EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000018709 (Gene tree)
Gene ID: 106904166
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC106904166
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13816 bases
Position: chrKQ552888.1:61999-75814
Accession: 106904166
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000016075	MMR_HSR1	PF01926.23	9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000024533	-	2641	XM_014968346	ENSPMEP00000016075	476 (aa)	XP_014823832	UPI00072E6832

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	61.111	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	61.894

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.556	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	90.625	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	90.402	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	58.093	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.778	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.071	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.556	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	90.848	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	60.000	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	89.286	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	89.286	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	57.589	ENSACAG00000028632	-	99	57.589	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	58.850	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.741	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.912	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.912	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	79.955	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.955	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	75	60.393	ENSCING00000020807	-	94	60.393	Ciona_intestinalis
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	92	54.773	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.000	Ciona_savignyi
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	99	84.842	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.142	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	58.667	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	94.420	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	94.420	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	60.222	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	92	82.727	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.727	Danio_rerio
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	60.889	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.469	Danio_rerio
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	74	55.650	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	55.650	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	79.642	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.642	Esox_lucius
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.424	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	93.973	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	93.973	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	84	55.112	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.112	Gadus_morhua
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	99	97.046	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	95	97.046	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	54	94.961	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.961	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	80	63.874	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.845	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.071	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.964	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.556	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	93	83.559	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.559	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	76.837	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.837	Ictalurus_punctatus
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ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	91	59.584	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.584	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.741	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Kryptolebias_marmoratus
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ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	89.062	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	93	69.820	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.820	Latimeria_chalumnae
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ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	93	62.022	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.247	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	93	72.707	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.707	Lepisosteus_oculatus
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ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	58.093	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Mola_mola
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	92	88.155	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.155	Monopterus_albus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	59.778	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Monopterus_albus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	91	59.815	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	59.815	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.295	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Neolamprologus_brichardi
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ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.741	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	60.000	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_latipes
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