409	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	70.116	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.956	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	65.015	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.866	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	64.631	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	84.452	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	84.099	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000021389	polr1a	94	82.525	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	82.370	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000021389	polr1a	53	69.565	ENSLACG00000003218	polr1a	100	69.565	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	69.715	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	69.715	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.870	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	64.870	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.295	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	65.759	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.238	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	65.701	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.238	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	65.701	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.278	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	65.567	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	82.017	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	81.818	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	82.675	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	82.301	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	62.362	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	61.853	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000021389	polr1a	91	64.975	ENSMAUG00000008497	Polr1a	99	64.975	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.409	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	65.159	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.389	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	65.273	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	77.915	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	77.974	Mola_mola
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	61.517	ENSMODG00000009335	POLR1A	81	66.405	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	80.869	ENSMALG00000013363	polr1a	100	80.997	Monopterus_albus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.053	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	64.439	Mus_caroli
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.228	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	64.518	Mus_musculus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.360	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	64.360	Mus_pahari
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	63.434	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	63.890	Mus_spretus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.468	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	65.041	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.760	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	65.320	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.119	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	65.119	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	81.995	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	82.124	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	63.857	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.741	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000021389	polr1a	75	81.890	ENSMEUG00000011665	-	75	81.890	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	59.144	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	59.320	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.767	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	64.668	Octodon_degus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	82.015	ENSONIG00000015895	polr1a	100	81.781	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.192	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	65.192	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	80.731	ENSORLG00000008753	polr1a	99	80.731	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	77.182	ENSORLG00020020726	polr1a	99	77.182	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000021389	polr1a	95	86.170	ENSORLG00015016071	polr1a	98	86.170	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.425	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	64.542	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.311	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.774	Ovis_aries
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.585	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	65.643	Pan_paniscus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.546	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	65.157	Panthera_pardus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.150	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	64.757	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.064	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	65.585	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.527	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	65.759	Papio_anubis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	70.381	ENSPKIG00000005468	polr1a	98	73.611	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000021389	polr1a	63	64.124	ENSPSIG00000009321	-	99	64.917	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000021389	polr1a	55	78.982	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	78.873	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.925	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.808	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000021389	polr1a	95	62.904	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	63.209	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	99.173	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	99.173	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	94.052	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	94.412	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	97.286	ENSPREG00000002389	polr1a	100	97.286	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.411	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	65.469	Pongo_abelii
ENSPLAG00000021389	polr1a	91	65.379	ENSPCAG00000011582	POLR1A	91	65.379	Procavia_capensis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.483	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	65.043	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000021389	polr1a	94	64.370	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	64.528	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	82.616	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	82.242	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	70.994	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	70.994	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.419	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	64.419	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.238	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	65.759	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.238	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	65.759	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	35.812	YOR341W	RPA190	99	36.043	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.353	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	65.411	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	59.666	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	59.609	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	69.267	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	69.509	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	81.346	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	81.135	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	83.069	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	82.892	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	79.565	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	79.343	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000021389	polr1a	71	95.122	ENSSARG00000003136	-	71	95.122	Sorex_araneus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	63.886	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	70.769	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	64	85.000	ENSSPAG00000016341	polr1a	94	85.000	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000021389	polr1a	83	66.155	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	66.177	Sus_scrofa
ENSPLAG00000021389	polr1a	99	64.261	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	64.311	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	76.519	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	76.828	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	70.732	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	70.698	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000021389	polr1a	73	80.531	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	80.531	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	61.957	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	62.638	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000021389	polr1a	69	65.818	ENSUAMG00000012158	-	94	65.818	Ursus_americanus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.593	ENSUMAG00000006700	POLR1A	97	67.945	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.076	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	64.904	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	61.916	ENSXETG00000001952	polr1a	99	63.503	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000021389	polr1a	100	94.218	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	94.454	Xiphophorus_maculatus