EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000019065 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5458 bases
Position: chrKN465738.1:336906-342363
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000023581	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000025126	-	1347	-	ENSPMGP00000023581	448 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Amphiprion_ocellaris
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Amphiprion_percula
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.797	Anolis_carolinensis
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	77.951	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	77.951	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	59.912	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.912	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	80	61.838	ENSCING00000020807	-	95	61.838	Ciona_intestinalis
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	98	57.273	ENSCSAVG00000009987	-	98	57.500	Ciona_savignyi
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	83.036	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	80.189	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	84.152	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	98	80.455	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	80.455	Danio_rerio
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.980	Danio_rerio
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	81	54.098	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	98	54.098	Eptatretus_burgeri
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	77.803	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	77.803	Esox_lucius
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	83.929	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	83.929	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	89	54.250	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.250	Gadus_morhua
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	84.152	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	82	65.768	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	92	65.768	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	58	91.473	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	91.473	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	82.432	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	82.432	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	76.169	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.169	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.277	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	84	58.511	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	58.511	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	84.598	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	84.598	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	85.714	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	85.714	Labrus_bergylta
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	60.674	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	60.899	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	73.154	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.154	Lepisosteus_oculatus
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	58.206	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.206	Mola_mola
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	96	59.815	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	59.815	Neolamprologus_brichardi
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes
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ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	59.081	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.870	Paramormyrops_kingsleyae
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