EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000020708 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: -
Full Name: aconitase 1%2C soluble
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11508 bases
Position: chrKN461261.1:109930-121437
Accession: ZDB-GENE-031118-76
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000025651	Aconitase	PF00330.20	4.7e-181	1	1
ENSPMGP00000025651	Aconitase_C	PF00694.19	5.7e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000027322	-	2685	-	ENSPMGP00000025651	894 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPMGG00000020708's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMGG00000020708's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSG00000122729	ACO1	99	82.320	Homo_sapiens
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.479	ENSAPOG00000008670	aco1	100	88.479	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.902	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	82.902	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.926	ENSACIG00000014377	aco1	100	88.926	Amphilophus_citrinellus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	89.150	ENSAOCG00000007699	aco1	100	89.150	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000020708	aco1	100	89.038	ENSAPEG00000014370	aco1	100	89.038	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000020708	aco1	100	90.157	ENSATEG00000000560	aco1	100	90.157	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.074	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.074	Anas_platyrhynchos
ENSPMGG00000020708	aco1	96	81.374	ENSACAG00000001541	ACO1	99	81.374	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	80.947	ENSANAG00000003359	ACO1	99	80.947	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.591	ENSACLG00000007755	aco1	100	88.591	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000020708	aco1	99	86.277	ENSAMXG00000002499	aco1	99	86.277	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.770	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	82.770	Bos_taurus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.194	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	81.194	Callithrix_jacchus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.247	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	82.247	Canis_familiaris
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.432	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	82.432	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.883	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	82.883	Capra_hircus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.658	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	82.658	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000020708	aco1	99	67.306	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	67.193	Cavia_aperea
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.751	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	82.751	Cavia_porcellus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.532	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	81.532	Cebus_capucinus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSCATG00000045333	ACO1	99	82.320	Cercocebus_atys
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.511	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.511	Chinchilla_lanigera
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.095	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	82.095	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMGG00000020708	aco1	90	65.471	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	65.315	Choloepus_hoffmanni
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.962	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	81.962	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.095	ENSCANG00000014847	ACO1	99	82.095	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.540	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	83.540	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.751	ENSCGRG00000004877	-	99	82.751	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMGG00000020708	aco1	100	85.794	ENSCSEG00000018262	aco1	100	85.794	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000020708	aco1	100	81.320	ENSCVAG00000020264	aco1	100	81.320	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	85.923	ENSDARG00000026376	aco1	99	85.923	Danio_rerio
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.883	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	82.883	Dasypus_novemcinctus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.976	ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.976	Dipodomys_ordii
ENSPMGG00000020708	aco1	85	65.608	ENSETEG00000012415	-	85	65.608	Echinops_telfairi
ENSPMGG00000020708	aco1	99	56.118	ENSEBUG00000015441	aco1	97	57.700	Eptatretus_burgeri
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.770	ENSEASG00005004602	ACO1	99	82.770	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.658	ENSECAG00000014846	ACO1	99	82.658	Equus_caballus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	70.833	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	70.833	Erinaceus_europaeus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	85.152	ENSELUG00000016812	aco1	97	85.152	Esox_lucius
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.207	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	82.207	Felis_catus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.736	ENSFALG00000001167	ACO1	99	81.736	Ficedula_albicollis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.525	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	82.525	Fukomys_damarensis
ENSPMGG00000020708	aco1	100	87.808	ENSFHEG00000005619	aco1	100	87.808	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.802	ENSGMOG00000005514	aco1	99	83.802	Gadus_morhua
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.962	ENSGALG00000002162	ACO1	99	81.962	Gallus_gallus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.143	ENSGACG00000001637	aco1	100	88.143	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.962	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.962	Gopherus_agassizii
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	82.320	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.702	ENSHBUG00000008952	aco1	100	88.702	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.074	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	82.074	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.074	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.074	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000020708	aco1	100	85.011	ENSHCOG00000015881	aco1	100	85.011	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000020708	aco1	99	84.702	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	84.797	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.315	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	83.315	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.751	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	82.751	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.367	ENSKMAG00000015759	aco1	100	88.367	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	85.028	ENSLBEG00000013866	aco1	100	85.028	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000020708	aco1	75	71.259	ENSLACG00000000936	ACO1	99	71.237	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.296	ENSLOCG00000011082	aco1	99	83.296	Lepisosteus_oculatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	80.405	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	80.405	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.207	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	82.207	Macaca_fascicularis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	82.320	Macaca_mulatta
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.095	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	82.095	Macaca_nemestrina
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	82.320	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	90.045	ENSMAMG00000002915	aco1	100	90.045	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	85.173	ENSMZEG00005012733	aco1	100	84.838	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000020708	aco1	99	66.444	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	66.444	Meleagris_gallopavo
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.089	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	83.089	Mesocricetus_auratus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.770	ENSMICG00000006540	ACO1	99	82.770	Microcebus_murinus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.427	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	83.427	Microtus_ochrogaster
ENSPMGG00000020708	aco1	99	88.288	ENSMMOG00000020282	aco1	99	88.288	Mola_mola
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSMODG00000004463	ACO1	99	82.320	Monodelphis_domestica
ENSPMGG00000020708	aco1	100	89.709	ENSMALG00000019764	aco1	100	89.709	Monopterus_albus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.766	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	83.766	Mus_caroli
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.653	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	83.653	Mus_musculus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.878	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	83.878	Mus_pahari
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.878	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.878	Mus_spretus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.658	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	82.658	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000020708	aco1	99	80.743	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	80.743	Myotis_lucifugus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.864	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	82.864	Nannospalax_galili
ENSPMGG00000020708	aco1	100	69.299	ENSNBRG00000008973	aco1	100	70.968	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.207	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	82.207	Nomascus_leucogenys
ENSPMGG00000020708	aco1	89	77.803	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	77.803	Notamacropus_eugenii
ENSPMGG00000020708	aco1	99	78.829	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	78.829	Ochotona_princeps
ENSPMGG00000020708	aco1	99	79.481	ENSODEG00000001240	-	99	79.481	Octodon_degus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	77.001	ENSODEG00000015432	-	99	76.663	Octodon_degus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.591	ENSONIG00000019869	aco1	100	88.591	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000020708	aco1	81	82.711	ENSOANG00000012132	ACO1	100	82.711	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.960	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	81.737	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	89.189	ENSORLG00000020656	aco1	99	89.189	Oryzias_latipes
ENSPMGG00000020708	aco1	99	88.851	ENSORLG00020010991	aco1	99	88.851	Oryzias_latipes_hni
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.479	ENSORLG00015011785	aco1	100	88.479	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMGG00000020708	aco1	99	87.318	ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.318	Oryzias_melastigma
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.883	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	82.883	Otolemur_garnettii
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.883	ENSOARG00000014707	ACO1	99	82.623	Ovis_aries
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	82.320	Pan_paniscus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	82.320	Panthera_pardus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.207	ENSPTIG00000016606	ACO1	99	81.951	Panthera_tigris_altaica
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	82.320	Pan_troglodytes
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.320	ENSPANG00000025270	ACO1	99	82.320	Papio_anubis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.747	ENSPKIG00000023168	aco1	99	81.747	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.638	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	82.638	Pelodiscus_sinensis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.315	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	83.315	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.490	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	82.763	Phascolarctos_cinereus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	86.689	ENSPFOG00000013405	aco1	99	87.257	Poecilia_formosa
ENSPMGG00000020708	aco1	90	87.266	ENSPLAG00000023422	aco1	98	87.266	Poecilia_latipinna
ENSPMGG00000020708	aco1	90	87.173	ENSPMEG00000011800	aco1	98	87.173	Poecilia_mexicana
ENSPMGG00000020708	aco1	100	87.248	ENSPREG00000021791	aco1	100	87.248	Poecilia_reticulata
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.982	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	81.982	Pongo_abelii
ENSPMGG00000020708	aco1	77	87.736	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	87.736	Procavia_capensis
ENSPMGG00000020708	aco1	88	83.544	ENSPCOG00000021198	ACO1	100	83.544	Propithecus_coquereli
ENSPMGG00000020708	aco1	96	77.635	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	77.635	Pteropus_vampyrus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.702	ENSPNYG00000009425	aco1	100	88.702	Pundamilia_nyererei
ENSPMGG00000020708	aco1	99	85.923	ENSPNAG00000017918	aco1	99	85.923	Pygocentrus_nattereri
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.315	ENSRNOG00000005849	Aco1	99	83.315	Rattus_norvegicus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.095	ENSRBIG00000034592	ACO1	99	82.095	Rhinopithecus_bieti
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.207	ENSRROG00000042672	ACO1	99	82.207	Rhinopithecus_roxellana
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.757	ENSSBOG00000026008	ACO1	99	81.757	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.962	ENSSHAG00000008924	ACO1	99	81.962	Sarcophilus_harrisii
ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.108	ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.108	Scleropages_formosus
ENSPMGG00000020708	aco1	75	89.270	ENSSMAG00000018908	aco1	80	89.205	Scophthalmus_maximus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	89.933	ENSSDUG00000002984	aco1	100	89.933	Seriola_dumerili
ENSPMGG00000020708	aco1	100	90.157	ENSSLDG00000013952	aco1	100	90.157	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMGG00000020708	aco1	96	80.140	ENSSARG00000008437	ACO1	100	80.140	Sorex_araneus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	80.926	ENSSPUG00000002916	ACO1	99	80.926	Sphenodon_punctatus
ENSPMGG00000020708	aco1	100	89.597	ENSSPAG00000019147	aco1	100	89.597	Stegastes_partitus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.432	ENSSSCG00000023807	ACO1	99	82.432	Sus_scrofa
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.398	ENSTGUG00000001505	ACO1	99	81.398	Taeniopygia_guttata
ENSPMGG00000020708	aco1	99	85.859	ENSTRUG00000006888	aco1	100	85.746	Takifugu_rubripes
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.285	ENSTNIG00000005288	aco1	99	81.285	Tetraodon_nigroviridis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	78.941	ENSTBEG00000012369	ACO1	99	78.941	Tupaia_belangeri
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.545	ENSTTRG00000016991	ACO1	99	82.545	Tursiops_truncatus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.883	ENSUAMG00000020699	ACO1	99	82.883	Ursus_americanus
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.883	ENSUMAG00000005807	ACO1	99	82.883	Ursus_maritimus
ENSPMGG00000020708	aco1	95	82.021	ENSVPAG00000009876	ACO1	99	82.021	Vicugna_pacos
ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.175	ENSVVUG00000021152	ACO1	92	82.175	Vulpes_vulpes
ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.257	ENSXETG00000009184	aco1	99	81.257	Xenopus_tropicalis
ENSPMGG00000020708	aco1	99	87.234	ENSXMAG00000023603	aco1	99	87.234	Xiphophorus_maculatus