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Description

Ensembl ID: ENSPLAG00000023422 (Gene tree)
Gene ID: 106941332
Gene Symbol: aco1
Alias: -
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_latipinna
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 32952 bases
Position: chrKQ548839.1:189-33140
Accession: 106941332
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPLAP00000031208	Aconitase	PF00330.20	1.1e-170	1	1
ENSPLAP00000031219	Aconitase	PF00330.20	4e-170	1	1
ENSPLAP00000018370	Aconitase	PF00330.20	1.5e-166	1	1
ENSPLAP00000031181	Aconitase	PF00330.20	5.4e-166	1	1
ENSPLAP00000031219	Aconitase_C	PF00694.19	7.3e-45	1	1
ENSPLAP00000031208	Aconitase_C	PF00694.19	7.9e-45	1	1
ENSPLAP00000018370	Aconitase_C	PF00694.19	8.4e-45	1	1
ENSPLAP00000031181	Aconitase_C	PF00694.19	1.9e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPLAT00000027826	-	2220	-	ENSPLAP00000031181	739 (aa)	-	-
ENSPLAT00000027900	-	2463	XM_015024310	ENSPLAP00000031219	820 (aa)	XP_014879796	-
ENSPLAT00000027843	-	2613	-	ENSPLAP00000018370	870 (aa)	-	-
ENSPLAT00000027881	-	2535	-	ENSPLAP00000031208	844 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPLAG00000023422	aco1	97	59.467	ENSPLAG00000002220	ireb2	81	59.467

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.581	ENSG00000122729	ACO1	90	82.581	Homo_sapiens
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.263	ENSAPOG00000008670	aco1	90	89.263	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.228	ENSAMEG00000003746	ACO1	90	82.228	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPLAG00000023422	aco1	98	88.514	ENSACIG00000014377	aco1	90	88.514	Amphilophus_citrinellus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.888	ENSAOCG00000007699	aco1	90	89.888	Amphiprion_ocellaris
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.763	ENSAPEG00000014370	aco1	90	89.763	Amphiprion_percula
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.638	ENSATEG00000000560	aco1	90	89.638	Anabas_testudineus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.080	ENSAPLG00000015490	ACO1	90	82.080	Anas_platyrhynchos
ENSPLAG00000023422	aco1	93	81.021	ENSACAG00000001541	ACO1	89	81.021	Anolis_carolinensis
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.579	ENSANAG00000003359	ACO1	90	81.579	Aotus_nancymaae
ENSPLAG00000023422	aco1	98	87.516	ENSACLG00000007755	aco1	90	87.516	Astatotilapia_calliptera
ENSPLAG00000023422	aco1	98	85.518	ENSAMXG00000002499	aco1	90	85.518	Astyanax_mexicanus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	81.375	ENSBTAG00000000555	ACO1	90	81.375	Bos_taurus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.331	ENSCJAG00000007687	ACO1	90	82.331	Callithrix_jacchus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	81.297	ENSCAFG00000001786	ACO1	89	81.297	Canis_familiaris
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.704	ENSCAFG00020014553	ACO1	90	81.704	Canis_lupus_dingo
ENSPLAG00000023422	aco1	98	81.500	ENSCHIG00000007667	ACO1	90	81.500	Capra_hircus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.206	ENSTSYG00000004179	ACO1	89	82.206	Carlito_syrichta
ENSPLAG00000023422	aco1	99	63.399	ENSCAPG00000007254	ACO1	89	65.250	Cavia_aperea
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	ENSCPOG00000003768	ACO1	90	81.955	Cavia_porcellus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.080	ENSCCAG00000022465	ACO1	90	82.080	Cebus_capucinus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.456	ENSCATG00000045333	ACO1	90	82.456	Cercocebus_atys
ENSPLAG00000023422	aco1	98	81.250	ENSCLAG00000002487	ACO1	90	81.250	Chinchilla_lanigera
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.080	ENSCSAG00000009824	ACO1	89	82.080	Chlorocebus_sabaeus
ENSPLAG00000023422	aco1	87	91.111	ENSCHOG00000008996	ACO1	80	91.111	Choloepus_hoffmanni
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.830	ENSCPBG00000008077	ACO1	90	81.830	Chrysemys_picta_bellii
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.434	ENSCANG00000014847	ACO1	90	82.434	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	82.625	ENSCGRG00001024337	Aco1	90	82.625	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPLAG00000023422	aco1	98	81.750	ENSCGRG00000004877	-	90	81.750	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPLAG00000023422	aco1	98	85.893	ENSCSEG00000018262	aco1	90	85.679	Cynoglossus_semilaevis
ENSPLAG00000023422	aco1	98	85.019	ENSCVAG00000020264	aco1	89	85.019	Cyprinodon_variegatus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	86.017	ENSDARG00000026376	aco1	90	86.017	Danio_rerio
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.456	ENSDNOG00000003951	ACO1	90	82.456	Dasypus_novemcinctus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	83.083	ENSDORG00000014246	Aco1	90	83.083	Dipodomys_ordii
ENSPLAG00000023422	aco1	90	63.655	ENSETEG00000012415	-	75	64.403	Echinops_telfairi
ENSPLAG00000023422	aco1	99	69.231	ENSEBUG00000015441	aco1	82	76.087	Eptatretus_burgeri
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.080	ENSEASG00005004602	ACO1	90	82.080	Equus_asinus_asinus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	ENSECAG00000014846	ACO1	90	81.955	Equus_caballus
ENSPLAG00000023422	aco1	96	76.520	ENSEEUG00000015174	ACO1	90	70.175	Erinaceus_europaeus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	84.270	ENSELUG00000016812	aco1	88	84.270	Esox_lucius
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.704	ENSFCAG00000001293	ACO1	90	81.704	Felis_catus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	ENSFALG00000001167	ACO1	90	81.955	Ficedula_albicollis
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.454	ENSFDAG00000016058	ACO1	90	81.454	Fukomys_damarensis
ENSPLAG00000023422	aco1	98	91.760	ENSFHEG00000005619	aco1	90	91.760	Fundulus_heteroclitus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.080	ENSGMOG00000005514	aco1	90	81.875	Gadus_morhua
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	ENSGALG00000002162	ACO1	90	81.955	Gallus_gallus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	87.516	ENSGACG00000001637	aco1	90	87.516	Gasterosteus_aculeatus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	ENSGAGG00000023315	ACO1	90	81.955	Gopherus_agassizii
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.456	ENSGGOG00000016306	ACO1	90	82.456	Gorilla_gorilla
ENSPLAG00000023422	aco1	98	87.391	ENSHBUG00000008952	aco1	90	87.391	Haplochromis_burtoni
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	ENSHGLG00000018922	Aco1	90	81.955	Heterocephalus_glaber_female
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	ENSHGLG00100000149	Aco1	90	81.955	Heterocephalus_glaber_male
ENSPLAG00000023422	aco1	98	85.019	ENSHCOG00000015881	aco1	90	85.019	Hippocampus_comes
ENSPLAG00000023422	aco1	98	84.625	ENSIPUG00000020088	ACO1	90	84.625	Ictalurus_punctatus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.331	ENSSTOG00000006942	ACO1	89	82.331	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	82.750	ENSJJAG00000013824	Aco1	90	82.750	Jaculus_jaculus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.513	ENSKMAG00000015759	aco1	90	89.513	Kryptolebias_marmoratus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	86.070	ENSLBEG00000013866	aco1	90	86.177	Labrus_bergylta
ENSPLAG00000023422	aco1	81	69.985	ENSLACG00000000936	ACO1	99	69.806	Latimeria_chalumnae
ENSPLAG00000023422	aco1	98	82.750	ENSLOCG00000011082	aco1	90	82.750	Lepisosteus_oculatus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	79.574	ENSLAFG00000013470	ACO1	90	79.574	Loxodonta_africana
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.456	ENSMFAG00000001702	ACO1	90	82.456	Macaca_fascicularis
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.581	ENSMMUG00000008196	ACO1	90	82.581	Macaca_mulatta
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.456	ENSMNEG00000045040	ACO1	90	82.456	Macaca_nemestrina
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.456	ENSMLEG00000005636	ACO1	90	82.456	Mandrillus_leucophaeus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	90.012	ENSMAMG00000002915	aco1	90	90.012	Mastacembelus_armatus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	83.767	ENSMZEG00005012733	aco1	90	83.395	Maylandia_zebra
ENSPLAG00000023422	aco1	97	65.475	ENSMGAG00000008851	ACO1	90	65.475	Meleagris_gallopavo
ENSPLAG00000023422	aco1	98	82.375	ENSMAUG00000021408	Aco1	90	82.375	Mesocricetus_auratus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.206	ENSMICG00000006540	ACO1	90	82.206	Microcebus_murinus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	83.250	ENSMOCG00000015393	Aco1	90	83.250	Microtus_ochrogaster
ENSPLAG00000023422	aco1	98	88.764	ENSMMOG00000020282	aco1	90	88.764	Mola_mola
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.579	ENSMODG00000004463	ACO1	90	81.579	Monodelphis_domestica
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.263	ENSMALG00000019764	aco1	90	89.263	Monopterus_albus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	83.375	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	90	83.375	Mus_caroli
ENSPLAG00000023422	aco1	98	83.625	ENSMUSG00000028405	Aco1	90	83.625	Mus_musculus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	82.875	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	90	82.875	Mus_pahari
ENSPLAG00000023422	aco1	98	83.375	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	87	91.525	Mus_spretus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.707	ENSMPUG00000004340	ACO1	90	82.707	Mustela_putorius_furo
ENSPLAG00000023422	aco1	97	80.451	ENSMLUG00000003029	ACO1	90	80.451	Myotis_lucifugus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	82.250	ENSNGAG00000005703	Aco1	90	82.250	Nannospalax_galili
ENSPLAG00000023422	aco1	90	86.387	ENSNBRG00000008973	aco1	72	86.387	Neolamprologus_brichardi
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.331	ENSNLEG00000003409	ACO1	90	82.331	Nomascus_leucogenys
ENSPLAG00000023422	aco1	87	81.783	ENSMEUG00000014756	ACO1	80	82.463	Notamacropus_eugenii
ENSPLAG00000023422	aco1	97	78.070	ENSOPRG00000016791	ACO1	90	78.070	Ochotona_princeps
ENSPLAG00000023422	aco1	97	79.323	ENSODEG00000001240	-	90	79.323	Octodon_degus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	76.566	ENSODEG00000015432	-	90	75.875	Octodon_degus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	88.390	ENSONIG00000019869	aco1	90	88.390	Oreochromis_niloticus
ENSPLAG00000023422	aco1	88	82.524	ENSOANG00000012132	ACO1	100	82.296	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.436	ENSOCUG00000015960	ACO1	90	80.569	Oryctolagus_cuniculus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.763	ENSORLG00000020656	aco1	90	89.763	Oryzias_latipes
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.638	ENSORLG00020010991	aco1	90	89.638	Oryzias_latipes_hni
ENSPLAG00000023422	aco1	98	89.388	ENSORLG00015011785	aco1	90	89.388	Oryzias_latipes_hsok
ENSPLAG00000023422	aco1	97	89.111	ENSOMEG00000000660	aco1	90	89.111	Oryzias_melastigma
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.331	ENSOGAG00000010522	ACO1	90	82.331	Otolemur_garnettii
ENSPLAG00000023422	aco1	98	81.500	ENSOARG00000014707	ACO1	89	81.500	Ovis_aries
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.581	ENSPPAG00000033498	ACO1	90	82.581	Pan_paniscus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.830	ENSPPRG00000009875	ACO1	90	81.830	Panthera_pardus
ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.704	ENSPTIG00000016606	ACO1	89	81.500	Panthera_tigris_altaica
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.581	ENSPTRG00000020843	ACO1	90	82.581	Pan_troglodytes
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.456	ENSPANG00000025270	ACO1	90	82.456	Papio_anubis
ENSPLAG00000023422	aco1	97	83.208	ENSPKIG00000023168	aco1	89	83.208	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPLAG00000023422	aco1	97	82.331	ENSPSIG00000008030	ACO1	90	82.331	Pelodiscus_sinensis
ENSPLAG00000023422	aco1	98	87.266	ENSPMGG00000020708	aco1	90	87.266	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPLAG00000023422	aco1	98	83.125	ENSPEMG00000018464	Aco1	90	83.125	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSPLAG00000023422	aco1	98	100.000	ENSPFOG00000013405	aco1	89	100.000	Poecilia_formosa
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