EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000020089 (Gene tree)
Gene ID: 106918664
Gene Symbol: ctif
Alias: -
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 55719 bases
Position: chrKQ551297.1:364084-419802
Accession: 106918664
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000032331	MIF4G	PF02854.19	2.6e-27	1	1
ENSPMEP00000032327	MIF4G	PF02854.19	2.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000033735	-	5998	XM_014988587	ENSPMEP00000032331	708 (aa)	XP_014844073	UPI00072E7BEA
ENSPMET00000026120	-	5917	XM_014988588	ENSPMEP00000032327	681 (aa)	XP_014844074	UPI00072E95EA

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.058	ENSG00000134030	CTIF	99	53.902	Homo_sapiens
ENSPMEG00000020089	ctif	85	83.333	ENSAPOG00000020192	ctif	100	81.645	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000020089	ctif	89	52.365	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	51.060	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.918	ENSACIG00000017099	ctif	100	78.340	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	75.141	ENSAOCG00000014275	ctif	100	74.576	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000020089	ctif	100	81.780	ENSAPEG00000016975	ctif	100	82.232	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000020089	ctif	100	81.791	ENSATEG00000016752	ctif	100	82.085	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	58.455	ENSACAG00000018006	CTIF	99	54.839	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.797	ENSANAG00000024925	CTIF	99	53.991	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.736	ENSACLG00000005956	ctif	100	80.176	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000020089	ctif	53	62.873	ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.275	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.862	ENSBTAG00000018901	CTIF	99	53.701	Bos_taurus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.651	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	53.488	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000020089	ctif	97	53.767	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	53.017	Canis_familiaris
ENSPMEG00000020089	ctif	97	53.767	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	53.690	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.467	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	53.314	Capra_hircus
ENSPMEG00000020089	ctif	81	56.283	ENSTSYG00000030461	CTIF	96	54.770	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000020089	ctif	99	50.720	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	49.425	Cavia_aperea
ENSPMEG00000020089	ctif	99	53.419	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	52.489	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.506	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	53.546	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.814	ENSCATG00000038134	CTIF	98	65.000	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.323	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	53.170	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000020089	ctif	99	56.168	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	53.050	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000020089	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.638	ENSCANG00000030916	CTIF	99	57.117	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	56.214	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	55.058	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000020089	ctif	99	52.107	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	50.983	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.518	ENSCSEG00000019857	ctif	100	78.102	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000020089	ctif	100	86.864	ENSCVAG00000017158	ctif	100	87.853	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	63.445	ENSDARG00000090617	ctif	100	65.460	Danio_rerio
ENSPMEG00000020089	ctif	69	56.813	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	56.051	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.956	ENSDORG00000003221	Ctif	99	53.644	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.124	ENSEASG00005016094	CTIF	100	52.890	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.051	ENSECAG00000020473	CTIF	100	53.801	Equus_caballus
ENSPMEG00000020089	ctif	78	58.349	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	56.742	Erinaceus_europaeus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	63.456	ENSELUG00000008733	ctif	100	64.486	Esox_lucius
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.651	ENSFCAG00000000664	CTIF	99	53.488	Felis_catus
ENSPMEG00000020089	ctif	97	53.916	ENSFALG00000008943	CTIF	98	53.523	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000020089	ctif	99	53.923	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	52.782	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000020089	ctif	100	90.113	ENSFHEG00000004334	ctif	100	94.915	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	56.897	ENSGALG00000035912	-	99	57.615	Gallus_gallus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	94.575	ENSGAFG00000011896	ctif	100	98.305	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000020089	ctif	65	52.573	ENSGAGG00000020663	CTIF	91	56.522	Gopherus_agassizii
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.899	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	53.746	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.883	ENSHBUG00000018092	ctif	100	80.323	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.928	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	53.768	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.783	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	53.623	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000020089	ctif	99	57.918	ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000020089	ctif	99	63.885	ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.413	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.539	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	53.644	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	53.314	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	52.464	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	80.617	ENSKMAG00000014651	ctif	100	81.232	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	65.029	ENSLOCG00000011697	ctif	100	64.441	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	48.204	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.758	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.942	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	54.136	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.814	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	54.136	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.814	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	54.136	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.783	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	53.980	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	81.204	ENSMAMG00000014741	ctif	100	80.910	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000020089	ctif	90	77.358	ENSMZEG00005019767	ctif	90	77.997	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000020089	ctif	89	38.387	ENSMGAG00000001378	CTIF	61	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.362	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	54.203	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.942	ENSMICG00000010167	CTIF	99	53.690	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.861	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	54.519	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000020089	ctif	100	76.504	ENSMMOG00000000831	ctif	100	76.305	Mola_mola
ENSPMEG00000020089	ctif	99	52.111	ENSMODG00000003464	CTIF	100	50.490	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000020089	ctif	71	82.051	ENSMALG00000020553	ctif	99	82.051	Monopterus_albus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.137	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	52.314	Mus_caroli
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.126	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	53.007	Mus_musculus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.797	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	54.638	Mus_pahari
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.393	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	75.817	Mus_spretus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.282	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	53.266	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.148	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	52.907	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.636	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	54.480	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.883	ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.323	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.058	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	53.546	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000020089	ctif	99	48.755	ENSMEUG00000000218	CTIF	85	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.108	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	54.167	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000020089	ctif	99	52.573	ENSODEG00000018390	CTIF	99	51.460	Octodon_degus
ENSPMEG00000020089	ctif	87	82.418	ENSONIG00000007750	ctif	94	82.011	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000020089	ctif	80	47.697	ENSOANG00000001337	CTIF	99	46.875	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.102	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	53.936	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.433	ENSORLG00000005786	ctif	100	77.433	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000020089	ctif	100	76.305	ENSORLG00020005385	ctif	100	76.305	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000020089	ctif	100	76.728	ENSORLG00015011872	ctif	100	76.728	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.715	ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.715	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.783	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	53.546	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.690	ENSOARG00000003754	CTIF	99	53.535	Ovis_aries
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.899	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	65.000	Pan_paniscus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.348	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	53.333	Panthera_pardus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.401	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	53.120	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.690	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	65.000	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000020089	ctif	99	56.168	ENSPANG00000017087	CTIF	99	53.980	Papio_anubis
ENSPMEG00000020089	ctif	80	57.248	ENSPKIG00000011234	ctif	98	63.889	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000020089	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000020089	ctif	100	71.690	ENSPMGG00000022958	ctif	100	71.690	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.750	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	54.003	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000020089	ctif	72	55.800	ENSPCIG00000026247	CTIF	99	59.531	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	99.718	ENSPFOG00000009243	ctif	100	99.718	Poecilia_formosa
ENSPMEG00000020089	ctif	100	99.576	ENSPLAG00000019171	ctif	100	99.576	Poecilia_latipinna
ENSPMEG00000020089	ctif	100	95.056	ENSPREG00000017326	ctif	100	95.056	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000020089	ctif	80	57.942	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	56.498	Pongo_abelii
ENSPMEG00000020089	ctif	99	53.161	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	51.799	Propithecus_coquereli
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.797	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	53.634	Pteropus_vampyrus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.883	ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.323	Pundamilia_nyererei
ENSPMEG00000020089	ctif	99	64.236	ENSPNAG00000029174	ctif	100	65.126	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.507	ENSRNOG00000018342	Ctif	90	65.625	Rattus_norvegicus
ENSPMEG00000020089	ctif	99	55.087	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	53.043	Rhinopithecus_bieti
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.942	ENSRROG00000006039	CTIF	99	52.899	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.797	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	53.634	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMEG00000020089	ctif	99	52.053	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	51.098	Sarcophilus_harrisii
ENSPMEG00000020089	ctif	99	66.422	ENSSFOG00015022594	ctif	100	65.936	Scleropages_formosus
ENSPMEG00000020089	ctif	96	87.108	ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.379	Scophthalmus_maximus
ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.057	ENSSDUG00000016033	ctif	100	79.889	Seriola_dumerili
ENSPMEG00000020089	ctif	56	77.582	ENSSLDG00000007282	ctif	100	81.791	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.692	ENSSPUG00000014734	CTIF	72	89.583	Sphenodon_punctatus
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