EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000015658 (Gene tree)
Gene ID: 106934183
Gene Symbol: srpra
Alias: -
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9372 bases
Position: chrKQ552718.1:14452-23823
Accession: 106934183
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000029671	SRP54	PF00448.22	6.2e-48	1	1
ENSPMEP00000013316	SRP54	PF00448.22	8.1e-48	1	1
ENSPMEP00000029671	SRP54_N	PF02881.19	2.3e-09	1	1
ENSPMEP00000013316	SRP54_N	PF02881.19	2.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000020990	-	2100	XM_015013933	ENSPMEP00000013316	650 (aa)	XP_014869419	UPI00072DA0E4
ENSPMET00000020944	-	1752	-	ENSPMEP00000029671	583 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPMEG00000015658's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMEG00000015658's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.335	ENSG00000182934	SRPRA	100	67.776	Homo_sapiens
ENSPMEG00000015658	srpra	100	90.000	ENSAPOG00000017588	srpra	100	90.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.069	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	66.767	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.077	ENSACIG00000021588	srpra	100	86.308	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	90.154	ENSAOCG00000018884	srpra	100	90.154	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000015658	srpra	100	90.154	ENSAPEG00000022286	srpra	100	87.184	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000015658	srpra	100	86.810	ENSATEG00000023578	srpra	95	94.848	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000015658	srpra	94	71.870	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	69.870	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000015658	srpra	100	71.278	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	69.925	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.127	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	67.424	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000015658	srpra	100	87.385	ENSACLG00000000518	srpra	100	87.231	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000015658	srpra	100	75.286	ENSAMXG00000009975	srpra	96	93.333	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.477	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	67.572	Bos_taurus
ENSPMEG00000015658	srpra	99	49.247	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.343	Caenorhabditis_elegans
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.080	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	67.375	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	67.424	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	65.554	Canis_familiaris
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.091	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	67.223	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.149	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	67.375	Capra_hircus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	71.355	ENSTSYG00000005187	SRPRA	90	87.619	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000015658	srpra	94	69.377	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	88.722	Cavia_aperea
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.382	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	88.722	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.440	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	67.424	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.277	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	67.576	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.697	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.982	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.127	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.424	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000015658	srpra	52	87.245	ENSCHOG00000010015	-	70	87.245	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000015658	srpra	100	71.644	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	70.197	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000015658	srpra	99	59.480	ENSCING00000008954	-	100	59.021	Ciona_intestinalis
ENSPMEG00000015658	srpra	99	60.000	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.615	Ciona_savignyi
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.127	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	67.424	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.894	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	68.030	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.894	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.889	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.299	ENSCSEG00000002374	srpra	100	84.992	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	89.893	ENSCVAG00000019881	srpra	100	90.046	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	78.321	ENSDARG00000061124	srpra	100	77.099	Danio_rerio
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.058	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.816	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.939	ENSDORG00000016719	Srpr	100	67.580	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000015658	srpra	99	52.063	FBgn0010391	Gtp-bp	100	51.446	Drosophila_melanogaster
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.533	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	66.515	Echinops_telfairi
ENSPMEG00000015658	srpra	63	74.271	ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.810	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.799	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	66.667	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.799	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	66.667	Equus_caballus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	63.651	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.861	Erinaceus_europaeus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.429	ENSELUG00000017643	srpra	100	84.816	Esox_lucius
ENSPMEG00000015658	srpra	80	64.419	ENSFCAG00000030894	-	99	60.902	Felis_catus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.789	ENSFCAG00000011274	-	100	66.768	Felis_catus
ENSPMEG00000015658	srpra	99	68.300	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.331	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.741	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	93.241	ENSFHEG00000016959	srpra	100	93.395	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	80.982	ENSGMOG00000013244	srpra	100	80.982	Gadus_morhua
ENSPMEG00000015658	srpra	100	71.951	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	70.229	Gallus_gallus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	96.462	ENSGAFG00000000453	srpra	100	96.462	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	83.077	ENSGACG00000006550	srpra	100	82.769	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	71.795	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	70.348	Gopherus_agassizii
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.335	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	67.776	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000015658	srpra	100	87.231	ENSHBUG00000000119	srpra	100	87.077	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.997	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.997	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.145	ENSHCOG00000010749	srpra	100	85.452	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000015658	srpra	94	74.879	ENSIPUG00000000867	srpra	99	75.201	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.242	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	67.424	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.044	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	67.982	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	88.957	ENSKMAG00000002280	srpra	100	89.724	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	88.018	ENSLBEG00000009608	srpra	100	87.865	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000015658	srpra	100	70.165	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	69.670	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000015658	srpra	100	76.435	ENSLOCG00000002733	srpra	100	75.492	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.684	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	66.717	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.277	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	67.576	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.277	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	67.576	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.394	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	67.678	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.277	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	67.576	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.231	ENSMAMG00000000473	srpra	100	85.846	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	87.385	ENSMZEG00005013432	srpra	100	87.231	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000015658	srpra	94	71.498	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	69.643	Meleagris_gallopavo
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.894	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	68.030	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.277	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	67.572	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.440	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	67.727	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000015658	srpra	100	81.422	ENSMMOG00000005019	srpra	100	81.260	Mola_mola
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.499	ENSMODG00000004576	-	100	67.527	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000015658	srpra	100	88.462	ENSMALG00000011343	srpra	100	88.462	Monopterus_albus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.939	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	90.152	Mus_caroli
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.985	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	89.394	Mus_musculus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.289	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	89.394	Mus_pahari
ENSPMEG00000015658	srpra	100	66.040	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	88	82.759	Mus_spretus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.684	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	66.717	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.301	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	67.073	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.091	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	67.223	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000015658	srpra	100	86.769	ENSNBRG00000017311	srpra	100	86.615	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000015658	srpra	99	65.805	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.038	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000015658	srpra	94	67.732	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	66.080	Notamacropus_eugenii
ENSPMEG00000015658	srpra	100	64.812	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	62.935	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.545	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	67.982	Octodon_degus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	86.615	ENSONIG00000005324	srpra	100	86.462	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.532	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	67.527	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.692	ENSORLG00000014676	srpra	100	85.231	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.692	ENSORLG00020009240	srpra	100	85.231	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.385	ENSORLG00015015405	srpra	100	84.923	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.846	ENSOMEG00000005872	srpra	100	85.385	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.265	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	67.428	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000015658	srpra	100	66.161	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	65.099	Ovis_aries
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.335	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	67.776	Pan_paniscus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.789	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	66.768	Panthera_pardus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.637	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	66.616	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.335	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	67.776	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.277	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	67.576	Papio_anubis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	75.610	ENSPKIG00000016106	srpra	100	76.758	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000015658	srpra	94	71.637	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	70.113	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	84.533	ENSPMGG00000001393	srpra	100	82.569	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.592	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	67.879	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000015658	srpra	99	63.037	ENSPMAG00000009559	srpra	99	62.270	Petromyzon_marinus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.333	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.424	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	99.846	ENSPFOG00000003114	srpra	100	99.846	Poecilia_formosa
ENSPMEG00000015658	srpra	100	99.538	ENSPLAG00000007323	srpra	100	99.538	Poecilia_latipinna
ENSPMEG00000015658	srpra	100	97.692	ENSPREG00000004937	srpra	100	97.692	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000015658	srpra	89	86.842	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	86.842	Pongo_abelii
ENSPMEG00000015658	srpra	63	90.698	ENSPCAG00000003801	-	64	90.698	Procavia_capensis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.976	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	66.970	Propithecus_coquereli
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.845	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	67.275	Pteropus_vampyrus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	87.385	ENSPNYG00000012371	srpra	100	87.231	Pundamilia_nyererei
ENSPMEG00000015658	srpra	100	79.141	ENSPNAG00000013476	srpra	100	78.988	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.289	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	67.879	Rattus_norvegicus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.532	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	67.576	Rhinopithecus_bieti
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.323	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	67.625	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMEG00000015658	srpra	58	40.616	YDR292C	-	52	41.945	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.976	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.273	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMEG00000015658	srpra	94	68.277	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.613	Sarcophilus_harrisii
ENSPMEG00000015658	srpra	100	80.471	ENSSFOG00015008837	srpra	100	80.976	Scleropages_formosus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	82.043	ENSSMAG00000002783	srpra	100	82.702	Scophthalmus_maximus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	89.571	ENSSDUG00000013920	srpra	100	88.435	Seriola_dumerili
ENSPMEG00000015658	srpra	100	89.417	ENSSLDG00000008601	srpra	93	89.417	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMEG00000015658	srpra	82	85.366	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	Sorex_araneus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.477	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	67.275	Sphenodon_punctatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	90.184	ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.571	Stegastes_partitus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.592	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.576	Sus_scrofa
ENSPMEG00000015658	srpra	94	68.498	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	67.476	Taeniopygia_guttata
ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.407	ENSTRUG00000006856	srpra	100	84.769	Takifugu_rubripes
ENSPMEG00000015658	srpra	100	78.582	ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.884	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.331	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	67.270	Tursiops_truncatus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.373	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	67.119	Ursus_americanus
ENSPMEG00000015658	srpra	96	62.656	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	61.431	Ursus_maritimus
ENSPMEG00000015658	srpra	69	90.698	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	90.698	Vicugna_pacos
ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.091	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	67.223	Vulpes_vulpes
ENSPMEG00000015658	srpra	100	59.165	ENSXETG00000003920	srpra	100	59.758	Xenopus_tropicalis
ENSPMEG00000015658	srpra	87	98.198	ENSXCOG00000001286	srpra	100	98.198	Xiphophorus_couchianus
ENSPMEG00000015658	srpra	100	96.154	ENSXMAG00000028401	srpra	100	96.154	Xiphophorus_maculatus