EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000000352 (Gene tree)
Gene ID: 106929928
Gene Symbol: htatsf1
Alias: -
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4583 bases
Position: chrKQ552169.1:176853-181435
Accession: 106929928
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000013557	RRM_1	PF00076.22	2.9e-15	1	2
ENSPMEP00000013557	RRM_1	PF00076.22	2.9e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000032304	-	2220	XM_015007174	ENSPMEP00000013557	444 (aa)	XP_014862660	UPI00072E705E

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.286	ENSG00000102241	HTATSF1	100	59.350	Homo_sapiens
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	81.858	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	81.858	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.131	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.522	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.392	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	81.046	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	81.140	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	82.018	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000000352	htatsf1	94	81.100	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	81.100	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	91	63.095	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	64.286	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000000352	htatsf1	81	62.331	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.850	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.176	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	81.057	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	70.000	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	70.499	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	63.793	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	50	64.039	Bos_taurus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	90	60.827	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	51	62.437	Bos_taurus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	63.793	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	50	64.039	Bos_taurus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	79	37.640	WBGene00022025	Y65B4A.1	77	36.712	Caenorhabditis_elegans
ENSPMEG00000000352	htatsf1	81	64.130	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	64.691	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	86	64.377	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	64.213	Canis_familiaris
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	64.039	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	51	64.286	Capra_hircus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	81	63.859	ENSCCAG00000022701	-	50	64.858	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	81	63.243	ENSCCAG00000025329	-	55	63.520	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.492	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	64.232	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000000352	htatsf1	92	60.900	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.374	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.492	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	64.232	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	61.926	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	61.842	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000000352	htatsf1	80	42.993	ENSCING00000005914	-	86	46.089	Ciona_intestinalis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	40.693	ENSCSAVG00000000371	-	98	39.186	Ciona_savignyi
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.021	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	64.736	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	88.063	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	88.063	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	68.202	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	68.421	Danio_rerio
ENSPMEG00000000352	htatsf1	84	45.263	FBgn0037081	barc	67	45.789	Drosophila_melanogaster
ENSPMEG00000000352	htatsf1	90	55.231	ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.474	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	62.876	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	65.236	Esox_lucius
ENSPMEG00000000352	htatsf1	86	63.613	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	63.959	Felis_catus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	61.853	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	61.638	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	97	61.048	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	62.295	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	89.686	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.686	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	76.374	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	76.374	Gadus_morhua
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	61.656	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.790	Gallus_gallus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	95.045	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	95.045	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	77.181	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	77.181	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.286	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	64.987	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.396	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	81.278	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	70.721	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	71.847	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	64.905	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	66.385	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.267	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	53	63.636	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	85.301	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.301	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	77.313	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.022	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	61.556	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.556	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	45.957	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.148	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	86	64.213	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.675	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.492	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	64.232	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.492	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	64.232	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.492	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	64.070	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.492	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	50	64.232	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	78.781	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	78.781	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.396	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	81.278	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000000352	htatsf1	95	62.156	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	63.218	Meleagris_gallopavo
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.171	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.721	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	91	60.859	ENSMICG00000009348	HTATSF1	53	60.859	Microcebus_murinus
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	61.926	ENSMODG00000014087	-	98	61.269	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	77.506	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	77.506	Monopterus_albus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.904	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.631	Mus_caroli
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.467	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	50	64.213	Mus_musculus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	95	57.209	ENSMLUG00000009234	-	52	60.859	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.102	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.562	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.088	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	80.973	Neolamprologus_brichardi
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	92	62.291	ENSMEUG00000004133	-	97	62.291	Notamacropus_eugenii
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	91	60.714	ENSOANG00000011674	-	99	60.714	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	77.632	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.632	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	77.434	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.434	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	79.470	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	79.470	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	64.039	ENSOARG00000011215	-	50	64.286	Ovis_aries
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.286	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	50	64.987	Pan_paniscus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	86	64.122	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	64.467	Panthera_pardus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.286	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	50	64.987	Pan_troglodytes
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	75	67.052	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	97	66.957	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	74.222	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	74.222	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.636	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	64.070	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	64.128	ENSPCIG00000030173	-	89	64.128	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	58.370	ENSPCIG00000018896	-	99	58.370	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	98.874	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	98.874	Poecilia_formosa
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	97.072	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	97.072	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.021	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	50	64.573	Pongo_abelii
ENSPMEG00000000352	htatsf1	85	58.808	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	52	59.067	Procavia_capensis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.369	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	64.286	Propithecus_coquereli
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	61.235	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.595	Pteropus_vampyrus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.176	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	81.057	Pundamilia_nyererei
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	70.474	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	71.336	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.492	ENSRROG00000021939	HTATSF1	50	64.232	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMEG00000000352	htatsf1	81	64.402	ENSSBOG00000027186	-	50	64.948	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	59.825	ENSSHAG00000018908	-	98	59.825	Sarcophilus_harrisii
ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	65.000	ENSSHAG00000006440	-	97	65.810	Sarcophilus_harrisii
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	60.435	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	60.566	Sphenodon_punctatus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.921	ENSSPAG00000000732	htatsf1	100	81.798	Stegastes_partitus
ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.800	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	56.367	Sus_scrofa
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ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	94.820	ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	94.820	Xiphophorus_maculatus