EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000022679 (Gene tree)
Gene ID: 106958649
Gene Symbol: polr1e
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5832 bases
Position: chrKQ546318.1:126272-132103
Accession: 106958649
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000018116	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	5.8e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000031723	-	3178	XM_015050660	ENSPLAP00000018116	415 (aa)	XP_014906146	UPI00072E0837

Gene Model

Click here to download ENSPLAG00000022679's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPLAG00000022679's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.341	ENSG00000137054	POLR1E	98	43.341	Homo_sapiens
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	68.750	ENSAPOG00000012452	polr1e	100	68.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	40.435	ENSAMEG00000010193	POLR1E	95	40.435	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	66.268	ENSACIG00000009884	polr1e	99	70.408	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	75.000	ENSAOCG00000005665	polr1e	100	75.000	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	75.481	ENSAPEG00000020581	polr1e	100	75.481	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	76.923	ENSATEG00000020609	polr1e	100	76.923	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000022679	polr1e	81	39.740	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.740	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.961	ENSANAG00000038046	POLR1E	98	43.961	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	73.798	ENSACLG00000013685	polr1e	99	73.798	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	55.797	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	55.797	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	47.059	ENSBTAG00000012243	POLR1E	97	47.059	Bos_taurus
ENSPLAG00000022679	polr1e	94	41.772	ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	45.380	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.720	ENSCAFG00000002377	POLR1E	98	43.720	Canis_familiaris
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.961	ENSCAFG00020017851	POLR1E	98	43.961	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	46.135	ENSCHIG00000019479	POLR1E	98	46.135	Capra_hircus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.203	ENSTSYG00000002075	POLR1E	98	44.203	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000022679	polr1e	70	42.088	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	42.088	Cavia_aperea
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	45.169	ENSCPOG00000009965	POLR1E	98	44.762	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	39.078	ENSCCAG00000029460	POLR1E	98	39.078	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.584	ENSCATG00000031732	POLR1E	97	46.825	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000022679	polr1e	87	47.514	ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	47.514	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.826	ENSCSAG00000010782	POLR1E	98	43.826	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	37.626	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	37.626	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	46.062	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	46.062	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	44.068	ENSCANG00000036112	POLR1E	97	47.619	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	42.410	ENSCGRG00001006197	Polr1e	95	42.410	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	41.928	ENSCGRG00000006430	Polr1e	95	41.928	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	67.150	ENSCSEG00000005121	polr1e	99	67.150	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	83.373	ENSCVAG00000019759	polr1e	100	83.373	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	97	56.576	ENSDARG00000006434	polr1e	100	56.386	Danio_rerio
ENSPLAG00000022679	polr1e	96	37.797	ENSDNOG00000010257	POLR1E	96	37.797	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000022679	polr1e	85	42.105	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.659	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.961	ENSEASG00005000675	POLR1E	98	43.961	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.961	ENSECAG00000014669	POLR1E	98	43.961	Equus_caballus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	38.702	ENSEEUG00000011928	POLR1E	86	38.702	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	66.184	ENSELUG00000008150	polr1e	99	66.184	Esox_lucius
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.578	ENSFCAG00000013081	POLR1E	95	45.750	Felis_catus
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	43.890	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	43.890	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	46.190	ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	46.190	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	83.894	ENSFHEG00000009801	polr1e	100	83.894	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	53.810	ENSGMOG00000003336	POLR1E	99	53.810	Gadus_morhua
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.630	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	44.630	Gallus_gallus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	90.602	ENSGAFG00000004850	polr1e	100	90.602	Gambusia_affinis
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	67.303	ENSGACG00000016087	polr1e	100	67.303	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	97	42.015	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	41.727	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.269	ENSGGOG00000001882	POLR1E	98	45.736	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	73.798	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	73.798	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	46.814	ENSHGLG00000002036	POLR1E	97	46.814	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	47.059	ENSHGLG00100012784	POLR1E	97	47.059	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	68.916	ENSHCOG00000002774	polr1e	100	68.916	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	54.106	ENSIPUG00000003019	polr1e	99	54.106	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	45.169	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	45.169	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	44.769	ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.769	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	79.808	ENSKMAG00000000046	polr1e	100	79.808	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	73.494	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	73.494	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000022679	polr1e	86	50.689	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.689	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	52.518	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	52.518	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	45.865	ENSLAFG00000012831	POLR1E	94	46.115	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.584	ENSMFAG00000045465	POLR1E	97	46.825	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.584	ENSMMUG00000017892	POLR1E	97	46.825	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000022679	polr1e	97	40.048	ENSMNEG00000040283	POLR1E	96	40.048	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.584	ENSMLEG00000031135	POLR1E	97	46.825	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	74.699	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	74.699	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	73.798	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	73.798	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	42.995	ENSMAUG00000021044	Polr1e	95	42.995	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.928	ENSMICG00000003673	POLR1E	98	44.928	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	41.505	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	41.505	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	72.662	ENSMMOG00000007391	polr1e	100	72.662	Mola_mola
ENSPLAG00000022679	polr1e	96	45.522	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	45.522	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	76.202	ENSMALG00000002665	polr1e	99	76.202	Monopterus_albus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	42.512	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	42.929	Mus_caroli
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	42.892	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	43.325	Mus_musculus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.125	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	44.612	Mus_pahari
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.133	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	43.577	Mus_spretus
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	41.203	ENSMPUG00000006040	POLR1E	95	38.889	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	46.377	ENSMLUG00000012688	POLR1E	95	46.377	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	45.255	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	45.255	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	74.279	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	74.279	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.341	ENSNLEG00000003616	POLR1E	97	46.032	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000022679	polr1e	73	50.222	ENSMEUG00000015372	-	59	50.222	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000022679	polr1e	86	39.167	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	39.167	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	46.959	ENSODEG00000014565	POLR1E	94	46.959	Octodon_degus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	74.519	ENSONIG00000008921	polr1e	99	74.519	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	44.444	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	44.444	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	72.115	ENSORLG00000005143	polr1e	100	72.115	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000022679	polr1e	93	69.171	ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.171	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	72.115	ENSORLG00015000137	polr1e	100	72.115	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	69.712	ENSOMEG00000013264	polr1e	98	69.712	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.686	ENSOGAG00000012981	POLR1E	92	45.865	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	46.377	ENSOARG00000011465	POLR1E	95	46.377	Ovis_aries
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.341	ENSPPAG00000034566	POLR1E	97	46.032	Pan_paniscus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.578	ENSPPRG00000005649	POLR1E	98	44.578	Panthera_pardus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.578	ENSPTIG00000009774	POLR1E	98	44.578	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.341	ENSPTRG00000020944	POLR1E	97	46.032	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.584	ENSPANG00000025563	POLR1E	97	46.825	Papio_anubis
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	58.531	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.531	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	44.743	ENSPSIG00000003274	POLR1E	95	44.743	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	62.944	ENSPMGG00000024169	polr1e	95	62.944	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	43.029	ENSPEMG00000019151	-	95	43.029	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	36.983	ENSPEMG00000022300	-	94	36.983	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	46.135	ENSPCIG00000014798	POLR1E	99	46.135	Phascolarctos_cinereus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	93.424	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	93.424	Poecilia_formosa
ENSPLAG00000022679	polr1e	87	98.886	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	98.886	Poecilia_mexicana
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	94.699	ENSPREG00000009470	polr1e	100	94.699	Poecilia_reticulata
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.826	ENSPPYG00000019061	POLR1E	98	43.826	Pongo_abelii
ENSPLAG00000022679	polr1e	56	38.494	ENSPCAG00000004891	POLR1E	77	38.494	Procavia_capensis
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	45.036	ENSPCOG00000027448	POLR1E	98	45.036	Propithecus_coquereli
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	45.202	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	45.202	Pteropus_vampyrus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	74.038	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	74.038	Pundamilia_nyererei
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	55.663	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	55.663	Pygocentrus_nattereri
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	42.512	ENSRNOG00000012664	Polr1e	95	42.512	Rattus_norvegicus
ENSPLAG00000022679	polr1e	94	44.557	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	45.000	Rhinopithecus_bieti
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	43.826	ENSRROG00000031986	POLR1E	97	46.825	Rhinopithecus_roxellana
ENSPLAG00000022679	polr1e	97	43.902	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	43.902	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPLAG00000022679	polr1e	82	44.058	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	44.058	Sarcophilus_harrisii
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	60.432	ENSSFOG00015002293	polr1e	99	60.432	Scleropages_formosus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	75.121	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	75.121	Scophthalmus_maximus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	74.038	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	74.038	Seriola_dumerili
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	74.038	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	74.038	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPLAG00000022679	polr1e	56	39.224	ENSSARG00000009810	-	58	39.224	Sorex_araneus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	45.238	ENSSPUG00000009499	POLR1E	100	45.238	Sphenodon_punctatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	76.867	ENSSPAG00000021240	polr1e	100	76.867	Stegastes_partitus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.686	ENSSSCG00000005347	POLR1E	98	44.686	Sus_scrofa
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	38.031	ENSTGUG00000007169	POLR1E	100	38.031	Taeniopygia_guttata
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	67.703	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	67.703	Takifugu_rubripes
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	69.952	ENSTNIG00000017812	polr1e	99	69.952	Tetraodon_nigroviridis
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	45.707	ENSTBEG00000013786	POLR1E	84	45.707	Tupaia_belangeri
ENSPLAG00000022679	polr1e	95	45.113	ENSTTRG00000008294	POLR1E	84	45.113	Tursiops_truncatus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.928	ENSUAMG00000012474	POLR1E	98	47.354	Ursus_americanus
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	44.928	ENSUMAG00000011496	POLR1E	98	44.928	Ursus_maritimus
ENSPLAG00000022679	polr1e	81	42.522	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	42.522	Vicugna_pacos
ENSPLAG00000022679	polr1e	98	44.039	ENSVVUG00000019954	POLR1E	97	44.039	Vulpes_vulpes
ENSPLAG00000022679	polr1e	99	42.619	ENSXETG00000006533	polr1e	99	42.619	Xenopus_tropicalis
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	87.260	ENSXCOG00000013706	polr1e	100	87.260	Xiphophorus_couchianus
ENSPLAG00000022679	polr1e	100	94.458	ENSXMAG00000012484	polr1e	100	94.458	Xiphophorus_maculatus