EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000009718 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr1a
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24623 bases
Position: chrKN463252.1:11405-36027
Accession: ZDB-GENE-030131-5286
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000011750	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	4.3e-23	1	1
ENSPMGP00000011750	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	3e-68	1	1
ENSPMGP00000011750	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	2.5e-36	1	1
ENSPMGP00000011750	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	2.1e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000012536	-	2808	-	ENSPMGP00000011750	935 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPMGG00000009718's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMGG00000009718's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.342	ENSG00000068654	POLR1A	56	68.342	Homo_sapiens
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	82.035	ENSAPOG00000017945	polr1a	79	82.378	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.590	ENSAMEG00000005807	POLR1A	97	68.187	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	79.106	ENSACIG00000022147	polr1a	54	79.106	Amphilophus_citrinellus
ENSPMGG00000009718	polr1a	89	88.479	ENSAOCG00000017336	polr1a	51	88.804	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	81.690	ENSAPEG00000016105	polr1a	55	82.035	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	82.213	ENSATEG00000016773	polr1a	55	82.213	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	66.952	ENSACAG00000012141	POLR1A	55	66.952	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.342	ENSANAG00000033927	POLR1A	54	68.342	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	79.399	ENSACLG00000020541	polr1a	54	79.395	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.235	ENSBTAG00000006481	POLR1A	54	68.235	Bos_taurus
ENSPMGG00000009718	polr1a	92	43.920	WBGene00012999	rpoa-1	56	38.086	Caenorhabditis_elegans
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.556	ENSCJAG00000019547	POLR1A	54	67.556	Callithrix_jacchus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.235	ENSCAFG00000007613	POLR1A	54	68.235	Canis_familiaris
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	70.759	ENSCAFG00020014752	POLR1A	96	67.542	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.663	ENSCHIG00000018204	POLR1A	60	68.663	Capra_hircus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.235	ENSTSYG00000002761	POLR1A	54	68.235	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000009718	polr1a	92	68.102	ENSCAPG00000010132	POLR1A	57	68.102	Cavia_aperea
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.162	ENSCPOG00000012350	POLR1A	55	68.162	Cavia_porcellus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.235	ENSCCAG00000019839	POLR1A	54	68.235	Cebus_capucinus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.556	ENSCATG00000029786	POLR1A	54	68.556	Cercocebus_atys
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.085	ENSCLAG00000005187	POLR1A	55	68.085	Chinchilla_lanigera
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.449	ENSCSAG00000016251	POLR1A	54	68.449	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMGG00000009718	polr1a	77	78.392	ENSCHOG00000003766	-	78	78.392	Choloepus_hoffmanni
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.090	ENSCPBG00000001115	POLR1A	56	68.090	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	51.225	ENSCSAVG00000007184	-	55	51.222	Ciona_savignyi
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	63.568	ENSCANG00000031785	POLR1A	54	63.568	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	57.537	ENSCGRG00001006651	Polr1a	53	57.537	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	74.434	ENSCSEG00000020190	polr1a	55	74.434	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.263	ENSCVAG00000020941	polr1a	55	80.263	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	74.436	ENSDARG00000098375	polr1a	55	74.436	Danio_rerio
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	66.169	ENSDNOG00000010829	POLR1A	55	66.169	Dasypus_novemcinctus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	66.915	ENSDORG00000008298	Polr1a	55	66.915	Dipodomys_ordii
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	44.708	FBgn0019938	RpI1	56	44.708	Drosophila_melanogaster
ENSPMGG00000009718	polr1a	81	50.712	ENSEBUG00000005667	-	55	50.712	Eptatretus_burgeri
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.342	ENSEASG00005001625	POLR1A	54	68.342	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000009718	polr1a	96	67.932	ENSECAG00000036306	-	58	67.932	Equus_caballus
ENSPMGG00000009718	polr1a	96	67.932	ENSECAG00000030510	-	58	67.932	Equus_caballus
ENSPMGG00000009718	polr1a	96	67.932	ENSECAG00000010092	POLR1A	58	67.932	Equus_caballus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	76.319	ENSELUG00000012769	polr1a	54	76.319	Esox_lucius
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.877	ENSFCAG00000008966	POLR1A	54	68.877	Felis_catus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.343	ENSFALG00000010082	POLR1A	55	67.343	Ficedula_albicollis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.876	ENSFDAG00000013726	POLR1A	55	67.876	Fukomys_damarensis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	75.328	ENSFHEG00000005996	polr1a	54	75.328	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	72.297	ENSGMOG00000002230	polr1a	53	72.297	Gadus_morhua
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.129	ENSGALG00000038160	-	60	67.129	Gallus_gallus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	81.075	ENSGAFG00000015266	polr1a	54	81.075	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	77.292	ENSGACG00000018791	polr1a	54	77.292	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	81	72.490	ENSGAGG00000004984	-	95	71.245	Gopherus_agassizii
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.449	ENSGGOG00000001788	POLR1A	54	68.449	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.420	ENSHBUG00000020021	polr1a	61	80.420	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.090	ENSHGLG00000006334	POLR1A	55	68.090	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.728	ENSHGLG00100006614	POLR1A	55	67.728	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	77.703	ENSHCOG00000003345	polr1a	89	60.251	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	73.656	ENSIPUG00000013174	polr1a	55	73.871	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.410	ENSSTOG00000012580	POLR1A	55	68.410	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.332	ENSJJAG00000013113	Polr1a	55	68.332	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.652	ENSKMAG00000007399	polr1a	55	80.652	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000009718	polr1a	85	89.385	ENSLBEG00000015401	polr1a	51	89.385	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000009718	polr1a	89	68.722	ENSLACG00000003218	polr1a	97	68.722	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	73.212	ENSLOCG00000010881	polr1a	55	73.212	Lepisosteus_oculatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.975	ENSLAFG00000014948	POLR1A	55	67.975	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.449	ENSMFAG00000046097	POLR1A	54	68.449	Macaca_fascicularis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.556	ENSMMUG00000015815	POLR1A	54	68.556	Macaca_mulatta
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.449	ENSMNEG00000043313	POLR1A	54	68.449	Macaca_nemestrina
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.342	ENSMLEG00000042428	POLR1A	55	68.342	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	82.571	ENSMAMG00000016565	polr1a	55	82.571	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	82.340	ENSMZEG00005004915	polr1a	55	82.340	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	66.773	ENSMGAG00000013111	POLR1A	55	66.773	Meleagris_gallopavo
ENSPMGG00000009718	polr1a	81	70.558	ENSMAUG00000008497	Polr1a	50	70.558	Mesocricetus_auratus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.663	ENSMICG00000000757	POLR1A	54	68.663	Microcebus_murinus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.903	ENSMOCG00000000122	Polr1a	57	67.903	Microtus_ochrogaster
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.525	ENSMMOG00000010216	polr1a	55	80.525	Mola_mola
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.128	ENSMODG00000009335	POLR1A	54	67.128	Monodelphis_domestica
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	81.868	ENSMALG00000013363	polr1a	55	81.868	Monopterus_albus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.725	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	90	47.266	Mus_caroli
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.622	ENSMUSG00000049553	Polr1a	90	46.245	Mus_musculus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.259	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	90	47.826	Mus_pahari
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.622	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	90	46.245	Mus_spretus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.235	ENSMPUG00000009135	POLR1A	54	68.235	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.585	ENSMLUG00000015723	POLR1A	55	67.585	Myotis_lucifugus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.365	ENSNGAG00000017907	Polr1a	55	68.365	Nannospalax_galili
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	82.232	ENSNBRG00000000519	polr1a	55	82.232	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.380	ENSNLEG00000002264	POLR1A	54	67.380	Nomascus_leucogenys
ENSPMGG00000009718	polr1a	88	70.588	ENSOPRG00000008269	POLR1A	50	70.588	Ochotona_princeps
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.623	ENSODEG00000003542	POLR1A	55	68.623	Octodon_degus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	81.283	ENSONIG00000015895	polr1a	55	81.283	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000009718	polr1a	71	59.891	ENSOANG00000012384	-	99	60.164	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.128	ENSOCUG00000010138	POLR1A	55	68.128	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.498	ENSORLG00000008753	polr1a	55	80.498	Oryzias_latipes
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.442	ENSORLG00020020726	polr1a	55	80.442	Oryzias_latipes_hni
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	75.727	ENSORLG00015016071	polr1a	52	75.727	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.556	ENSOGAG00000004031	POLR1A	54	68.770	Otolemur_garnettii
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.410	ENSOARG00000020601	POLR1A	54	68.410	Ovis_aries
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.128	ENSPPAG00000042450	POLR1A	54	68.128	Pan_paniscus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.877	ENSPPRG00000006702	POLR1A	54	68.877	Panthera_pardus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.013	ENSPTIG00000018783	POLR1A	55	68.013	Panthera_tigris_altaica
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.021	ENSPTRG00000012147	POLR1A	54	68.021	Pan_troglodytes
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.342	ENSPANG00000025908	POLR1A	54	68.342	Papio_anubis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	74.944	ENSPKIG00000005468	polr1a	54	74.110	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.047	ENSPEMG00000022224	Polr1a	55	68.047	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.476	ENSPCIG00000004222	POLR1A	58	67.476	Phascolarctos_cinereus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	78.873	ENSPFOG00000005025	polr1a	55	78.982	Poecilia_formosa
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	78.873	ENSPLAG00000021389	polr1a	55	78.982	Poecilia_latipinna
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	75.490	ENSPMEG00000006463	polr1a	54	76.170	Poecilia_mexicana
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.112	ENSPREG00000002389	polr1a	54	80.112	Poecilia_reticulata
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.594	ENSPPYG00000012217	POLR1A	54	67.594	Pongo_abelii
ENSPMGG00000009718	polr1a	87	60.208	ENSPCAG00000011582	POLR1A	51	60.208	Procavia_capensis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.877	ENSPCOG00000026987	POLR1A	54	68.877	Propithecus_coquereli
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	82.232	ENSPNYG00000000026	polr1a	55	82.232	Pundamilia_nyererei
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	74.919	ENSPNAG00000019223	polr1a	55	74.919	Pygocentrus_nattereri
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.941	ENSRNOG00000009545	Polr1a	55	67.941	Rattus_norvegicus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.342	ENSRBIG00000028335	POLR1A	54	68.342	Rhinopithecus_bieti
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.342	ENSRROG00000031473	POLR1A	54	68.342	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.021	ENSSBOG00000030262	POLR1A	54	68.021	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMGG00000009718	polr1a	92	62.378	ENSSHAG00000014739	POLR1A	54	62.378	Sarcophilus_harrisii
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	73.724	ENSSFOG00015019716	polr1a	55	73.941	Scleropages_formosus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	81.630	ENSSMAG00000014342	polr1a	55	81.630	Scophthalmus_maximus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	82.900	ENSSDUG00000014631	polr1a	55	83.117	Seriola_dumerili
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	81.075	ENSSLDG00000024095	polr1a	54	81.075	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	70.220	ENSSPUG00000004215	POLR1A	57	70.220	Sphenodon_punctatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	78.731	ENSSPAG00000016341	polr1a	96	78.731	Stegastes_partitus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.196	ENSSSCG00000008226	POLR1A	65	68.196	Sus_scrofa
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	66.844	ENSTGUG00000010704	POLR1A	56	66.844	Taeniopygia_guttata
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	78.370	ENSTRUG00000002210	polr1a	96	74.729	Takifugu_rubripes
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	73.751	ENSTNIG00000010116	polr1a	55	73.751	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	65.455	ENSTTRG00000008597	POLR1A	54	65.455	Tursiops_truncatus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.462	ENSUMAG00000006700	POLR1A	97	67.059	Ursus_maritimus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.021	ENSVVUG00000001245	POLR1A	54	68.021	Vulpes_vulpes
ENSPMGG00000009718	polr1a	93	65.517	ENSXETG00000001952	polr1a	64	66.013	Xenopus_tropicalis
ENSPMGG00000009718	polr1a	77	75.342	ENSXCOG00000013384	polr1a	92	75.342	Xiphophorus_couchianus
ENSPMGG00000009718	polr1a	95	78.571	ENSXMAG00000004032	polr1a	55	78.571	Xiphophorus_maculatus