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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMEG00000024121 (Gene tree)
Gene ID: 106923798
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_mexicana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 32662 bases
Position: chrKQ551634.1:53697-86358
Accession: 106923798
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMEP00000034687	IBN_N	PF03810.19	1.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMET00000035275	-	7218	XM_014997099	ENSPMEP00000034687	890 (aa)	XP_014852585	UPI00072E77C5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	86.614	ENSPMEG00000006069	tnpo2	99	86.614
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	86.937	ENSPMEG00000014011	-	99	86.937

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.202	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.202	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.428	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.539	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	97.158	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.158	Amphilophus_citrinellus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.090	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	98.090	Amphiprion_ocellaris
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.090	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.090	Amphiprion_percula
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.090	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	98.090	Anabas_testudineus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	89.515	ENSAPLG00000009619	-	97	90.367	Anas_platyrhynchos
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.371	Anolis_carolinensis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	83.146	ENSANAG00000025351	-	99	83.146	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.921	ENSANAG00000022453	-	99	92.921	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	58.241	ENSANAG00000027118	-	99	60.421	Aotus_nancymaae
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	95.506	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.506	Astatotilapia_calliptera
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.507	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.395	Astyanax_mexicanus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.258	Bos_taurus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.034	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.034	Callithrix_jacchus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	93.349	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.349	Canis_familiaris
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	90.899	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.899	Canis_lupus_dingo
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.146	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.146	Capra_hircus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	89.944	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.281	Carlito_syrichta
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.921	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.921	Cebus_capucinus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.371	Cercocebus_atys
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.146	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.146	Chinchilla_lanigera
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.371	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	94	81.883	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.883	Choloepus_hoffmanni
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.933	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.933	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	76.880	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.655	Ciona_savignyi
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.371	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.258	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	93.450	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.450	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.404	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.404	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.539	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.539	Cyprinodon_variegatus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.725	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.164	Danio_rerio
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	87.794	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.794	Dasypus_novemcinctus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	93	93.373	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.366	Dipodomys_ordii
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	58.399	FBgn0035693	CG8219	99	58.174	Drosophila_melanogaster
ENSPMEG00000024121	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSPMEG00000024121	tnpo1	94	85.595	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.714	Eptatretus_burgeri
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.371	Equus_asinus_asinus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.371	Equus_caballus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	88.889	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.235	Esox_lucius
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.371	Felis_catus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.820	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.820	Ficedula_albicollis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.034	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.034	Fukomys_damarensis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.429	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.429	Fundulus_heteroclitus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.833	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	Gadus_morhua
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.258	Gallus_gallus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.767	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.767	Gambusia_affinis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.517	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.517	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.045	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.045	Gopherus_agassizii
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.371	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	78.139	ENSGGOG00000022535	-	98	78.139	Gorilla_gorilla
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	97.303	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.303	Haplochromis_burtoni
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.921	ENSHGLG00000000970	-	99	92.921	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMEG00000024121	tnpo1	97	72.907	ENSHGLG00100000963	-	99	72.209	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	92.991	ENSHGLG00100017090	-	99	92.991	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.596	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.596	Jaculus_jaculus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	97.303	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.303	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	91	94.081	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.711	Labrus_bergylta
ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	87.442	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	Latimeria_chalumnae
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.831	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.831	Lepisosteus_oculatus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	97	92.725	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.725	Loxodonta_africana
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.371	Macaca_fascicularis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.341	Macaca_mulatta
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.371	Macaca_nemestrina
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.371	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.090	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.090	Mastacembelus_armatus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.854	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.854	Maylandia_zebra
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	89.775	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.775	Microcebus_murinus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.258	Microtus_ochrogaster
ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	96.907	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.907	Mola_mola
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	94.043	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	Monodelphis_domestica
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.742	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.742	Monopterus_albus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.034	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.309	Mus_caroli
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.556	Mus_musculus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.146	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.432	Mus_pahari
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.034	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.309	Mus_spretus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.371	Mustela_putorius_furo
ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	93.132	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.132	Myotis_lucifugus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.371	Nannospalax_galili
ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	96.770	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.770	Neolamprologus_brichardi
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.371	Nomascus_leucogenys
ENSPMEG00000024121	tnpo1	90	87.935	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.910	Ochotona_princeps
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.921	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.921	Octodon_degus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.540	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.540	Oreochromis_niloticus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	92	94.390	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.390	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	87.150	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.150	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	97.147	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.147	Oryzias_latipes
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	97.294	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.294	Oryzias_latipes_hni
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	97.632	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.632	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	97.632	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.632	Oryzias_melastigma
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.371	Otolemur_garnettii
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.258	Ovis_aries
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.371	Pan_paniscus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.371	Panthera_pardus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.371	Panthera_tigris_altaica
ENSPMEG00000024121	tnpo1	94	82.044	ENSPTRG00000047731	-	100	82.044	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.371	Pan_troglodytes
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.371	Papio_anubis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	90.899	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.899	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.820	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.820	Pelodiscus_sinensis
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.388	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.164	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	93.450	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.450	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.045	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.045	Phascolarctos_cinereus
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	99.552	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	99.552	Poecilia_formosa
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ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	99.215	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	99.215	Poecilia_reticulata
ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.258	Pongo_abelii
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