EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000011684 (Gene tree)
Gene ID: 106918211
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10520 bases
Position: chrKQ551273.1:233978-244497
Accession: 106918211
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000009471	SYF2	PF08231.12	6.3e-48	1	1
ENSPMEP00000027119	SYF2	PF08231.12	6.7e-48	1	1
ENSPMEP00000009449	SYF2	PF08231.12	6.8e-48	1	1
ENSPMEP00000027164	SYF2	PF08231.12	7.2e-48	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000000794	-	693	XM_014987782	ENSPMEP00000027119	230 (aa)	XP_014843268	-
ENSPMET00000000689	-	711	-	ENSPMEP00000027164	236 (aa)	-	-
ENSPMET00000000725	-	678	-	ENSPMEP00000009471	225 (aa)	-	-
ENSPMET00000000771	-	699	-	ENSPMEP00000009449	232 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPMEG00000011684's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMEG00000011684's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.077	ENSG00000117614	SYF2	96	73.504	Homo_sapiens
ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	ENSAPOG00000001174	syf2	100	86.555	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000011684	syf2	96	76.233	ENSAMEG00000010115	-	99	72.016	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000011684	syf2	83	76.923	ENSAMEG00000010134	-	100	76.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000011684	syf2	98	87.773	ENSACIG00000023688	syf2	94	86.752	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000011684	syf2	93	85.520	ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.520	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	ENSAOCG00000022046	syf2	100	86.134	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.555	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	ENSATEG00000007745	syf2	100	87.395	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000011684	syf2	85	78.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	78.500	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000011684	syf2	70	64.671	ENSACAG00000026777	-	100	64.671	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000011684	syf2	87	78.431	ENSACAG00000013653	-	100	78.431	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.932	ENSANAG00000032473	SYF2	100	72.428	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	ENSACLG00000019916	syf2	100	87.395	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000011684	syf2	99	79.654	ENSAMXG00000004051	syf2	100	78.151	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.000	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	74.468	Bos_taurus
ENSPMEG00000011684	syf2	89	51.429	WBGene00019402	syf-2	99	47.210	Caenorhabditis_elegans
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.932	ENSCJAG00000046570	SYF2	96	73.932	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	71.667	ENSCAFG00000012895	-	98	72.614	Canis_familiaris
ENSPMEG00000011684	syf2	96	70.222	ENSCAFG00000030331	-	100	68.085	Canis_familiaris
ENSPMEG00000011684	syf2	99	71.667	ENSCAFG00020021091	-	98	72.614	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000011684	syf2	77	67.582	ENSCAFG00020021094	-	95	67.582	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.000	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	74.043	Capra_hircus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.359	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	73.333	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000011684	syf2	84	76.768	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	76.768	Cavia_aperea
ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.428	ENSCPOG00000005326	SYF2	99	72.428	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.932	ENSCCAG00000022459	SYF2	96	73.932	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	ENSCATG00000026917	SYF2	99	72.917	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000011684	syf2	95	77.477	ENSCLAG00000008474	SYF2	96	75.214	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	71.605	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000011684	syf2	77	59.444	ENSCHOG00000005273	-	99	59.444	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000011684	syf2	96	78.222	ENSCPBG00000025073	SYF2	95	76.170	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000011684	syf2	95	52.466	ENSCING00000003017	-	93	52.466	Ciona_intestinalis
ENSPMEG00000011684	syf2	91	49.533	ENSCSAVG00000006627	-	98	49.533	Ciona_savignyi
ENSPMEG00000011684	syf2	100	65.678	ENSCANG00000037322	SYF2	100	66.102	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.325	ENSCGRG00001020733	Syf2	99	74.059	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000011684	syf2	84	78.061	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	78.283	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000011684	syf2	93	83.486	ENSCSEG00000000117	syf2	100	79.916	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000011684	syf2	100	90.795	ENSCVAG00000019543	syf2	100	91.213	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	82.018	ENSDARG00000004706	syf2	100	79.832	Danio_rerio
ENSPMEG00000011684	syf2	98	74.569	ENSDNOG00000047605	SYF2	96	74.468	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	76.623	ENSDORG00000001274	Syf2	100	72.131	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000011684	syf2	96	52.655	FBgn0033556	CG12343	99	52.655	Drosophila_melanogaster
ENSPMEG00000011684	syf2	88	63.768	ENSETEG00000015729	SYF2	100	60.262	Echinops_telfairi
ENSPMEG00000011684	syf2	84	53.807	ENSEBUG00000015402	syf2	95	53.807	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000011684	syf2	99	75.214	ENSEASG00005004224	-	98	74.895	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	68.398	ENSEASG00005004232	-	100	66.390	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.431	ENSECAG00000012023	-	100	73.061	Equus_caballus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	75.000	ENSECAG00000010440	-	98	75.745	Equus_caballus
ENSPMEG00000011684	syf2	76	66.286	ENSEEUG00000015084	SYF2	96	66.286	Erinaceus_europaeus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	79.412	ENSELUG00000003465	syf2	99	79.412	Esox_lucius
ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	ENSFCAG00000043095	-	98	73.750	Felis_catus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.059	ENSFCAG00000010324	-	81	74.059	Felis_catus
ENSPMEG00000011684	syf2	87	76.471	ENSFALG00000000460	SYF2	96	73.305	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.727	ENSFDAG00000008310	SYF2	99	73.029	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000011684	syf2	96	78.222	ENSFHEG00000007238	syf2	100	78.222	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000011684	syf2	92	83.256	ENSGMOG00000019138	syf2	100	81.250	Gadus_morhua
ENSPMEG00000011684	syf2	95	78.829	ENSGALG00000013639	SYF2	92	76.395	Gallus_gallus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	93.697	ENSGAFG00000019435	syf2	100	93.697	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000011684	syf2	95	86.036	ENSGACG00000007305	syf2	100	83.264	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000011684	syf2	96	78.667	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	76.596	Gopherus_agassizii
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.077	ENSGGOG00000012796	SYF2	96	73.504	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.815	ENSHBUG00000020477	syf2	100	87.815	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000011684	syf2	95	67.568	ENSHGLG00000004304	-	93	68.018	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	ENSHGLG00000014393	SYF2	98	73.750	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	ENSHGLG00100014722	SYF2	98	73.750	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000011684	syf2	100	84.874	ENSHCOG00000012904	syf2	78	84.874	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000011684	syf2	98	82.895	ENSIPUG00000019859	syf2	100	80.335	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000011684	syf2	64	75.694	ENSSTOG00000023984	SYF2	99	75.694	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000011684	syf2	85	77.387	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	77.387	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	88.655	ENSKMAG00000013856	syf2	100	88.655	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.975	ENSLBEG00000014425	syf2	100	86.975	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000011684	syf2	100	74.249	ENSLACG00000012064	SYF2	100	73.529	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000011684	syf2	100	81.092	ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.092	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.758	ENSLAFG00000023150	-	96	75.319	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000011684	syf2	78	52.174	ENSLAFG00000030814	-	100	52.174	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	72.016	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000011684	syf2	97	72.222	ENSMMUG00000002968	SYF2	96	72.650	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	72.016	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	72.917	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	ENSMAMG00000010403	syf2	98	86.555	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	ENSMZEG00005006429	syf2	100	87.395	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000011684	syf2	85	78.392	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	78.392	Meleagris_gallopavo
ENSPMEG00000011684	syf2	98	76.522	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	74.689	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000011684	syf2	85	77.387	ENSMICG00000016191	SYF2	100	77.387	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	76.087	ENSMOCG00000022938	Syf2	99	73.859	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000011684	syf2	99	83.550	ENSMMOG00000002396	syf2	97	83.550	Mola_mola
ENSPMEG00000011684	syf2	95	75.446	ENSMODG00000013951	-	99	74.449	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000011684	syf2	99	85.281	ENSMALG00000010706	syf2	100	84.232	Monopterus_albus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.689	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	99	74.689	Mus_caroli
ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.689	ENSMUSG00000028821	Syf2	99	74.689	Mus_musculus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.689	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	99	74.689	Mus_pahari
ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.689	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	99	74.689	Mus_spretus
ENSPMEG00000011684	syf2	92	76.852	ENSMPUG00000015802	-	98	72.500	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000011684	syf2	94	76.818	ENSMPUG00000015801	-	96	73.729	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000011684	syf2	97	75.109	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	75.109	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000011684	syf2	95	76.577	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	71.138	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000011684	syf2	100	77.686	ENSNBRG00000010720	syf2	99	77.686	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.077	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	71.605	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000011684	syf2	98	74.892	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	72.428	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000011684	syf2	100	63.115	ENSODEG00000014338	-	100	63.333	Octodon_degus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	70.833	ENSODEG00000017664	-	99	72.385	Octodon_degus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	ENSONIG00000008213	syf2	100	87.395	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000011684	syf2	86	77.228	ENSOANG00000009552	SYF2	100	77.228	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	ENSOCUG00000013050	SYF2	98	73.750	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	86.900	ENSORLG00000028820	syf2	99	86.522	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.408	ENSORLG00020018333	syf2	100	84.874	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.837	ENSORLG00015014665	syf2	100	85.294	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000011684	syf2	99	86.580	ENSOMEG00000013911	syf2	100	85.294	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000011684	syf2	99	75.431	ENSOGAG00000009962	SYF2	96	75.641	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000011684	syf2	98	73.932	ENSOARG00000006348	-	99	71.721	Ovis_aries
ENSPMEG00000011684	syf2	83	53.333	ENSOARG00000006269	-	100	53.333	Ovis_aries
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.077	ENSPPAG00000036579	SYF2	96	73.504	Pan_paniscus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	ENSPPRG00000001651	-	98	73.750	Panthera_pardus
ENSPMEG00000011684	syf2	97	76.190	ENSPPRG00000001638	-	100	71.545	Panthera_pardus
ENSPMEG00000011684	syf2	92	78.704	ENSPTIG00000005711	-	80	78.440	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	ENSPTIG00000007036	-	98	73.750	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.077	ENSPTRG00000000352	SYF2	96	73.504	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	ENSPANG00000008139	SYF2	100	72.016	Papio_anubis
ENSPMEG00000011684	syf2	100	77.311	ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.311	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000011684	syf2	99	75.745	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	75.966	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000011684	syf2	98	83.772	ENSPMGG00000008755	syf2	93	81.250	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.652	ENSPEMG00000008283	Syf2	99	73.444	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000011684	syf2	95	77.928	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	76.856	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	94.783	ENSPFOG00000004116	syf2	99	93.305	Poecilia_formosa
ENSPMEG00000011684	syf2	99	94.348	ENSPLAG00000006691	syf2	99	94.828	Poecilia_latipinna
ENSPMEG00000011684	syf2	100	94.958	ENSPREG00000003009	syf2	100	94.958	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000011684	syf2	93	77.523	ENSPPYG00000001713	SYF2	96	73.504	Pongo_abelii
ENSPMEG00000011684	syf2	98	53.125	ENSPCOG00000027011	SYF2	95	53.304	Propithecus_coquereli
ENSPMEG00000011684	syf2	99	68.534	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	65.714	Pteropus_vampyrus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.975	ENSPNYG00000004979	syf2	100	86.975	Pundamilia_nyererei
ENSPMEG00000011684	syf2	99	80.519	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.412	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.689	ENSRNOG00000060597	Syf2	99	74.689	Rattus_norvegicus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	69.547	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	70.833	Rhinopithecus_bieti
ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	ENSRROG00000001347	SYF2	100	72.016	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.504	ENSSBOG00000020184	SYF2	96	73.504	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMEG00000011684	syf2	88	77.184	ENSSHAG00000007152	-	100	77.184	Sarcophilus_harrisii
ENSPMEG00000011684	syf2	95	76.577	ENSSHAG00000015630	-	89	76.577	Sarcophilus_harrisii
ENSPMEG00000011684	syf2	95	82.353	ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.416	Scleropages_formosus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	83.193	ENSSMAG00000009867	syf2	100	83.193	Scophthalmus_maximus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.294	ENSSDUG00000013072	syf2	100	85.294	Seriola_dumerili
ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.294	ENSSLDG00000012677	syf2	100	85.294	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMEG00000011684	syf2	100	57.627	ENSSARG00000012889	SYF2	97	57.627	Sorex_araneus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	78.017	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	76.033	Sphenodon_punctatus
ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.714	ENSSPAG00000009626	syf2	100	85.714	Stegastes_partitus
ENSPMEG00000011684	syf2	98	74.569	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	71.901	Sus_scrofa
ENSPMEG00000011684	syf2	75	53.529	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.571	Taeniopygia_guttata
ENSPMEG00000011684	syf2	99	82.251	ENSTRUG00000001499	syf2	95	80.591	Takifugu_rubripes
ENSPMEG00000011684	syf2	95	85.135	ENSTNIG00000016912	syf2	99	85.455	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMEG00000011684	syf2	100	59.574	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.829	Tupaia_belangeri
ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.614	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	73.029	Tursiops_truncatus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.529	ENSUAMG00000002897	SYF2	95	73.529	Ursus_americanus
ENSPMEG00000011684	syf2	92	76.852	ENSUMAG00000013108	SYF2	95	73.529	Ursus_maritimus
ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.614	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	72.614	Vicugna_pacos
ENSPMEG00000011684	syf2	88	76.585	ENSVVUG00000027181	-	94	73.418	Vulpes_vulpes
ENSPMEG00000011684	syf2	99	71.667	ENSVVUG00000027175	-	98	72.614	Vulpes_vulpes
ENSPMEG00000011684	syf2	100	72.532	ENSXETG00000022797	syf2	94	72.961	Xenopus_tropicalis
ENSPMEG00000011684	syf2	100	92.437	ENSXMAG00000022698	syf2	100	92.437	Xiphophorus_maculatus