EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000008755 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1814 bases
Position: chrKN465386.1:362991-364804
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000010580	SYF2	PF08231.12	4.6e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000011280	-	771	-	ENSPMGP00000010580	256 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPMGG00000008755's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMGG00000008755's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	ENSG00000117614	SYF2	97	77.966	Homo_sapiens
ENSPMGG00000008755	syf2	86	92.308	ENSAPOG00000001174	syf2	97	89.177	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.279	ENSAMEG00000010115	-	90	81.279	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000008755	syf2	76	81.538	ENSAMEG00000010134	-	100	81.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000008755	syf2	95	86.364	ENSACIG00000023688	syf2	96	86.364	Amphilophus_citrinellus
ENSPMGG00000008755	syf2	98	83.200	ENSAOCG00000022046	syf2	98	88.745	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000008755	syf2	82	88.626	ENSAOCG00000010912	syf2	66	88.626	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000008755	syf2	98	83.200	ENSAPEG00000018858	syf2	93	83.200	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000008755	syf2	85	92.627	ENSATEG00000007745	syf2	97	89.177	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000008755	syf2	78	82.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	Anas_platyrhynchos
ENSPMGG00000008755	syf2	80	79.902	ENSACAG00000013653	-	100	79.902	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000008755	syf2	65	65.868	ENSACAG00000026777	-	100	65.868	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	ENSANAG00000032473	SYF2	98	76.349	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000008755	syf2	86	91.855	ENSACLG00000019916	syf2	97	88.745	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000008755	syf2	91	84.120	ENSAMXG00000004051	syf2	98	84.120	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	82.353	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	82.353	Bos_taurus
ENSPMGG00000008755	syf2	81	52.133	WBGene00019402	syf-2	97	48.936	Caenorhabditis_elegans
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	ENSCJAG00000046570	SYF2	97	78.390	Callithrix_jacchus
ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	ENSCAFG00000012895	-	96	76.371	Canis_familiaris
ENSPMGG00000008755	syf2	93	71.308	ENSCAFG00000030331	-	99	71.308	Canis_familiaris
ENSPMGG00000008755	syf2	71	72.527	ENSCAFG00020021094	-	95	72.527	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	ENSCAFG00020021091	-	96	76.371	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.900	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	81.900	Capra_hircus
ENSPMGG00000008755	syf2	88	79.911	ENSTSYG00000005114	SYF2	92	79.911	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000008755	syf2	77	81.818	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	Cavia_aperea
ENSPMGG00000008755	syf2	94	76.763	ENSCPOG00000005326	SYF2	98	76.763	Cavia_porcellus
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	ENSCCAG00000022459	SYF2	97	78.390	Cebus_capucinus
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSCATG00000026917	SYF2	97	77.119	Cercocebus_atys
ENSPMGG00000008755	syf2	92	78.151	ENSCLAG00000008474	SYF2	98	78.151	Chinchilla_lanigera
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSCSAG00000000948	SYF2	97	77.119	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMGG00000008755	syf2	66	63.690	ENSCHOG00000005273	-	100	59.669	Choloepus_hoffmanni
ENSPMGG00000008755	syf2	87	81.166	ENSCPBG00000025073	SYF2	95	78.390	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMGG00000008755	syf2	83	55.140	ENSCING00000003017	-	89	55.607	Ciona_intestinalis
ENSPMGG00000008755	syf2	83	52.336	ENSCSAVG00000006627	-	98	52.336	Ciona_savignyi
ENSPMGG00000008755	syf2	92	67.797	ENSCANG00000037322	SYF2	96	67.797	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMGG00000008755	syf2	88	80.804	ENSCGRG00001020733	Syf2	93	80.804	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMGG00000008755	syf2	77	82.143	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMGG00000008755	syf2	85	88.073	ENSCSEG00000000117	syf2	100	82.008	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000008755	syf2	87	90.991	ENSCVAG00000019543	syf2	95	89.035	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000008755	syf2	89	85.590	ENSDARG00000004706	syf2	96	85.590	Danio_rerio
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSDNOG00000047605	SYF2	96	77.119	Dasypus_novemcinctus
ENSPMGG00000008755	syf2	88	81.333	ENSDORG00000001274	Syf2	92	81.333	Dipodomys_ordii
ENSPMGG00000008755	syf2	85	54.545	FBgn0033556	CG12343	97	54.545	Drosophila_melanogaster
ENSPMGG00000008755	syf2	82	68.095	ENSETEG00000015729	SYF2	92	69.048	Echinops_telfairi
ENSPMGG00000008755	syf2	77	60.914	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	Eptatretus_burgeri
ENSPMGG00000008755	syf2	93	75.510	ENSEASG00005004224	-	100	75.510	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000008755	syf2	88	71.875	ENSEASG00005004232	-	93	71.875	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000008755	syf2	88	81.250	ENSECAG00000010440	-	94	81.250	Equus_caballus
ENSPMGG00000008755	syf2	93	75.918	ENSECAG00000012023	-	100	75.918	Equus_caballus
ENSPMGG00000008755	syf2	68	66.857	ENSEEUG00000015084	SYF2	96	66.857	Erinaceus_europaeus
ENSPMGG00000008755	syf2	91	85.232	ENSELUG00000003465	syf2	99	85.232	Esox_lucius
ENSPMGG00000008755	syf2	92	76.371	ENSFCAG00000043095	-	96	76.371	Felis_catus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	82.648	ENSFCAG00000010324	-	76	82.648	Felis_catus
ENSPMGG00000008755	syf2	80	78.922	ENSFALG00000000460	SYF2	95	74.359	Ficedula_albicollis
ENSPMGG00000008755	syf2	92	78.390	ENSFDAG00000008310	SYF2	97	78.390	Fukomys_damarensis
ENSPMGG00000008755	syf2	87	75.446	ENSFHEG00000007238	syf2	99	75.446	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000008755	syf2	84	88.837	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	Gadus_morhua
ENSPMGG00000008755	syf2	89	79.295	ENSGALG00000013639	SYF2	94	77.311	Gallus_gallus
ENSPMGG00000008755	syf2	93	82.845	ENSGAFG00000019435	syf2	96	86.842	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.235	ENSGACG00000007305	syf2	97	84.120	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000008755	syf2	87	81.614	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	78.814	Gopherus_agassizii
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	ENSGGOG00000012796	SYF2	97	77.966	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000008755	syf2	89	89.868	ENSHBUG00000020477	syf2	97	89.868	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000008755	syf2	90	79.310	ENSHGLG00000014393	SYF2	95	79.310	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000008755	syf2	86	71.946	ENSHGLG00000004304	-	92	72.398	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000008755	syf2	90	79.310	ENSHGLG00100014722	SYF2	95	79.310	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000008755	syf2	99	83.465	ENSHCOG00000012904	syf2	83	83.465	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000008755	syf2	92	82.627	ENSIPUG00000019859	syf2	99	82.627	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000008755	syf2	57	76.712	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.712	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMGG00000008755	syf2	78	82.412	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	89.593	ENSKMAG00000013856	syf2	93	89.593	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	92.694	ENSLBEG00000014425	syf2	98	89.270	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.900	ENSLACG00000012064	SYF2	93	81.900	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000008755	syf2	87	86.996	ENSLOCG00000002728	syf2	89	86.996	Lepisosteus_oculatus
ENSPMGG00000008755	syf2	94	76.763	ENSLAFG00000023150	-	98	76.763	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000008755	syf2	71	53.476	ENSLAFG00000030814	-	100	53.476	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSMFAG00000041831	SYF2	97	77.119	Macaca_fascicularis
ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	ENSMMUG00000002968	SYF2	97	77.119	Macaca_mulatta
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSMNEG00000030180	SYF2	97	77.119	Macaca_nemestrina
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSMLEG00000030248	SYF2	97	77.119	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMGG00000008755	syf2	85	91.705	ENSMAMG00000010403	syf2	98	86.555	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000008755	syf2	90	88.745	ENSMZEG00005006429	syf2	97	88.745	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000008755	syf2	78	81.910	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	Meleagris_gallopavo
ENSPMGG00000008755	syf2	93	77.500	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	77.500	Mesocricetus_auratus
ENSPMGG00000008755	syf2	78	83.417	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	Microcebus_murinus
ENSPMGG00000008755	syf2	88	81.696	ENSMOCG00000022938	Syf2	93	81.696	Microtus_ochrogaster
ENSPMGG00000008755	syf2	86	90.045	ENSMMOG00000002396	syf2	92	90.045	Mola_mola
ENSPMGG00000008755	syf2	87	76.889	ENSMODG00000013951	-	97	77.578	Monodelphis_domestica
ENSPMGG00000008755	syf2	89	88.646	ENSMALG00000010706	syf2	95	89.083	Monopterus_albus
ENSPMGG00000008755	syf2	87	82.511	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	82.511	Mus_caroli
ENSPMGG00000008755	syf2	87	82.511	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	82.511	Mus_musculus
ENSPMGG00000008755	syf2	87	82.511	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	82.511	Mus_pahari
ENSPMGG00000008755	syf2	87	82.511	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	82.511	Mus_spretus
ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	ENSMPUG00000015802	-	89	81.279	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.364	ENSMPUG00000015801	-	89	81.364	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000008755	syf2	88	79.911	ENSMLUG00000001885	SYF2	92	79.911	Myotis_lucifugus
ENSPMGG00000008755	syf2	92	78.390	ENSNGAG00000007912	Syf2	96	78.390	Nannospalax_galili
ENSPMGG00000008755	syf2	91	78.481	ENSNBRG00000010720	syf2	100	76.151	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	ENSNLEG00000035185	SYF2	97	77.966	Nomascus_leucogenys
ENSPMGG00000008755	syf2	90	78.112	ENSOPRG00000012870	SYF2	96	78.112	Ochotona_princeps
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSODEG00000017664	-	99	77.119	Octodon_degus
ENSPMGG00000008755	syf2	94	68.050	ENSODEG00000014338	-	97	70.690	Octodon_degus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	92.308	ENSONIG00000008213	syf2	97	89.177	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000008755	syf2	79	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	79.741	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.688	ENSORLG00000028820	syf2	95	88.688	Oryzias_latipes
ENSPMGG00000008755	syf2	93	83.613	ENSORLG00020018333	syf2	100	83.613	Oryzias_latipes_hni
ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.235	ENSORLG00015014665	syf2	93	88.235	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMGG00000008755	syf2	86	90.498	ENSOMEG00000013911	syf2	93	90.498	Oryzias_melastigma
ENSPMGG00000008755	syf2	86	82.805	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	82.805	Otolemur_garnettii
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.166	ENSOARG00000006348	-	90	81.166	Ovis_aries
ENSPMGG00000008755	syf2	76	56.410	ENSOARG00000006269	-	100	56.410	Ovis_aries
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	ENSPPAG00000036579	SYF2	97	77.966	Pan_paniscus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	82.648	ENSPPRG00000001638	-	89	82.648	Panthera_pardus
ENSPMGG00000008755	syf2	92	76.371	ENSPPRG00000001651	-	96	76.371	Panthera_pardus
ENSPMGG00000008755	syf2	92	76.371	ENSPTIG00000007036	-	96	76.371	Panthera_tigris_altaica
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	ENSPTIG00000005711	-	83	79.386	Panthera_tigris_altaica
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	ENSPTRG00000000352	SYF2	97	77.966	Pan_troglodytes
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSPANG00000008139	SYF2	97	77.119	Papio_anubis
ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.688	ENSPKIG00000008130	syf2	94	88.688	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMGG00000008755	syf2	95	75.620	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	75.620	Pelodiscus_sinensis
ENSPMGG00000008755	syf2	88	81.250	ENSPEMG00000008283	Syf2	93	81.250	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMGG00000008755	syf2	87	79.821	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	79.821	Phascolarctos_cinereus
ENSPMGG00000008755	syf2	93	82.988	ENSPFOG00000004116	syf2	99	82.988	Poecilia_formosa
ENSPMGG00000008755	syf2	94	82.305	ENSPLAG00000006691	syf2	99	85.345	Poecilia_latipinna
ENSPMGG00000008755	syf2	93	81.250	ENSPMEG00000011684	syf2	98	83.772	Poecilia_mexicana
ENSPMGG00000008755	syf2	84	89.352	ENSPREG00000003009	syf2	98	85.470	Poecilia_reticulata
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.966	ENSPPYG00000001713	SYF2	97	77.966	Pongo_abelii
ENSPMGG00000008755	syf2	90	55.172	ENSPCOG00000027011	SYF2	93	55.172	Propithecus_coquereli
ENSPMGG00000008755	syf2	92	68.220	ENSPVAG00000005841	SYF2	96	68.220	Pteropus_vampyrus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	91.855	ENSPNYG00000004979	syf2	97	88.745	Pundamilia_nyererei
ENSPMGG00000008755	syf2	91	84.979	ENSPNAG00000015570	syf2	98	84.979	Pygocentrus_nattereri
ENSPMGG00000008755	syf2	87	82.511	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	82.511	Rattus_norvegicus
ENSPMGG00000008755	syf2	92	75.000	ENSRBIG00000042970	SYF2	97	75.000	Rhinopithecus_bieti
ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	ENSRROG00000001347	SYF2	97	77.119	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	ENSSBOG00000020184	SYF2	97	77.966	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMGG00000008755	syf2	87	79.372	ENSSHAG00000015630	-	90	79.372	Sarcophilus_harrisii
ENSPMGG00000008755	syf2	80	80.583	ENSSHAG00000007152	-	100	80.583	Sarcophilus_harrisii
ENSPMGG00000008755	syf2	88	87.946	ENSSFOG00015023647	syf2	95	87.946	Scleropages_formosus
ENSPMGG00000008755	syf2	91	85.837	ENSSMAG00000009867	syf2	98	85.837	Scophthalmus_maximus
ENSPMGG00000008755	syf2	85	94.037	ENSSDUG00000013072	syf2	98	89.270	Seriola_dumerili
ENSPMGG00000008755	syf2	85	94.037	ENSSLDG00000012677	syf2	98	89.270	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMGG00000008755	syf2	92	59.746	ENSSARG00000012889	SYF2	97	59.746	Sorex_araneus
ENSPMGG00000008755	syf2	93	77.178	ENSSPUG00000005251	SYF2	95	77.178	Sphenodon_punctatus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	91.855	ENSSPAG00000009626	syf2	93	91.855	Stegastes_partitus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.900	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.900	Sus_scrofa
ENSPMGG00000008755	syf2	58	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.299	Taeniopygia_guttata
ENSPMGG00000008755	syf2	98	79.681	ENSTRUG00000001499	syf2	100	79.681	Takifugu_rubripes
ENSPMGG00000008755	syf2	87	88.341	ENSTNIG00000016912	syf2	100	88.341	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMGG00000008755	syf2	89	59.307	ENSTBEG00000017370	SYF2	94	59.307	Tupaia_belangeri
ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.944	ENSTTRG00000003550	SYF2	97	76.695	Tursiops_truncatus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.735	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.735	Ursus_americanus
ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.279	Ursus_maritimus
ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.448	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	81.448	Vicugna_pacos
ENSPMGG00000008755	syf2	80	81.463	ENSVVUG00000027181	-	94	77.682	Vulpes_vulpes
ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	ENSVVUG00000027175	-	96	76.371	Vulpes_vulpes
ENSPMGG00000008755	syf2	91	76.724	ENSXETG00000022797	syf2	93	76.724	Xenopus_tropicalis
ENSPMGG00000008755	syf2	84	89.302	ENSXMAG00000022698	syf2	93	88.235	Xiphophorus_maculatus