EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000022123 (Gene tree)
Gene ID: 106904817
Gene Symbol: polr1e
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4183 bases
Position: chrKQ553003.1:19412-23594
Accession: 106904817
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000019161	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	2.1e-106	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000034497	-	1360	XM_014969303	ENSPMEP00000019161	385 (aa)	XP_014824789	-

Gene Model

Click here to download ENSPMEG00000022123's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMEG00000022123's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	44.568	ENSG00000137054	POLR1E	85	44.568	Homo_sapiens
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	68.889	ENSAPOG00000012452	polr1e	86	68.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	39.409	ENSAMEG00000010193	POLR1E	84	39.409	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	71.031	ENSACIG00000009884	polr1e	91	71.031	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.556	ENSAOCG00000005665	polr1e	87	75.556	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	76.111	ENSAPEG00000020581	polr1e	87	76.111	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	78.056	ENSATEG00000020609	polr1e	87	78.056	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	39.740	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	39.740	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.278	ENSANAG00000038046	POLR1E	85	45.278	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.278	ENSACLG00000013685	polr1e	86	75.278	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	56.145	ENSAMXG00000018181	polr1e	86	56.145	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	47.222	ENSBTAG00000012243	POLR1E	85	47.222	Bos_taurus
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	42.340	ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	47.134	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.611	ENSCAFG00000002377	POLR1E	85	43.611	Canis_familiaris
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.889	ENSCAFG00020017851	POLR1E	85	43.889	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.944	ENSCHIG00000019479	POLR1E	85	46.944	Capra_hircus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.167	ENSTSYG00000002075	POLR1E	85	44.167	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000022123	polr1e	75	42.424	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	42.424	Cavia_aperea
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.809	ENSCPOG00000009965	POLR1E	85	44.809	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	39.385	ENSCCAG00000029460	POLR1E	84	39.385	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	54.930	ENSCATG00000031732	POLR1E	85	54.930	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000022123	polr1e	78	47.869	ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	47.869	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	45.125	ENSCSAG00000010782	POLR1E	85	45.125	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000022123	polr1e	86	40.000	ENSCHOG00000013024	POLR1E	70	40.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.006	ENSCPBG00000006923	POLR1E	86	46.006	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	54.930	ENSCANG00000036112	POLR1E	85	54.930	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	42.659	ENSCGRG00001006197	Polr1e	82	42.659	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	42.105	ENSCGRG00000006430	Polr1e	82	42.105	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	69.553	ENSCSEG00000005121	polr1e	87	69.553	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	84.680	ENSCVAG00000019759	polr1e	87	84.680	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	90	57.061	ENSDARG00000006434	polr1e	87	56.825	Danio_rerio
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	36.364	ENSDNOG00000010257	POLR1E	87	36.364	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000022123	polr1e	89	42.651	ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.228	Echinops_telfairi
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.889	ENSEASG00005000675	POLR1E	85	43.889	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.889	ENSECAG00000014669	POLR1E	85	43.889	Equus_caballus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	38.611	ENSEEUG00000011928	POLR1E	76	38.611	Erinaceus_europaeus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	68.994	ENSELUG00000008150	polr1e	85	68.994	Esox_lucius
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.000	ENSFCAG00000013081	POLR1E	85	45.000	Felis_catus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.443	ENSFALG00000012950	POLR1E	90	43.443	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.175	ENSFDAG00000016917	POLR1E	85	46.175	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	84.444	ENSFHEG00000009801	polr1e	87	84.444	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	52.617	ENSGMOG00000003336	POLR1E	86	52.617	Gadus_morhua
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.753	ENSGALG00000005395	POLR1E	87	45.753	Gallus_gallus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	91.365	ENSGAFG00000004850	polr1e	87	91.365	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	67.956	ENSGACG00000016087	polr1e	86	67.956	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	40.997	ENSGAGG00000001659	POLR1E	87	41.783	Gopherus_agassizii
ENSPMEG00000022123	polr1e	88	52.778	ENSGGOG00000001882	POLR1E	85	52.778	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.000	ENSHBUG00000002559	polr1e	86	75.000	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.389	ENSHGLG00000002036	POLR1E	86	45.777	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.667	ENSHGLG00100012784	POLR1E	86	46.049	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	69.081	ENSHCOG00000002774	polr1e	86	69.081	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	55.028	ENSIPUG00000003019	polr1e	86	55.028	Ictalurus_punctatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	45.378	ENSSTOG00000009810	POLR1E	85	45.378	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.722	ENSJJAG00000020731	Polr1e	82	44.722	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	80.278	ENSKMAG00000000046	polr1e	87	80.278	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	74.373	ENSLBEG00000003104	polr1e	85	74.373	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	51.240	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.240	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	52.646	ENSLOCG00000012859	polr1e	85	52.646	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.722	ENSLAFG00000012831	POLR1E	85	44.722	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	54.930	ENSMFAG00000045465	POLR1E	85	54.930	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	54.930	ENSMMUG00000017892	POLR1E	85	54.930	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	40.379	ENSMNEG00000040283	POLR1E	85	40.379	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	54.930	ENSMLEG00000031135	POLR1E	85	54.930	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.487	ENSMAMG00000001260	polr1e	85	75.487	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.556	ENSMZEG00005021536	polr1e	86	75.556	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.611	ENSMAUG00000021044	Polr1e	82	43.611	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.000	ENSMICG00000003673	POLR1E	85	45.000	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	41.828	ENSMOCG00000012920	Polr1e	84	40.153	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.346	ENSMMOG00000007391	polr1e	88	75.346	Mola_mola
ENSPMEG00000022123	polr1e	89	44.638	ENSMODG00000002884	POLR1E	84	44.638	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	77.222	ENSMALG00000002665	polr1e	86	77.222	Monopterus_albus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.056	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	88	43.056	Mus_caroli
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.490	ENSMUSG00000028318	Polr1e	88	43.490	Mus_musculus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.628	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	88	44.628	Mus_pahari
ENSPMEG00000022123	polr1e	96	41.710	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	94	41.710	Mus_spretus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	39.512	ENSMPUG00000006040	POLR1E	86	36.983	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.111	ENSMLUG00000012688	POLR1E	82	46.111	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.556	ENSNGAG00000002520	Polr1e	82	45.556	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.556	ENSNBRG00000016822	polr1e	86	75.556	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000022123	polr1e	88	52.778	ENSNLEG00000003616	POLR1E	85	52.778	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000022123	polr1e	70	47.619	ENSMEUG00000015372	-	50	47.619	Notamacropus_eugenii
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	39.444	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	39.444	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.556	ENSODEG00000014565	POLR1E	83	46.556	Octodon_degus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.833	ENSONIG00000008921	polr1e	86	75.833	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.333	ENSOCUG00000024773	POLR1E	85	43.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	73.333	ENSORLG00000005143	polr1e	87	73.333	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	70.474	ENSORLG00020007271	polr1e	92	70.474	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	73.611	ENSORLG00015000137	polr1e	87	73.611	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	70.833	ENSOMEG00000013264	polr1e	85	70.833	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.722	ENSOGAG00000012981	POLR1E	83	44.722	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	47.222	ENSOARG00000011465	POLR1E	82	47.222	Ovis_aries
ENSPMEG00000022123	polr1e	88	52.778	ENSPPAG00000034566	POLR1E	85	52.778	Pan_paniscus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.000	ENSPPRG00000005649	POLR1E	85	45.000	Panthera_pardus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.000	ENSPTIG00000009774	POLR1E	85	45.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000022123	polr1e	88	52.778	ENSPTRG00000020944	POLR1E	85	52.778	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	54.930	ENSPANG00000025563	POLR1E	85	54.930	Papio_anubis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	60.331	ENSPKIG00000003562	polr1e	86	60.331	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.125	ENSPSIG00000003274	POLR1E	84	45.125	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	63.966	ENSPMGG00000024169	polr1e	86	63.966	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.333	ENSPEMG00000019151	-	82	43.333	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	36.695	ENSPEMG00000022300	-	80	36.695	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	45.098	ENSPCIG00000014798	POLR1E	86	45.098	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	92.727	ENSPFOG00000019627	polr1e	87	92.727	Poecilia_formosa
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	98.886	ENSPLAG00000022679	polr1e	87	98.886	Poecilia_latipinna
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	96.379	ENSPREG00000009470	polr1e	87	96.379	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	45.125	ENSPPYG00000019061	POLR1E	85	45.125	Pongo_abelii
ENSPMEG00000022123	polr1e	58	40.000	ENSPCAG00000004891	POLR1E	72	40.000	Procavia_capensis
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	45.404	ENSPCOG00000027448	POLR1E	85	45.125	Propithecus_coquereli
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.722	ENSPVAG00000007940	POLR1E	75	44.722	Pteropus_vampyrus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.278	ENSPNYG00000001032	polr1e	86	75.278	Pundamilia_nyererei
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	56.425	ENSPNAG00000006987	polr1e	86	56.425	Pygocentrus_nattereri
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	42.778	ENSRNOG00000012664	Polr1e	82	42.778	Rattus_norvegicus
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	45.125	ENSRBIG00000034214	POLR1E	93	45.125	Rhinopithecus_bieti
ENSPMEG00000022123	polr1e	87	54.930	ENSRROG00000031986	POLR1E	85	54.930	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMEG00000022123	polr1e	92	44.847	ENSSBOG00000021415	POLR1E	85	44.847	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMEG00000022123	polr1e	89	44.348	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	44.348	Sarcophilus_harrisii
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	63.056	ENSSFOG00015002293	polr1e	86	63.056	Scleropages_formosus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.419	ENSSMAG00000011672	polr1e	80	75.419	Scophthalmus_maximus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.278	ENSSDUG00000022279	polr1e	86	75.278	Seriola_dumerili
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	75.278	ENSSLDG00000024918	polr1e	86	75.278	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMEG00000022123	polr1e	60	39.655	ENSSARG00000009810	-	58	39.655	Sorex_araneus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	45.429	ENSSPUG00000009499	POLR1E	86	45.429	Sphenodon_punctatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	77.437	ENSSPAG00000021240	polr1e	87	77.437	Stegastes_partitus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.722	ENSSSCG00000005347	POLR1E	85	44.722	Sus_scrofa
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	37.713	ENSTGUG00000007169	POLR1E	92	37.713	Taeniopygia_guttata
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	67.680	ENSTRUG00000020779	polr1e	95	67.680	Takifugu_rubripes
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	71.111	ENSTNIG00000017812	polr1e	86	71.111	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.722	ENSTBEG00000013786	POLR1E	76	44.722	Tupaia_belangeri
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.628	ENSTTRG00000008294	POLR1E	77	44.628	Tursiops_truncatus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.444	ENSUAMG00000012474	POLR1E	83	46.906	Ursus_americanus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.444	ENSUMAG00000011496	POLR1E	85	44.444	Ursus_maritimus
ENSPMEG00000022123	polr1e	72	45.714	ENSVPAG00000009048	POLR1E	66	45.714	Vicugna_pacos
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.889	ENSVVUG00000019954	POLR1E	85	43.889	Vulpes_vulpes
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	43.802	ENSXETG00000006533	polr1e	86	43.802	Xenopus_tropicalis
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	87.222	ENSXCOG00000013706	polr1e	86	87.222	Xiphophorus_couchianus
ENSPMEG00000022123	polr1e	93	95.265	ENSXMAG00000012484	polr1e	87	95.265	Xiphophorus_maculatus