EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMAG00000002961 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Petromyzon_marinus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17464 bases
Position: chrGL477473:7119-24582
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMAP00000003267	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMAT00000003282	-	2193	-	ENSPMAP00000003267	730 (aa)	-	S4RDI5

Gene Model

Click here to download ENSPMAG00000002961's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMAG00000002961's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPMAG00000002961	papolg	67	53.862	ENSPMAG00000004864	-	96	53.862

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.318	ENSG00000115421	PAPOLG	99	57.322	Homo_sapiens
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.627	ENSAPOG00000004798	papolg	99	53.662	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.510	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	53.775	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.941	ENSACIG00000010546	papolg	98	52.886	Amphilophus_citrinellus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.238	ENSAOCG00000010254	papolg	89	53.137	Amphiprion_ocellaris
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.368	ENSAPEG00000006944	papolg	89	53.265	Amphiprion_percula
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.880	ENSATEG00000009007	papolg	78	65.149	Anabas_testudineus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.252	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	51.184	Anas_platyrhynchos
ENSPMAG00000002961	papolg	68	47.736	ENSACAG00000015048	-	50	64.026	Anolis_carolinensis
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.533	ENSANAG00000024627	PAPOLG	98	54.032	Aotus_nancymaae
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.010	ENSACLG00000015592	papolg	88	52.685	Astatotilapia_calliptera
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.756	ENSAMXG00000004611	papolg	98	53.576	Astyanax_mexicanus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.745	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	99	53.745	Bos_taurus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.318	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	52.763	Callithrix_jacchus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.510	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	48.792	Canis_familiaris
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.856	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	54.178	Canis_lupus_dingo
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.704	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	53.704	Capra_hircus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.200	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	99	53.166	Carlito_syrichta
ENSPMAG00000002961	papolg	52	66.408	ENSCAPG00000014901	-	99	66.408	Cavia_aperea
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.581	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	53.665	Cavia_porcellus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.397	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	98	53.610	Cebus_capucinus
ENSPMAG00000002961	papolg	81	59.281	ENSCATG00000044395	PAPOLG	91	59.281	Cercocebus_atys
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.203	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	53.203	Chinchilla_lanigera
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.146	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	99	53.491	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMAG00000002961	papolg	89	52.212	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	52.212	Choloepus_hoffmanni
ENSPMAG00000002961	papolg	67	52.390	ENSCING00000024664	-	93	51.456	Ciona_intestinalis
ENSPMAG00000002961	papolg	67	52.200	ENSCSAVG00000009085	-	97	52.200	Ciona_savignyi
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.523	ENSCANG00000038120	PAPOLG	99	53.491	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.659	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	52.972	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.659	ENSCGRG00000005552	-	100	52.972	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.614	ENSCSEG00000000771	papolg	99	53.133	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMAG00000002961	papolg	77	61.806	ENSCVAG00000016602	papolg	89	64.660	Cyprinodon_variegatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.214	ENSDARG00000012141	papolg	98	53.056	Danio_rerio
ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.402	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	98	51.252	Dasypus_novemcinctus
ENSPMAG00000002961	papolg	58	65.340	ENSDORG00000016228	Papolg	97	65.340	Dipodomys_ordii
ENSPMAG00000002961	papolg	99	42.764	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	43.043	Echinops_telfairi
ENSPMAG00000002961	papolg	50	74.277	ENSEBUG00000004020	papolg	75	74.277	Eptatretus_burgeri
ENSPMAG00000002961	papolg	63	50.766	ENSEBUG00000005042	-	77	50.547	Eptatretus_burgeri
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.298	ENSEASG00005002038	PAPOLG	99	53.562	Equus_asinus_asinus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.298	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	53.562	Equus_caballus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	47.410	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	82	66.327	Erinaceus_europaeus
ENSPMAG00000002961	papolg	88	56.652	ENSELUG00000014497	papolg	77	56.502	Esox_lucius
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.501	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	99	53.501	Felis_catus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	48.370	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	48.037	Ficedula_albicollis
ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.101	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	96	53.464	Fukomys_damarensis
ENSPMAG00000002961	papolg	66	53.065	ENSFHEG00000019080	papolg	90	52.885	Fundulus_heteroclitus
ENSPMAG00000002961	papolg	72	62.523	ENSGMOG00000018772	papolg	80	63.206	Gadus_morhua
ENSPMAG00000002961	papolg	99	50.134	ENSGALG00000007853	PAPOLG	98	50.335	Gallus_gallus
ENSPMAG00000002961	papolg	73	62.681	ENSGAFG00000003263	papolg	88	51.546	Gambusia_affinis
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.618	ENSGACG00000002718	papolg	99	52.749	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.397	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	98	53.877	Gorilla_gorilla
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.880	ENSHBUG00000004882	papolg	88	52.685	Haplochromis_burtoni
ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.316	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	54.316	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.316	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	54.316	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.418	ENSHCOG00000006782	papolg	88	52.857	Hippocampus_comes
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.979	ENSIPUG00000021642	papolg	100	52.918	Ictalurus_punctatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.399	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	53.368	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMAG00000002961	papolg	58	65.808	ENSJJAG00000015601	Papolg	97	65.808	Jaculus_jaculus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.974	ENSKMAG00000016439	papolg	95	52.848	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.490	ENSLBEG00000023218	papolg	88	52.799	Labrus_bergylta
ENSPMAG00000002961	papolg	99	47.409	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	47.409	Latimeria_chalumnae
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.186	ENSLOCG00000016130	papolg	98	52.934	Lepisosteus_oculatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.928	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	65.403	Loxodonta_africana
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.714	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	99	53.543	Macaca_fascicularis
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.714	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	99	53.543	Macaca_mulatta
ENSPMAG00000002961	papolg	99	49.332	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	98	49.206	Macaca_nemestrina
ENSPMAG00000002961	papolg	98	54.150	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	98	53.970	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.264	ENSMAMG00000010667	papolg	99	52.941	Mastacembelus_armatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.010	ENSMZEG00005018140	papolg	99	53.701	Maylandia_zebra
ENSPMAG00000002961	papolg	99	49.802	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	49.275	Meleagris_gallopavo
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.425	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	52.880	Mesocricetus_auratus
ENSPMAG00000002961	papolg	98	54.755	ENSMICG00000010042	PAPOLG	98	53.826	Microcebus_murinus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.872	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	53.627	Microtus_ochrogaster
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.140	ENSMMOG00000008020	papolg	99	52.436	Mola_mola
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.694	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	52.556	Monodelphis_domestica
ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.498	ENSMALG00000007012	papolg	87	53.977	Monopterus_albus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.938	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	97	65.105	Mus_caroli
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.088	ENSMUSG00000020273	Papolg	97	65.105	Mus_musculus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.941	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	52.941	Mus_pahari
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.957	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	97	65.105	Mus_spretus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.510	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	89	53.775	Mustela_putorius_furo
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.245	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	53.245	Myotis_lucifugus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.742	ENSNGAG00000001120	Papolg	99	52.666	Nannospalax_galili
ENSPMAG00000002961	papolg	99	45.621	ENSNBRG00000011943	papolg	99	45.232	Neolamprologus_brichardi
ENSPMAG00000002961	papolg	57	65.166	ENSNLEG00000009507	-	97	65.166	Nomascus_leucogenys
ENSPMAG00000002961	papolg	54	87.681	ENSMEUG00000013605	-	58	87.681	Notamacropus_eugenii
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.687	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	99	51.613	Ochotona_princeps
ENSPMAG00000002961	papolg	57	65.311	ENSODEG00000012424	PAPOLG	97	65.311	Octodon_degus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	47.098	ENSONIG00000002985	papolg	98	46.772	Oreochromis_niloticus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.368	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	53.706	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.887	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	99	52.713	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.948	ENSORLG00000001577	papolg	88	52.196	Oryzias_latipes
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.857	ENSORLG00020002482	papolg	88	52.202	Oryzias_latipes_hni
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.720	ENSORLG00015008836	papolg	88	52.196	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.135	ENSOMEG00000001406	papolg	88	52.611	Oryzias_melastigma
ENSPMAG00000002961	papolg	58	50.113	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	50.000	Otolemur_garnettii
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.704	ENSOARG00000001563	PAPOLG	89	53.704	Ovis_aries
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.533	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	98	54.011	Pan_paniscus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.501	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	99	53.501	Panthera_pardus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.369	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	53.369	Panthera_tigris_altaica
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.533	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	98	54.011	Pan_troglodytes
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.619	ENSPANG00000014543	PAPOLG	98	53.448	Papio_anubis
ENSPMAG00000002961	papolg	90	55.638	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	92	54.810	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.667	ENSPKIG00000003313	papolg	99	54.172	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMAG00000002961	papolg	98	50.970	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	50.775	Pelodiscus_sinensis
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.880	ENSPEMG00000008960	-	100	53.455	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.796	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	52.399	Phascolarctos_cinereus
ENSPMAG00000002961	papolg	77	61.313	ENSPFOG00000012909	papolg	99	51.790	Poecilia_formosa
ENSPMAG00000002961	papolg	77	61.246	ENSPLAG00000018445	papolg	88	52.163	Poecilia_latipinna
ENSPMAG00000002961	papolg	77	61.246	ENSPMEG00000003961	papolg	88	51.842	Poecilia_mexicana
ENSPMAG00000002961	papolg	75	61.796	ENSPREG00000010358	papolg	88	52.041	Poecilia_reticulata
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.886	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	52.078	Pongo_abelii
ENSPMAG00000002961	papolg	91	63.278	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	64	63.278	Procavia_capensis
ENSPMAG00000002961	papolg	99	50.202	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	98	49.333	Propithecus_coquereli
ENSPMAG00000002961	papolg	72	62.431	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	73	62.316	Pteropus_vampyrus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.010	ENSPNYG00000006729	papolg	98	53.012	Pundamilia_nyererei
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.825	ENSPNAG00000015521	papolg	98	52.174	Pygocentrus_nattereri
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.957	ENSRNOG00000006261	Papolg	99	52.957	Rattus_norvegicus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.936	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	98	52.590	Rhinopithecus_bieti
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.629	ENSRROG00000035954	PAPOLG	99	53.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.919	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	98	53.981	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMAG00000002961	papolg	94	52.925	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	52.646	Sarcophilus_harrisii
ENSPMAG00000002961	papolg	98	49.185	ENSSFOG00015011874	papolg	75	58.595	Scleropages_formosus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.121	ENSSFOG00015002383	papolg	99	52.926	Scleropages_formosus
ENSPMAG00000002961	papolg	75	61.972	ENSSMAG00000015598	papolg	94	52.506	Scophthalmus_maximus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.414	ENSSDUG00000000912	papolg	99	53.333	Seriola_dumerili
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.501	ENSSLDG00000001217	papolg	99	51.910	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMAG00000002961	papolg	98	52.863	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	98	52.730	Sphenodon_punctatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.840	ENSSPAG00000009004	papolg	99	52.964	Stegastes_partitus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.981	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	53.795	Sus_scrofa
ENSPMAG00000002961	papolg	71	57.356	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	96	57.542	Taeniopygia_guttata
ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.980	ENSTRUG00000006410	papolg	98	52.988	Takifugu_rubripes
ENSPMAG00000002961	papolg	99	48.969	ENSTNIG00000017106	papolg	99	49.229	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMAG00000002961	papolg	99	48.942	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	48.627	Tupaia_belangeri
ENSPMAG00000002961	papolg	99	50.399	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	99	50.665	Tursiops_truncatus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.619	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	54.072	Ursus_americanus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.510	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	53.775	Ursus_maritimus
ENSPMAG00000002961	papolg	99	50.066	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	50.329	Vicugna_pacos
ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.083	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	53.642	Vulpes_vulpes
ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.828	ENSXETG00000002208	papolg	99	51.828	Xenopus_tropicalis
ENSPMAG00000002961	papolg	69	63.743	ENSXCOG00000006611	papolg	73	63.743	Xiphophorus_couchianus
ENSPMAG00000002961	papolg	69	62.257	ENSXMAG00000007383	papolg	83	62.257	Xiphophorus_maculatus