EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000000514 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16034 bases
Position: chrKN462554.1:467324-483357
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000000564	RRM_1	PF00076.22	4.3e-33	1	2
ENSPMGP00000000564	RRM_1	PF00076.22	4.3e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000000590	MSI1-201	915	-	ENSPMGP00000000564	304 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.763	ENSG00000135097	MSI1	99	87.931	Homo_sapiens
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	90.722	ENSAPOG00000003191	MSI1	90	87.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	93.354	ENSAPOG00000023458	-	91	93.354	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	91.453	ENSAMEG00000013302	MSI1	79	91.453	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000000514	MSI1	98	93.333	ENSACIG00000017754	-	78	90.000	Amphilophus_citrinellus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	92.642	ENSAOCG00000009031	-	91	92.642	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	87.302	ENSAOCG00000003804	MSI1	90	87.302	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	93.354	ENSAPEG00000006857	-	76	93.354	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	87.302	ENSAPEG00000003245	MSI1	90	87.302	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	83.912	ENSATEG00000023779	-	90	83.912	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	98.944	ENSATEG00000017059	MSI1	85	98.944	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	82.263	ENSACAG00000002762	MSI1	91	83.180	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000000514	MSI1	99	81.188	ENSANAG00000027151	MSI1	94	81.763	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	73.968	ENSANAG00000027901	-	88	83.083	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	88.552	ENSACLG00000011230	MSI1	90	87.658	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	93.333	ENSACLG00000000117	-	96	93.312	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	93.031	ENSAMXG00000038960	msi1	71	93.031	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	86.731	ENSBTAG00000009800	MSI1	96	86.731	Bos_taurus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	86.774	ENSCJAG00000008578	MSI1	94	81.763	Callithrix_jacchus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.459	ENSCAFG00000010283	MSI1	94	81.459	Canis_familiaris
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.544	ENSCAFG00020020585	MSI1	96	81.544	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.024	ENSCHIG00000024304	MSI1	95	81.024	Capra_hircus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	80.892	ENSTSYG00000033949	MSI1	91	80.892	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	72.000	ENSCAPG00000003919	MSI1	85	72.000	Cavia_aperea
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.763	ENSCPOG00000012361	MSI1	96	81.763	Cavia_porcellus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.763	ENSCCAG00000035567	MSI1	94	81.763	Cebus_capucinus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	84.013	ENSCATG00000030019	MSI1	94	84.013	Cercocebus_atys
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.763	ENSCLAG00000011329	MSI1	96	81.763	Chinchilla_lanigera
ENSPMGG00000000514	MSI1	74	91.964	ENSCSAG00000002265	MSI1	77	91.964	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	90.301	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	84.906	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	80.952	ENSCANG00000040651	MSI1	96	80.952	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.763	ENSCGRG00001018883	Msi1	94	81.763	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.013	ENSCGRG00000002191	Msi1	69	81.013	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMGG00000000514	MSI1	99	85.404	ENSCSEG00000005834	-	90	86.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	97.973	ENSCSEG00000008352	-	90	97.973	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	94.237	ENSCSEG00000011032	MSI1	96	94.237	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	99.324	ENSCVAG00000009100	MSI1	90	99.324	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	52	64.286	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	78	64.286	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	61	64.216	ENSCVAG00000017463	-	82	64.216	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	80	83.168	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	93	83.168	Danio_rerio
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	93.993	ENSDARG00000010710	msi1	95	93.993	Danio_rerio
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	78.218	ENSDNOG00000005713	MSI1	87	78.218	Dasypus_novemcinctus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	80.374	ENSDORG00000005610	Msi1	91	80.374	Dipodomys_ordii
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	78.095	ENSETEG00000004756	MSI1	96	77.778	Echinops_telfairi
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	86.774	ENSEASG00005004736	MSI1	94	86.774	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	86.774	ENSECAG00000017526	MSI1	94	81.763	Equus_caballus
ENSPMGG00000000514	MSI1	98	89.274	ENSELUG00000023219	MSI1	84	89.274	Esox_lucius
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	87.013	ENSELUG00000023280	-	96	86.688	Esox_lucius
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	86.774	ENSFCAG00000011007	MSI1	94	81.763	Felis_catus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	85.366	ENSFALG00000007574	MSI1	96	85.366	Ficedula_albicollis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	80.635	ENSFDAG00000019586	MSI1	96	80.635	Fukomys_damarensis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	94.444	ENSFHEG00000022446	MSI1	91	93.038	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	90.136	ENSFHEG00000003560	-	92	90.136	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	89.841	ENSGMOG00000001006	MSI1	90	89.524	Gadus_morhua
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	77.188	ENSGMOG00000017838	-	90	77.188	Gadus_morhua
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	83.936	ENSGALG00000007227	MSI1	94	79.592	Gallus_gallus
ENSPMGG00000000514	MSI1	94	81.185	ENSGAFG00000005860	-	86	81.185	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	86.349	ENSGAFG00000021522	MSI1	90	86.349	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	79.878	ENSGACG00000008674	-	91	79.878	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	95.960	ENSGACG00000012679	MSI1	90	95.960	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	90.301	ENSGAGG00000016037	MSI1	90	90.301	Gopherus_agassizii
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.395	ENSGGOG00000010328	MSI1	96	81.395	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	87.658	ENSHBUG00000021921	MSI1	90	87.658	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	93.333	ENSHBUG00000011841	-	91	93.333	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.459	ENSHGLG00000012782	MSI1	94	81.459	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	80.635	ENSHGLG00100016848	MSI1	96	80.635	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	90.508	ENSHCOG00000012019	MSI1	96	90.508	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	97.173	ENSHCOG00000012067	-	85	97.173	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	92.683	ENSIPUG00000001976	msi1	95	92.683	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.544	ENSSTOG00000009799	MSI1	96	81.544	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	83.025	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	83.025	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000000514	MSI1	95	75.908	ENSJJAG00000010643	-	90	75.908	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	91.746	ENSKMAG00000011251	MSI1	90	91.746	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	91.864	ENSKMAG00000019877	-	96	91.864	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	93.243	ENSLBEG00000001375	-	90	87.619	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	98.316	ENSLBEG00000008789	MSI1	90	98.316	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.957	ENSLACG00000018287	MSI1	96	81.957	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000000514	MSI1	53	76.667	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	58	76.667	Lepisosteus_oculatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	93	76.712	ENSLAFG00000009412	MSI1	96	76.370	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.763	ENSMFAG00000001798	MSI1	96	81.763	Macaca_fascicularis
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.763	ENSMMUG00000031527	MSI1	93	81.763	Macaca_mulatta
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	86.774	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	86.774	Macaca_nemestrina
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	80.952	ENSMLEG00000003921	MSI1	96	80.952	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	92.381	ENSMAMG00000002279	MSI1	90	92.381	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	92.230	ENSMAMG00000018426	-	91	92.230	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	99.324	ENSMZEG00005000340	-	90	99.324	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	87.658	ENSMZEG00005026892	MSI1	90	87.658	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000000514	MSI1	72	94.675	ENSMGAG00000016518	-	100	94.675	Meleagris_gallopavo
ENSPMGG00000000514	MSI1	74	91.964	ENSMAUG00000016820	Msi1	92	91.964	Mesocricetus_auratus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	82.716	ENSMICG00000033181	MSI1	94	82.716	Microcebus_murinus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.459	ENSMOCG00000002286	Msi1	94	81.459	Microtus_ochrogaster
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	91.930	ENSMMOG00000012265	-	93	91.930	Mola_mola
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	91.216	ENSMMOG00000010492	MSI1	92	91.216	Mola_mola
ENSPMGG00000000514	MSI1	93	55.799	ENSMODG00000003189	-	96	55.799	Monodelphis_domestica
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	91.864	ENSMALG00000001426	-	96	91.864	Monopterus_albus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	96.393	ENSMALG00000017889	MSI1	91	96.393	Monopterus_albus
ENSPMGG00000000514	MSI1	90	89.354	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	89.354	Mus_caroli
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	83.923	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	89.354	Mus_musculus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	84.543	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	89.695	Mus_pahari
ENSPMGG00000000514	MSI1	90	89.354	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	89.354	Mus_spretus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.544	ENSMPUG00000003168	MSI1	96	81.544	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	72.136	ENSMLUG00000010313	MSI1	96	72.136	Myotis_lucifugus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.013	ENSNGAG00000014508	Msi1	88	81.013	Nannospalax_galili
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	99.324	ENSNBRG00000000841	-	90	99.324	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000000514	MSI1	91	76.190	ENSNBRG00000018012	MSI1	94	76.190	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000000514	MSI1	93	71.111	ENSNLEG00000015636	MSI1	96	71.111	Nomascus_leucogenys
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	60.000	ENSMEUG00000015759	MSI1	96	60.000	Notamacropus_eugenii
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	74.603	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	74.603	Ochotona_princeps
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ENSPMGG00000000514	MSI1	97	84.195	ENSONIG00000019452	-	90	84.195	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	99.187	ENSONIG00000011182	MSI1	91	93.333	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.544	ENSOCUG00000027716	MSI1	96	81.544	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMGG00000000514	MSI1	97	99.296	ENSORLG00000019978	-	89	99.296	Oryzias_latipes
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