EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000022350 (Gene tree)
Gene ID: 106954008
Gene Symbol: nrde2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9187 bases
Position: chrKQ545935.1:182768-191954
Accession: 106954008
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000030874	NRDE-2	PF08424.10	2.7e-101	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000027192	-	3818	XM_015043201	ENSPLAP00000030874	1205 (aa)	XP_014898687	UPI00072D9492

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000022350's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000022350's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.084	ENSG00000119720	NRDE2	100	66.184	Homo_sapiens
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	75.431	ENSAPOG00000009202	nrde2	100	75.760	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	43.126	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	43.934	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000022350	nrde2	97	73.311	ENSACIG00000014783	nrde2	100	73.567	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	75.660	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	75.825	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	75.725	ENSAPEG00000001711	nrde2	100	75.891	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	74.046	ENSATEG00000010247	nrde2	99	74.295	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000022350	nrde2	98	45.588	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	46.556	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.207	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	43.883	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	43.693	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	44.026	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	73.300	ENSACLG00000025154	nrde2	100	73.632	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000022350	nrde2	85	71.429	ENSAMXG00000034642	nrde2	87	71.429	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.177	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	45.581	Bos_taurus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.008	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	46.267	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	42.336	ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	44.455	Canis_familiaris
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.636	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	44.363	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.884	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	45.656	Capra_hircus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.267	ENSTSYG00000000161	NRDE2	88	46.803	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000022350	nrde2	97	44.361	ENSCAPG00000012039	NRDE2	89	47.451	Cavia_aperea
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.236	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	45.209	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.281	ENSCCAG00000024917	NRDE2	100	46.166	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.876	ENSCLAG00000015185	NRDE2	100	45.180	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.249	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	46.650	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000022350	nrde2	74	46.260	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	46.238	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.672	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	44.724	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.205	ENSCANG00000029067	NRDE2	88	48.007	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.161	ENSCGRG00001015658	Nrde2	100	44.499	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.115	ENSCGRG00000005062	Nrde2	87	47.075	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000022350	nrde2	96	65.266	ENSCSEG00000000089	nrde2	100	65.342	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	82.764	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	81.932	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	53.460	ENSDARG00000074726	nrde2	100	53.213	Danio_rerio
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.926	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	44.943	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000022350	nrde2	79	46.170	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.625	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000022350	nrde2	63	50.000	ENSETEG00000000198	NRDE2	64	50.000	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	38.548	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	38.840	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.667	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	46.519	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.634	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	46.519	Equus_caballus
ENSPLAG00000022350	nrde2	65	58.519	ENSEEUG00000004026	-	69	58.519	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	58.477	ENSELUG00000005973	nrde2	100	58.395	Esox_lucius
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.858	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	44.599	Felis_catus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.411	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	46.373	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.754	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	45.380	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	85.584	ENSFHEG00000021385	nrde2	100	85.501	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000022350	nrde2	63	70.782	ENSGMOG00000015815	nrde2	92	70.061	Gadus_morhua
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.919	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	46.343	Gallus_gallus
ENSPLAG00000022350	nrde2	94	86.195	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	90.032	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	71.888	ENSGACG00000012619	nrde2	100	71.888	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.791	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	44.951	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.002	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	46.455	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	73.466	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	73.798	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.717	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	46.072	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.140	ENSHGLG00100017736	NRDE2	90	47.763	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000022350	nrde2	91	65.186	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	64.904	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	49.711	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	49.629	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.087	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	45.180	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.012	ENSJJAG00000000907	Nrde2	87	48.093	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	76.340	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	76.257	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000022350	nrde2	94	71.478	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	70.861	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000022350	nrde2	70	50.703	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.587	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	53.663	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	53.498	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	97	44.865	ENSLAFG00000004966	NRDE2	91	46.357	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000022350	nrde2	78	48.367	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	65.700	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	73.093	ENSMAMG00000013452	nrde2	100	73.011	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	73.217	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.798	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000022350	nrde2	85	47.013	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	46.724	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	43.921	ENSMAUG00000018578	Nrde2	87	47.114	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.046	ENSMICG00000016741	NRDE2	100	46.192	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	43.668	ENSMOCG00000014472	Nrde2	87	45.833	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000022350	nrde2	74	67.517	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	67.738	Mola_mola
ENSPLAG00000022350	nrde2	94	43.475	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	46.866	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000022350	nrde2	91	69.490	ENSMALG00000021869	nrde2	99	69.765	Monopterus_albus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.380	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	88	47.135	Mus_caroli
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.350	ENSMUSG00000021179	Nrde2	87	47.349	Mus_musculus
ENSPLAG00000022350	nrde2	88	47.125	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	88	47.184	Mus_pahari
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.161	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	93	58.824	Mus_spretus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.161	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	44.381	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.230	ENSMLUG00000007484	NRDE2	88	46.924	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.967	ENSNGAG00000002993	Nrde2	87	46.846	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000022350	nrde2	92	71.441	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	72.786	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.735	ENSNLEG00000017032	NRDE2	87	47.110	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000022350	nrde2	73	48.016	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	48.016	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000022350	nrde2	59	60.000	ENSOPRG00000001375	-	60	62.376	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000022350	nrde2	97	44.007	ENSODEG00000012422	NRDE2	90	46.481	Octodon_degus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	73.510	ENSONIG00000019512	nrde2	100	73.510	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.575	ENSOCUG00000010083	NRDE2	88	47.632	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000022350	nrde2	95	67.103	ENSORLG00000017730	nrde2	99	66.870	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	69.326	ENSORLG00020015965	nrde2	100	69.167	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	70.239	ENSORLG00015012437	nrde2	100	69.827	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	72.848	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	72.930	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.008	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	45.946	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000022350	nrde2	97	43.061	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	43.603	Ovis_aries
ENSPLAG00000022350	nrde2	97	45.992	ENSPPAG00000034133	NRDE2	98	49.220	Pan_paniscus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.858	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	45.164	Panthera_pardus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.020	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	45.328	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.002	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	46.455	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	50.988	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	51.400	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.845	ENSPSIG00000005588	NRDE2	100	44.408	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000022350	nrde2	97	62.319	ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.234	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.947	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.491	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000022350	nrde2	53	43.485	ENSPMAG00000003270	-	99	43.906	Petromyzon_marinus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.230	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.884	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	96.598	ENSPFOG00000013217	nrde2	100	96.598	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	98.755	ENSPMEG00000000778	nrde2	100	98.755	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000022350	nrde2	100	97.012	ENSPREG00000009066	nrde2	100	97.012	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000022350	nrde2	84	46.229	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	46.570	Pongo_abelii
ENSPLAG00000022350	nrde2	69	67.692	ENSPCAG00000016399	NRDE2	70	67.692	Procavia_capensis
ENSPLAG00000022350	nrde2	94	45.267	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	44.723	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000022350	nrde2	96	42.409	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	41.922	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000022350	nrde2	98	71.573	ENSPNYG00000022833	nrde2	99	72.161	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000022350	nrde2	91	54.013	ENSPNAG00000015807	nrde2	95	53.944	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000022350	nrde2	90	44.004	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	44.054	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	46.358	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	46.318	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.806	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	46.047	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	51.471	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.023	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	71.803	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	71.020	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	75.144	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	75.144	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000022350	nrde2	92	73.423	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	75.345	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000022350	nrde2	91	46.577	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	47.637	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	94	73.286	ENSSPAG00000000539	nrde2	100	73.643	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.545	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	46.078	Sus_scrofa
ENSPLAG00000022350	nrde2	98	46.096	ENSTGUG00000012462	-	99	46.321	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000022350	nrde2	78	68.337	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	68.230	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000022350	nrde2	88	40.713	ENSTBEG00000011834	NRDE2	82	51.402	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.033	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	45.492	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000022350	nrde2	88	44.776	ENSUAMG00000004159	NRDE2	92	45.690	Ursus_americanus
ENSPLAG00000022350	nrde2	91	43.258	ENSUMAG00000006393	NRDE2	96	44.099	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	43.598	ENSVVUG00000018202	NRDE2	87	46.339	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000022350	nrde2	91	44.665	ENSXETG00000015708	nrde2	91	45.363	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000022350	nrde2	94	85.752	ENSXCOG00000013298	nrde2	100	85.929	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000022350	nrde2	99	94.260	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	94.093	Xiphophorus_maculatus