EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000023245 (Gene tree)
Gene ID: 106911610
Gene Symbol: mtrf1
Alias: -
Full Name: peptide chain release factor 1%2C mitochondrial-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8976 bases
Position: chrKQ555044.1:10097-19072
Accession: 106911610
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000034211	RF-1	PF00472.20	4.7e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000029726	-	5910	XM_014978414	ENSPMEP00000034211	439 (aa)	XP_014833900	UPI00072E8B7F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	41.067	ENSPMEG00000022846	mtrf1l	93	41.067

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSG00000120662	MTRF1	85	54.737	Homo_sapiens
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	75.959	ENSAPOG00000010181	mtrf1	95	75.959	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.759	ENSAMEG00000008696	MTRF1	86	55.759	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	85.281	ENSACIG00000001495	mtrf1	93	85.281	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	74.208	ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	74.208	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000023245	mtrf1	99	74.541	ENSAPEG00000014844	mtrf1	97	74.541	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000023245	mtrf1	91	73.086	ENSATEG00000017403	mtrf1	97	73.086	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	54.617	ENSAPLG00000009317	MTRF1	88	54.617	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000023245	mtrf1	92	52.184	ENSACAG00000000897	MTRF1	93	52.184	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	51.444	ENSANAG00000023063	-	84	51.444	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000023245	mtrf1	84	53.804	ENSANAG00000025310	-	92	57.015	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	74.253	ENSACLG00000023945	mtrf1	97	74.253	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	74.569	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	74.569	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.000	ENSBTAG00000012260	MTRF1	84	56.657	Bos_taurus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSCJAG00000017739	MTRF1	96	64.671	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.759	ENSCAFG00000004795	MTRF1	86	55.759	Canis_familiaris
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.759	ENSCAFG00020018178	MTRF1	86	55.759	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.000	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	55.000	Capra_hircus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	55.556	ENSTSYG00000006976	MTRF1	87	55.556	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	54.545	ENSCAPG00000013163	MTRF1	89	54.545	Cavia_aperea
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	54.286	ENSCPOG00000005264	MTRF1	86	54.286	Cavia_porcellus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.526	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	55.526	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.118	ENSCATG00000009909	MTRF1	86	55.118	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	54.737	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.856	ENSCSAG00000017835	MTRF1	86	54.856	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	80	54.571	ENSCHOG00000011915	-	86	54.571	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.068	ENSCPBG00000007969	MTRF1	85	54.068	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	54.737	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	96	52.844	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	94	52.844	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000023245	mtrf1	96	52.844	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	94	52.844	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	66.210	ENSCSEG00000005667	mtrf1	96	66.210	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	77.098	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	77.098	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	65.086	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	65.086	Danio_rerio
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	53.525	ENSDNOG00000034196	MTRF1	96	61.745	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	56.053	ENSDORG00000016429	Mtrf1	85	56.053	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.856	ENSETEG00000014811	MTRF1	85	54.856	Echinops_telfairi
ENSPMEG00000023245	mtrf1	52	55.459	ENSEBUG00000000778	mtrf1	94	55.459	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.263	ENSEASG00005015715	MTRF1	85	55.263	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.000	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	55.000	Equus_caballus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	43.750	ENSEEUG00000004450	-	86	43.342	Erinaceus_europaeus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	64.186	ENSELUG00000006544	mtrf1	97	64.186	Esox_lucius
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	56.545	ENSFCAG00000031635	MTRF1	86	56.545	Felis_catus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	52.577	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	52.577	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.263	ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.263	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	79.487	ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	79.487	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	66.138	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	66.138	Gadus_morhua
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	54.881	ENSGALG00000016951	MTRF1	83	54.881	Gallus_gallus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	92.744	ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	92.744	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	85	75.332	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	75.332	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	72	57.643	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	57.643	Gopherus_agassizii
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.000	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	55.000	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	53.947	ENSHGLG00000003210	MTRF1	85	53.947	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	53.947	ENSHGLG00100011843	MTRF1	85	53.947	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000023245	mtrf1	94	68.370	ENSHCOG00000009449	mtrf1	93	68.370	Hippocampus_comes
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	55.585	ENSSTOG00000021682	MTRF1	85	55.585	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.469	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	86	55.469	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	72.422	ENSKMAG00000003231	mtrf1	99	72.422	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	84.483	ENSLBEG00000027169	-	93	84.483	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	84.483	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	84.483	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	59.788	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	59.788	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	61.111	ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.111	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	42.782	ENSLAFG00000030499	-	84	42.782	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSLAFG00000022177	-	85	54.737	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.118	ENSMFAG00000037972	MTRF1	86	55.118	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.118	ENSMNEG00000035487	MTRF1	86	55.118	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.118	ENSMLEG00000033582	MTRF1	86	55.118	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	74.537	ENSMAMG00000022048	mtrf1	97	74.537	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	74.253	ENSMZEG00005017922	mtrf1	97	74.253	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	55.145	ENSMGAG00000014971	MTRF1	91	55.145	Meleagris_gallopavo
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	55.584	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	86	55.584	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.789	ENSMICG00000033131	MTRF1	85	55.789	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	56.915	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	84	56.915	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	69.828	ENSMMOG00000013394	mtrf1	95	69.828	Mola_mola
ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	54.521	ENSMODG00000014772	MTRF1	85	54.521	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	74.312	ENSMALG00000013274	mtrf1	99	74.312	Monopterus_albus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	83	57.808	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	82	57.808	Mus_caroli
ENSPMEG00000023245	mtrf1	96	52.844	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	93	52.844	Mus_musculus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	94	52.336	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	96	52.336	Mus_pahari
ENSPMEG00000023245	mtrf1	95	52.998	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	92	52.998	Mus_spretus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	56.021	ENSMPUG00000001874	MTRF1	86	56.021	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	56.021	ENSMLUG00000017237	MTRF1	86	56.021	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	97	52.448	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	95	52.448	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	85.776	ENSNBRG00000004634	mtrf1	98	85.776	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSNLEG00000001236	MTRF1	85	54.737	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	52.332	ENSMEUG00000001846	MTRF1	87	52.332	Notamacropus_eugenii
ENSPMEG00000023245	mtrf1	62	32.847	ENSOPRG00000006450	-	83	32.847	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSODEG00000005782	MTRF1	85	54.737	Octodon_degus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	80.366	ENSONIG00000012476	mtrf1	98	80.366	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	69	58.824	ENSOANG00000003383	-	97	58.824	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.789	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	55.789	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	70.833	ENSORLG00000003225	mtrf1	97	70.833	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	71.065	ENSORLG00020021048	mtrf1	96	71.065	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000023245	mtrf1	99	69.704	ENSORLG00015020957	mtrf1	98	69.704	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	69.816	ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	69.816	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000023245	mtrf1	80	57.714	ENSOGAG00000009719	-	78	57.714	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000023245	mtrf1	74	50.155	ENSOGAG00000026411	-	99	50.155	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.000	ENSOARG00000006994	MTRF1	85	55.000	Ovis_aries
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	54.737	Pan_paniscus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	56.545	ENSPPRG00000009511	MTRF1	86	56.545	Panthera_pardus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	56.545	ENSPTIG00000006673	MTRF1	86	56.545	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.737	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	54.737	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.118	ENSPANG00000010809	MTRF1	86	55.118	Papio_anubis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	85	59.249	ENSPKIG00000015711	mtrf1	87	59.249	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	53.806	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	53.806	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000023245	mtrf1	53	81.466	ENSPMGG00000006724	mtrf1	94	81.466	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	96	53.555	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	93	53.555	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000023245	mtrf1	76	49.563	ENSPMAG00000009849	mtrf1	98	49.854	Petromyzon_marinus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	54.026	ENSPCIG00000012940	MTRF1	87	54.026	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	98.861	ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	98.861	Poecilia_formosa
ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	98.405	ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	98.405	Poecilia_latipinna
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ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	54.211	ENSPPYG00000005313	MTRF1	85	54.211	Pongo_abelii
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