EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000003114 (Gene tree)
Gene ID: 106920833
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC106920833
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3452 bases
Position: chrKQ551010.1:414014-417465
Accession: 106920833
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000002102	Isy1	PF06246.12	1.5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000013076	-	2372	XM_014992114	ENSPMEP00000002102	304 (aa)	XP_014847600	UPI00072EC024

Gene Model

Click here to download ENSPMEG00000003114's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMEG00000003114's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	63.810	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	63.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.766	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	58.766	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	57.329	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	57.329	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	62.102	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	62.102	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	59.615	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	59.615	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.609	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	59.810	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	47.039	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	47.039	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	53.035	ENSCSEG00000007482	-	99	53.035	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	70.227	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	70.227	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	47.841	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	47.841	Danio_rerio
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	48.428	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	48.428	Esox_lucius
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	79.153	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	79.153	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	76	91.379	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	91.379	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.283	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.494	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	48.197	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	100	48.197	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	67.532	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	67.532	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	50.847	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	51.495	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	36.196	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	100	36.196	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	46.026	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	100	45.695	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	62.025	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	62.025	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.609	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	59.810	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	57.468	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	57.468	Mola_mola
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.065	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.947	Monopterus_albus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	54.636	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	54.984	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.000	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	59.223	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	59.365	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	59.365	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.599	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	58.599	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.861	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	58.861	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	55.911	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	56.369	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	42.951	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	100	42.951	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	51.634	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	99	51.634	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	98.355	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	98.355	Poecilia_formosa
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	97.697	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	97.697	Poecilia_latipinna
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	74.013	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	74.013	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.609	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.810	Pundamilia_nyererei
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	49.835	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	100	49.835	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	99	43.974	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	100	43.974	Scleropages_formosus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	96	57.383	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	99	57.605	Scophthalmus_maximus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	61.875	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	61.875	Seriola_dumerili
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	60.938	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	60.938	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	67.638	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	67.638	Stegastes_partitus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	54.934	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	54.934	Takifugu_rubripes
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	67.105	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	67.105	Xiphophorus_couchianus
ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	91.447	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	91.447	Xiphophorus_maculatus