EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000001787 (Gene tree)
Gene ID: 106916537
Gene Symbol: ago1
Alias: -
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21572 bases
Position: chrKQ550997.1:442343-463914
Accession: 106916537
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000021512	PAZ	PF02170.22	6.4e-29	1	1
ENSPMEP00000021506	PAZ	PF02170.22	7.7e-29	1	1
ENSPMEP00000021512	Piwi	PF02171.17	1e-110	1	1
ENSPMEP00000021506	Piwi	PF02171.17	1.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000015080	-	5877	XM_014984898	ENSPMEP00000021506	858 (aa)	XP_014840384	UPI0003B4A598
ENSPMET00000015087	-	2088	-	ENSPMEP00000021512	695 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPMEG00000001787	ago1	99	85.486	ENSPMEG00000007977	ago2	99	81.235
ENSPMEG00000001787	ago1	99	85.253	ENSPMEG00000005049	ago4	99	81.401
ENSPMEG00000001787	ago1	99	87.213	ENSPMEG00000004268	-	100	81.007
ENSPMEG00000001787	ago1	99	89.695	ENSPMEG00000001806	ago3a	100	83.506

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSG00000092847	AGO1	100	97.187	Homo_sapiens
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.767	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	96.270	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000001787	ago1	99	94.898	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.767	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.767	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.767	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.767	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.767	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.767	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	89.675	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.675	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSANAG00000037711	AGO1	100	96.270	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.534	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.534	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.854	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.854	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	Bos_taurus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	96.270	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	96.270	Canis_familiaris
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	Capra_hircus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000001787	ago1	99	77.713	ENSTSYG00000032426	-	99	78.143	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000001787	ago1	87	98.347	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.270	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	96.270	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.187	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.270	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	96.270	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000001787	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCANG00000039798	AGO1	100	96.270	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	96.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.694	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.683	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.683	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.650	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	98.951	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	Danio_rerio
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.187	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000001787	ago1	91	97.466	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000001787	ago1	82	89.958	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.335	Echinops_telfairi
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSEASG00005012086	AGO1	100	96.270	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSECAG00000024353	AGO1	100	96.270	Equus_caballus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	88.567	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	Erinaceus_europaeus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.421	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.744	Esox_lucius
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	96.270	Felis_catus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	94.501	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.421	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.755	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	85.405	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.649	Gadus_morhua
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSGALG00000002249	AGO1	100	96.154	Gallus_gallus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	100.000	ENSGAFG00000009775	ago1	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.991	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	Gopherus_agassizii
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	96.270	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.534	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.534	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	96.270	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	96.270	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.764	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.764	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.301	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	96.270	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	96.154	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.883	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.883	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.883	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.883	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000001787	ago1	99	91.198	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000001787	ago1	100	94.755	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	96.270	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000001787	ago1	99	92.475	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.171	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.187	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	96.270	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.767	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.767	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.534	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.534	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000001787	ago1	99	92.785	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	Meleagris_gallopavo
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	96.270	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMICG00000016147	AGO1	100	96.270	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	96.154	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000001787	ago1	96	99.552	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.701	Mola_mola
ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.974	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.921	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.646	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.646	Monopterus_albus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.772	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000001787	ago1	61	94.837	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.837	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	96.037	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.276	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.872	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000001787	ago1	90	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSPMEG00000001787	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSODEG00000005321	AGO1	100	96.270	Octodon_degus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	99.529	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	88.269	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.269	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.974	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	96.154	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.883	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.883	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.883	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.883	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.883	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.136	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSOARG00000019591	AGO1	100	96.270	Ovis_aries
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	96.270	Pan_paniscus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	96.270	Panthera_pardus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.829	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	96.037	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	96.270	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSPANG00000009060	AGO1	100	96.270	Papio_anubis
ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.114	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.983	ENSPMGG00000024099	ago1	99	97.983	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.974	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000001787	ago1	100	100.000	ENSPFOG00000005867	ago1	100	100.000	Poecilia_formosa
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ENSPMEG00000001787	ago1	100	100.000	ENSPREG00000006534	ago1	100	100.000	Poecilia_reticulata
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