EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000017014 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9032 bases
Position: chrKN462367.1:985489-994520
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000020986	IBN_N	PF03810.19	1.9e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000022373	-	2670	-	ENSPMGP00000020986	889 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPMGG00000017014's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMGG00000017014's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSG00000083312	TNPO1	100	92.746	Homo_sapiens
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.388	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.613	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	88.988	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	89.655	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	93.806	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.935	Amphilophus_citrinellus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.501	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.725	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.501	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.725	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.276	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.501	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	86.937	ENSAPLG00000009619	-	99	86.712	Anas_platyrhynchos
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	90.797	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	81.777	ENSANAG00000025351	-	99	81.777	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	ENSANAG00000022453	-	99	90.123	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	57.492	ENSANAG00000027118	-	99	59.247	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.593	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.929	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	91.153	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.041	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	90.348	Bos_taurus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	90.236	Callithrix_jacchus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	90.676	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	90.676	Canis_familiaris
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	88.103	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	87.991	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	90.460	Capra_hircus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	87.359	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	89.603	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	90.123	Cebus_capucinus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	90.460	Cercocebus_atys
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	90.236	Chinchilla_lanigera
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	90.460	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	94	79.048	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	78.929	Choloepus_hoffmanni
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.685	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	90.797	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	75.618	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.618	Ciona_savignyi
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	90.460	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	90.348	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	90.654	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	90.654	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.593	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.929	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.715	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.939	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	91.256	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.031	Danio_rerio
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	85.347	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	85.235	Dasypus_novemcinctus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	93	90.975	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	90.964	Dipodomys_ordii
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	57.401	FBgn0035693	CG8219	99	56.949	Drosophila_melanogaster
ENSPMGG00000017014	tnpo1	86	92.164	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	92.164	Echinops_telfairi
ENSPMGG00000017014	tnpo1	94	83.790	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	83.790	Eptatretus_burgeri
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	90.460	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	90.460	Equus_caballus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	84.984	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	84.875	Esox_lucius
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	90.460	Felis_catus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	90.460	Ficedula_albicollis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	90.123	Fukomys_damarensis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.058	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.283	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.045	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.933	Gadus_morhua
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	90.460	Gallus_gallus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.393	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.617	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.593	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.154	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.797	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	90.797	Gopherus_agassizii
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	75.812	ENSGGOG00000022535	-	98	75.812	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	90.460	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.052	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.388	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSHGLG00000000970	-	99	90.236	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	90.548	ENSHGLG00100017090	-	99	90.432	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000017014	tnpo1	97	71.711	ENSHGLG00100000963	-	99	71.362	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	90.685	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.154	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.266	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	91	90.394	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.148	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	84.785	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	84.785	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	91.134	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	91.134	Lepisosteus_oculatus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	97	90.081	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	90.081	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	90.460	Macaca_fascicularis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	90.530	Macaca_mulatta
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	90.460	Macaca_nemestrina
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	90.460	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.164	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.388	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.827	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	94.164	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	91.011	Mesocricetus_auratus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	87.093	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	87.093	Microcebus_murinus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	90.348	Microtus_ochrogaster
ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	91.892	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.793	Mola_mola
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	91.720	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	91.720	Monodelphis_domestica
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.490	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	93.490	Monopterus_albus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.123	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	91.011	Mus_caroli
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	91.011	Mus_musculus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	91.011	Mus_pahari
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	91.011	Mus_spretus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.685	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	90.572	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	90.349	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	90.233	Myotis_lucifugus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	90.460	Nannospalax_galili
ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	93.161	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.548	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	90.460	Nomascus_leucogenys
ENSPMGG00000017014	tnpo1	90	85.918	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	85.773	Ochotona_princeps
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	90.236	Octodon_degus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.311	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.645	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	92	90.987	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	91.108	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	85.380	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	85.380	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	92.876	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.617	Oryzias_latipes
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	93.468	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.243	Oryzias_latipes_hni
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	93.581	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.356	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	93.018	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.243	Oryzias_melastigma
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	90.460	Otolemur_garnettii
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	90.685	Ovis_aries
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	90.460	Pan_paniscus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	90.460	Panthera_pardus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	90.460	Panthera_tigris_altaica
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	90.460	Pan_troglodytes
ENSPMGG00000017014	tnpo1	94	79.448	ENSPTRG00000047731	-	100	79.448	Pan_troglodytes
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	90.460	Papio_anubis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	87.654	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	87.654	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.685	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	90.797	Pelodiscus_sinensis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	90.654	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	90.654	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.909	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	90.797	Phascolarctos_cinereus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.960	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.960	Poecilia_formosa
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.960	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.960	Poecilia_latipinna
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.164	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.388	Poecilia_mexicana
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.505	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.729	Poecilia_reticulata
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	90.348	Pongo_abelii
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	90.460	Propithecus_coquereli
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	90.348	Pteropus_vampyrus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.834	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	94.395	Pundamilia_nyererei
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	91.041	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	90.929	Pygocentrus_nattereri
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	90.348	Rattus_norvegicus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	90.460	Rhinopithecus_bieti
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	90.460	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	90.236	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	91.121	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	91.355	Sarcophilus_harrisii
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.825	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	93.161	Scleropages_formosus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	93.932	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	94.166	Scophthalmus_maximus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.388	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.613	Seriola_dumerili
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.276	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	94.501	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	90.236	Sphenodon_punctatus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.501	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.725	Stegastes_partitus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	90.460	Sus_scrofa
ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	88.517	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	88.740	Taeniopygia_guttata
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.266	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.603	Takifugu_rubripes
ENSPMGG00000017014	tnpo1	69	89.739	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.739	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	93.333	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	Tupaia_belangeri
ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	87.150	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	87.033	Tursiops_truncatus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	90.460	Ursus_maritimus
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	86.644	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	86.644	Vicugna_pacos
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	90.460	Vulpes_vulpes
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	89.876	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	89.764	Xenopus_tropicalis
ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.834	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.834	Xiphophorus_maculatus