EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000003961 (Gene tree)
Gene ID: 106930298
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 20623 bases
Position: chrKQ552206.1:11478-32100
Accession: 106930298
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000002893	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.7e-28	1	2
ENSPMEP00000002893	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.7e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000011754	-	4711	XM_015007748	ENSPMEP00000002893	845 (aa)	XP_014863234	UPI00072ED8FF

Gene Model

Click here to download ENSPMEG00000003961's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMEG00000003961's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.841	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.752	Homo_sapiens
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.967	ENSAPOG00000004798	papolg	100	86.557	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.669	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	68.906	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000003961	papolg	89	79.392	ENSACIG00000010546	papolg	99	80.291	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	86.203	ENSAOCG00000010254	papolg	100	86.792	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000003961	papolg	100	86.203	ENSAPEG00000006944	papolg	100	86.792	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000003961	papolg	100	87.264	ENSATEG00000009007	papolg	100	87.500	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000003961	papolg	88	66.043	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.642	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000003961	papolg	72	58.626	ENSACAG00000015048	-	69	73.253	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.485	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	68.956	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.332	ENSACLG00000015592	papolg	100	86.016	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000003961	papolg	99	75.853	ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.197	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.856	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	68.840	Bos_taurus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.807	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.645	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.020	Canis_familiaris
ENSPMEG00000003961	papolg	97	68.497	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	89	83.243	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.856	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.791	Capra_hircus
ENSPMEG00000003961	papolg	98	69.693	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	68.579	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.332	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.449	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.807	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000003961	papolg	81	81.385	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	81.385	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000003961	papolg	89	70.185	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.840	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	68.676	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000003961	papolg	79	67.456	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.277	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000003961	papolg	58	64.097	ENSCING00000024664	-	92	64.097	Ciona_intestinalis
ENSPMEG00000003961	papolg	57	65.567	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.567	Ciona_savignyi
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	68.676	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000003961	papolg	88	68.874	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	68.351	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000003961	papolg	88	68.874	ENSCGRG00000005552	-	100	68.351	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000003961	papolg	89	83.001	ENSCSEG00000000771	papolg	99	82.252	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000003961	papolg	100	88.732	ENSCVAG00000016602	papolg	94	99.000	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000003961	papolg	99	76.649	ENSDARG00000012141	papolg	100	76.222	Danio_rerio
ENSPMEG00000003961	papolg	89	67.285	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	66.319	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000003961	papolg	51	85.315	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000003961	papolg	89	57.311	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	55.859	Echinops_telfairi
ENSPMEG00000003961	papolg	53	71.762	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.762	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000003961	papolg	54	58.952	ENSEBUG00000005042	-	78	58.952	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.291	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	68.750	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.291	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	68.635	Equus_caballus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	61.629	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	60.836	Erinaceus_europaeus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	72.062	ENSELUG00000014497	papolg	94	89.789	Esox_lucius
ENSPMEG00000003961	papolg	97	70.157	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	69.010	Felis_catus
ENSPMEG00000003961	papolg	87	59.894	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	59.133	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.565	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	68.359	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000003961	papolg	66	85.868	ENSFHEG00000019080	papolg	97	87.339	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000003961	papolg	78	92.639	ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.639	Gadus_morhua
ENSPMEG00000003961	papolg	89	62.302	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	62.037	Gallus_gallus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	96.226	ENSGAFG00000003263	papolg	100	95.991	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000003961	papolg	89	86.207	ENSGACG00000002718	papolg	100	86.790	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.841	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	68.676	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.332	ENSHBUG00000004882	papolg	100	86.019	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000003961	papolg	88	69.814	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	68.504	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.921	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	68.620	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000003961	papolg	100	84.552	ENSHCOG00000006782	papolg	100	84.371	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000003961	papolg	99	75.195	ENSIPUG00000021642	papolg	100	75.364	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.657	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.766	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000003961	papolg	51	85.548	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.548	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	86.417	ENSKMAG00000016439	papolg	100	86.066	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	83.505	ENSLBEG00000023218	papolg	100	82.683	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000003961	papolg	99	63.720	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.720	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000003961	papolg	99	75.581	ENSLOCG00000016130	papolg	100	75.259	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.701	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.302	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	68.938	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.302	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	68.938	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000003961	papolg	89	62.402	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	62.190	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.038	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	68.676	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	86.068	ENSMAMG00000010667	papolg	100	86.445	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.332	ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.016	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000003961	papolg	88	63.342	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	98	63.073	Meleagris_gallopavo
ENSPMEG00000003961	papolg	88	69.657	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	68.504	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.363	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	68.538	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.764	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.160	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000003961	papolg	99	86.280	ENSMMOG00000008020	papolg	99	85.884	Mola_mola
ENSPMEG00000003961	papolg	88	68.692	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	68.708	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.967	ENSMALG00000007012	papolg	100	86.439	Monopterus_albus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.935	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	86.150	Mus_caroli
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.935	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	Mus_musculus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.673	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	68.833	Mus_pahari
ENSPMEG00000003961	papolg	89	70.565	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	Mus_spretus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.514	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	68.889	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000003961	papolg	88	69.507	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	68.692	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.503	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	69.120	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000003961	papolg	89	72.215	ENSNBRG00000011943	papolg	84	84.560	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000003961	papolg	51	85.082	ENSNLEG00000009507	-	100	85.082	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000003961	papolg	71	66.207	ENSMEUG00000013605	-	67	68.790	Notamacropus_eugenii
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.110	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	68.229	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000003961	papolg	50	82.506	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.506	Octodon_degus
ENSPMEG00000003961	papolg	99	78.912	ENSONIG00000002985	papolg	100	78.912	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000003961	papolg	98	68.816	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	68.816	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.110	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	68.766	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.412	ENSORLG00000001577	papolg	100	84.824	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.613	ENSORLG00020002482	papolg	100	85.412	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.412	ENSORLG00015008836	papolg	100	84.824	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.059	ENSOMEG00000001406	papolg	100	85.866	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000003961	papolg	52	57.048	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	56.954	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.856	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	68.791	Ovis_aries
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.841	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	68.807	Pan_paniscus
ENSPMEG00000003961	papolg	97	70.157	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	69.010	Panthera_pardus
ENSPMEG00000003961	papolg	97	70.026	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.880	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.841	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	68.807	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000003961	papolg	89	65.966	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	65.621	Papio_anubis
ENSPMEG00000003961	papolg	98	74.084	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.560	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000003961	papolg	96	75.176	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	87.324	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000003961	papolg	88	66.711	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	72	81.495	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000003961	papolg	88	69.829	ENSPEMG00000008960	-	100	68.997	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000003961	papolg	88	51.842	ENSPMAG00000002961	papolg	77	61.246	Petromyzon_marinus
ENSPMEG00000003961	papolg	58	64.789	ENSPMAG00000004864	-	98	64.789	Petromyzon_marinus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	68.709	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.938	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	99.527	ENSPFOG00000012909	papolg	100	99.527	Poecilia_formosa
ENSPMEG00000003961	papolg	100	98.935	ENSPLAG00000018445	papolg	100	98.935	Poecilia_latipinna
ENSPMEG00000003961	papolg	100	97.285	ENSPREG00000010358	papolg	100	97.285	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.676	Pongo_abelii
ENSPMEG00000003961	papolg	88	63.405	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	84	83.439	Procavia_capensis
ENSPMEG00000003961	papolg	89	63.793	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	63.103	Propithecus_coquereli
ENSPMEG00000003961	papolg	78	80.680	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.680	Pteropus_vampyrus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.332	ENSPNYG00000006729	papolg	100	86.016	Pundamilia_nyererei
ENSPMEG00000003961	papolg	99	75.785	ENSPNAG00000015521	papolg	100	74.837	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000003961	papolg	89	70.026	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	69.423	Rattus_norvegicus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	65.125	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	64.201	Rhinopithecus_bieti
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.617	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	68.988	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.302	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.069	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMEG00000003961	papolg	84	68.733	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	68.750	Sarcophilus_harrisii
ENSPMEG00000003961	papolg	89	64.961	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.729	Scleropages_formosus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	73.856	ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.526	Scleropages_formosus
ENSPMEG00000003961	papolg	67	95.105	ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.580	Scophthalmus_maximus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	86.722	ENSSDUG00000000912	papolg	100	87.074	Seriola_dumerili
ENSPMEG00000003961	papolg	100	87.028	ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.957	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMEG00000003961	papolg	89	66.667	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	66.492	Sphenodon_punctatus
ENSPMEG00000003961	papolg	100	86.559	ENSSPAG00000009004	papolg	100	86.790	Stegastes_partitus
ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.554	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	69.010	Sus_scrofa
ENSPMEG00000003961	papolg	63	72.932	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	72.932	Taeniopygia_guttata
ENSPMEG00000003961	papolg	89	81.374	ENSTRUG00000006410	papolg	99	80.581	Takifugu_rubripes
ENSPMEG00000003961	papolg	89	77.633	ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.633	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMEG00000003961	papolg	88	63.697	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	62.698	Tupaia_belangeri
ENSPMEG00000003961	papolg	96	65.303	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	64.714	Tursiops_truncatus
ENSPMEG00000003961	papolg	97	68.586	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.221	Ursus_americanus
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.854	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	69.221	Ursus_maritimus
ENSPMEG00000003961	papolg	88	65.963	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.873	Vicugna_pacos
ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.777	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.150	Vulpes_vulpes
ENSPMEG00000003961	papolg	89	66.885	ENSXETG00000002208	papolg	100	66.317	Xenopus_tropicalis
ENSPMEG00000003961	papolg	59	98.597	ENSXCOG00000006611	papolg	73	98.597	Xiphophorus_couchianus
ENSPMEG00000003961	papolg	65	96.000	ENSXMAG00000007383	papolg	96	96.000	Xiphophorus_maculatus