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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000016964 (Gene tree)
Gene ID: 106924701
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12896 bases
Position: chrKQ551698.1:264567-277462
Accession: 106924701
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000030485	eRF1_2	PF03464.15	1.8e-34	1	1
ENSPMEP00000030487	eRF1_2	PF03464.15	1.8e-34	1	1
ENSPMEP00000030485	eRF1_3	PF03465.15	1.6e-25	1	1
ENSPMEP00000030487	eRF1_3	PF03465.15	2.3e-17	1	1
ENSPMEP00000030485	eRF1_1	PF03463.15	1.1e-52	1	1
ENSPMEP00000030487	eRF1_1	PF03463.15	1.2e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000022549	-	3963	XM_014998540	ENSPMEP00000030485	385 (aa)	XP_014854026	UPI0004448FD3
ENSPMET00000022539	-	4276	-	ENSPMEP00000030487	385 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	ENSG00000152684	PELO	100	81.299	Homo_sapiens
ENSPMEG00000016964	pelo	100	92.208	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000016964	pelo	64	92.308	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000016964	pelo	64	92.308	ENSAPOG00000023700	-	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.558	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000016964	pelo	97	89.008	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	92.468	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.468	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000016964	pelo	100	92.468	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.468	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000016964	pelo	100	94.026	ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000016964	pelo	77	72.819	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.819	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000016964	pelo	97	80.533	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.000	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.558	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000016964	pelo	97	92.225	ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.909	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	Bos_taurus
ENSPMEG00000016964	pelo	99	61.155	WBGene00011280	pelo-1	100	61.155	Caenorhabditis_elegans
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.039	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	Capra_hircus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.078	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.078	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.078	ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.299	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.558	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.558	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.078	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.078	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000016964	pelo	97	81.600	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000016964	pelo	97	64.879	ENSCING00000001979	-	100	65.195	Ciona_intestinalis
ENSPMEG00000016964	pelo	100	67.013	ENSCSAVG00000006158	-	100	67.013	Ciona_savignyi
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000016964	pelo	97	82.038	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.078	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000016964	pelo	97	82.842	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.688	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.688	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000016964	pelo	100	98.961	ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.961	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	88.312	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.312	Danio_rerio
ENSPMEG00000016964	pelo	100	78.497	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.497	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	83.377	ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.377	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000016964	pelo	96	68.649	FBgn0011207	pelo	96	68.074	Drosophila_melanogaster
ENSPMEG00000016964	pelo	71	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.818	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	90.390	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	Esox_lucius
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.818	Felis_catus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSFALG00000004559	PELO	100	81.818	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000016964	pelo	74	83.099	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.099	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000016964	pelo	100	96.883	ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.883	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000016964	pelo	98	88.329	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.052	Gadus_morhua
ENSPMEG00000016964	pelo	100	98.182	ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.182	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	ENSGACG00000007245	pelo	100	91.169	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000016964	pelo	97	81.600	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	Gopherus_agassizii
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ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.338	ENSHGLG00000005932	PELO	100	82.338	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000016964	pelo	100	80.260	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.260	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000016964	pelo	100	89.351	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000016964	pelo	100	88.831	ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.831	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	80.000	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	80.000	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	94.026	ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.026	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.169	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.078	ENSLAFG00000020551	PELO	100	82.078	Loxodonta_africana
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ENSPMEG00000016964	pelo	97	94.906	ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.286	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	ENSMZEG00005014258	pelo	100	91.169	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.857	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	82.857	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.818	Microcebus_murinus
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ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.429	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.429	Mola_mola
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ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.857	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	82.857	Mus_musculus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	83.117	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	83.117	Mus_pahari
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.857	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	82.857	Mus_spretus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.039	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.039	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.597	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	82.597	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	Neolamprologus_brichardi
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ENSPMEG00000016964	pelo	100	79.740	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.740	Notamacropus_eugenii
ENSPMEG00000016964	pelo	98	81.266	ENSOPRG00000018793	PELO	100	81.266	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.857	ENSODEG00000017579	PELO	100	82.857	Octodon_degus
ENSPMEG00000016964	pelo	96	91.914	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.948	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.429	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.429	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.688	ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.688	ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000016964	pelo	100	93.506	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.506	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.558	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.299	Ovis_aries
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.558	Pan_paniscus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.818	Panthera_pardus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.818	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.299	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.558	Papio_anubis
ENSPMEG00000016964	pelo	100	88.571	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.571	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000016964	pelo	97	81.333	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000016964	pelo	67	89.147	ENSPMGG00000014561	pelo	95	89.147	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.597	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	82.597	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	ENSPCIG00000004880	PELO	100	81.299	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	100.000	ENSPFOG00000007277	pelo	100	100.000	Poecilia_formosa
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ENSPMEG00000016964	pelo	97	92.493	ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.169	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000016964	pelo	100	83.377	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	83.377	Rattus_norvegicus
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.558	Rhinopithecus_bieti
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.558	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMEG00000016964	pelo	98	32.727	YNL001W	-	98	32.727	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.039	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.039	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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