EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000024089 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4897 bases
Position: chrKN460897.1:568426-573322
Accession: ZDB-GENE-111117-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000029943	NRDE-2	PF08424.10	7.5e-99	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000031872	-	3255	-	ENSPMGP00000029943	1084 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPMGG00000024089's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPMGG00000024089's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	45.900	ENSG00000119720	NRDE2	100	62.745	Homo_sapiens
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	63.543	ENSAPOG00000009202	nrde2	97	64.626	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000024089	nrde2	97	43.989	ENSAMEG00000001807	NRDE2	92	45.255	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000024089	nrde2	99	65.194	ENSACIG00000014783	nrde2	100	65.371	Amphilophus_citrinellus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	64.384	ENSAOCG00000015576	nrde2	97	65.470	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	64.772	ENSAPEG00000001711	nrde2	97	65.606	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	64.274	ENSATEG00000010247	nrde2	97	64.359	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	47.026	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	46.441	Anas_platyrhynchos
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	45.543	ENSACAG00000014571	NRDE2	87	45.917	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	43.026	ENSANAG00000025313	NRDE2	92	43.710	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.985	ENSACLG00000025154	nrde2	97	63.503	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000024089	nrde2	87	66.667	ENSAMXG00000034642	nrde2	93	44.986	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	45.345	ENSBTAG00000005427	NRDE2	91	46.244	Bos_taurus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	45.961	ENSCJAG00000017711	NRDE2	92	46.563	Callithrix_jacchus
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	44.316	ENSCAFG00000017515	NRDE2	92	43.882	Canis_familiaris
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	45.841	ENSCAFG00020016346	NRDE2	87	46.117	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	45.394	ENSCHIG00000005876	NRDE2	91	45.638	Capra_hircus
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	44.610	ENSTSYG00000000161	NRDE2	92	45.138	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	46.389	ENSCAPG00000012039	NRDE2	89	47.839	Cavia_aperea
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	46.204	ENSCPOG00000002428	NRDE2	87	47.743	Cavia_porcellus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	46.190	ENSCCAG00000024917	NRDE2	92	46.606	Cebus_capucinus
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	46.101	ENSCLAG00000015185	NRDE2	87	46.724	Chinchilla_lanigera
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	46.575	ENSCSAG00000011451	NRDE2	92	45.929	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMGG00000024089	nrde2	69	44.556	ENSCHOG00000006165	NRDE2	67	44.979	Choloepus_hoffmanni
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	46.981	ENSCPBG00000008537	NRDE2	86	47.939	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	46.471	ENSCANG00000029067	NRDE2	92	45.738	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	44.922	ENSCGRG00001015658	Nrde2	90	46.353	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	45.295	ENSCGRG00000005062	Nrde2	90	46.741	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMGG00000024089	nrde2	98	62.568	ENSCSEG00000000089	nrde2	99	64.293	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.640	ENSCVAG00000023105	nrde2	97	62.813	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	53.782	ENSDARG00000074726	nrde2	92	53.683	Danio_rerio
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	45.505	ENSDNOG00000024057	NRDE2	91	45.818	Dasypus_novemcinctus
ENSPMGG00000024089	nrde2	82	46.170	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.581	Dipodomys_ordii
ENSPMGG00000024089	nrde2	69	42.532	ENSETEG00000000198	NRDE2	65	43.497	Echinops_telfairi
ENSPMGG00000024089	nrde2	92	38.462	ENSEBUG00000014552	nrde2	88	38.789	Eptatretus_burgeri
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	46.673	ENSEASG00005020675	NRDE2	91	46.972	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	47.220	ENSECAG00000003862	NRDE2	91	46.324	Equus_caballus
ENSPMGG00000024089	nrde2	56	57.143	ENSEEUG00000004026	-	60	57.143	Erinaceus_europaeus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	55.074	ENSELUG00000005973	nrde2	97	55.295	Esox_lucius
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	46.469	ENSFCAG00000011312	NRDE2	91	46.189	Felis_catus
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	47.672	ENSFALG00000012260	NRDE2	89	47.521	Ficedula_albicollis
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	46.660	ENSFDAG00000021350	NRDE2	87	47.252	Fukomys_damarensis
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.747	ENSFHEG00000021385	nrde2	97	62.833	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000024089	nrde2	69	66.421	ENSGMOG00000015815	nrde2	100	59.806	Gadus_morhua
ENSPMGG00000024089	nrde2	92	47.383	ENSGALG00000010677	NRDE2	97	46.550	Gallus_gallus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	66.923	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	68.287	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	64.706	ENSGACG00000012619	nrde2	97	64.706	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	47.736	ENSGAGG00000003252	NRDE2	97	46.905	Gopherus_agassizii
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	45.609	ENSGGOG00000008835	NRDE2	93	45.421	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	63.158	ENSHBUG00000016736	nrde2	97	63.589	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	45.914	ENSHGLG00000006731	NRDE2	88	46.442	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	45.914	ENSHGLG00100017736	NRDE2	88	46.442	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	58.086	ENSHCOG00000009559	nrde2	98	58.178	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	47.725	ENSIPUG00000016129	nrde2	92	47.672	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	47.698	ENSSTOG00000001678	NRDE2	87	47.885	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	46.004	ENSJJAG00000000907	Nrde2	87	47.399	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	63.064	ENSKMAG00000008647	nrde2	98	62.913	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	65.492	ENSLBEG00000021428	nrde2	97	65.533	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000024089	nrde2	75	48.687	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.338	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	52.651	ENSLOCG00000009037	nrde2	97	50.514	Lepisosteus_oculatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	96	44.576	ENSLAFG00000004966	NRDE2	94	45.028	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000024089	nrde2	82	46.912	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	62.745	Macaca_mulatta
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	63.203	ENSMAMG00000013452	nrde2	97	63.915	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	63.072	ENSMZEG00005008319	nrde2	97	63.503	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000024089	nrde2	88	47.059	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	47.059	Meleagris_gallopavo
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	46.602	ENSMAUG00000018578	Nrde2	87	46.929	Mesocricetus_auratus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	45.818	ENSMICG00000016741	NRDE2	91	46.409	Microcebus_murinus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	43.530	ENSMOCG00000014472	Nrde2	90	44.383	Microtus_ochrogaster
ENSPMGG00000024089	nrde2	76	63.079	ENSMMOG00000004703	nrde2	92	63.079	Mola_mola
ENSPMGG00000024089	nrde2	87	45.317	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	46.115	Monodelphis_domestica
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	65.660	ENSMALG00000021869	nrde2	95	65.669	Monopterus_albus
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	45.673	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	45.587	Mus_caroli
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	45.865	ENSMUSG00000021179	Nrde2	87	46.673	Mus_musculus
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	46.453	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	91	46.196	Mus_pahari
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	44.434	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	88	62.112	Mus_spretus
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	44.617	ENSMPUG00000008135	NRDE2	91	44.080	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	45.809	ENSMLUG00000007484	NRDE2	91	45.321	Myotis_lucifugus
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	45.311	ENSNGAG00000002993	Nrde2	91	45.730	Nannospalax_galili
ENSPMGG00000024089	nrde2	92	65.695	ENSNBRG00000010184	nrde2	97	68.237	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	44.671	ENSNLEG00000017032	NRDE2	90	45.385	Nomascus_leucogenys
ENSPMGG00000024089	nrde2	73	50.990	ENSMEUG00000011097	NRDE2	70	50.990	Notamacropus_eugenii
ENSPMGG00000024089	nrde2	61	61.538	ENSOPRG00000001375	-	61	63.725	Ochotona_princeps
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	45.906	ENSODEG00000012422	NRDE2	89	46.724	Octodon_degus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	63.117	ENSONIG00000019512	nrde2	97	63.377	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	46.542	ENSOCUG00000010083	NRDE2	91	46.814	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	65.679	ENSORLG00000017730	nrde2	96	65.974	Oryzias_latipes
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	63.521	ENSORLG00020015965	nrde2	97	62.288	Oryzias_latipes_hni
ENSPMGG00000024089	nrde2	99	62.034	ENSORLG00015012437	nrde2	96	63.555	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.649	ENSOMEG00000010890	nrde2	97	62.479	Oryzias_melastigma
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	46.024	ENSOGAG00000006624	NRDE2	91	46.415	Otolemur_garnettii
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	42.750	ENSOARG00000003475	NRDE2	93	43.855	Ovis_aries
ENSPMGG00000024089	nrde2	97	44.986	ENSPPAG00000034133	NRDE2	98	47.385	Pan_paniscus
ENSPMGG00000024089	nrde2	92	46.899	ENSPPRG00000006422	NRDE2	91	46.281	Panthera_pardus
ENSPMGG00000024089	nrde2	92	46.899	ENSPTIG00000009989	NRDE2	91	46.281	Panthera_tigris_altaica
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	45.987	ENSPTRG00000023399	NRDE2	93	45.788	Pan_troglodytes
ENSPMGG00000024089	nrde2	99	46.503	ENSPKIG00000009331	nrde2	97	47.208	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	47.736	ENSPSIG00000005588	NRDE2	90	47.895	Pelodiscus_sinensis
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	46.550	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.070	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	46.635	ENSPCIG00000018567	NRDE2	94	47.188	Phascolarctos_cinereus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	60.377	ENSPFOG00000013217	nrde2	97	60.463	Poecilia_formosa
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.234	ENSPLAG00000022350	nrde2	97	62.319	Poecilia_latipinna
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.148	ENSPMEG00000000778	nrde2	97	62.234	Poecilia_mexicana
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.116	ENSPREG00000009066	nrde2	97	62.201	Poecilia_reticulata
ENSPMGG00000024089	nrde2	87	45.260	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	45.400	Pongo_abelii
ENSPMGG00000024089	nrde2	71	67.692	ENSPCAG00000016399	NRDE2	73	67.692	Procavia_capensis
ENSPMGG00000024089	nrde2	89	44.966	ENSPCOG00000024684	NRDE2	91	44.848	Propithecus_coquereli
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	42.911	ENSPVAG00000010023	NRDE2	91	42.871	Pteropus_vampyrus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	64.129	ENSPNYG00000022833	nrde2	95	68.969	Pundamilia_nyererei
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	50.933	ENSPNAG00000015807	nrde2	97	50.741	Pygocentrus_nattereri
ENSPMGG00000024089	nrde2	82	44.762	ENSRNOG00000004004	Nrde2	86	45.134	Rattus_norvegicus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	46.054	ENSSBOG00000024346	NRDE2	92	46.478	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	45.753	ENSSHAG00000016736	NRDE2	85	46.411	Sarcophilus_harrisii
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	50.368	ENSSFOG00015011794	nrde2	92	50.138	Scleropages_formosus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.745	ENSSMAG00000011671	nrde2	97	63.171	Scophthalmus_maximus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	65.025	ENSSDUG00000017948	nrde2	97	65.195	Seriola_dumerili
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	66.413	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	68.587	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	47.230	ENSSPUG00000006348	NRDE2	99	47.695	Sphenodon_punctatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	93	66.571	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	67.550	Stegastes_partitus
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	46.477	ENSSSCG00000002434	NRDE2	91	46.324	Sus_scrofa
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	47.944	ENSTGUG00000012462	-	91	47.970	Taeniopygia_guttata
ENSPMGG00000024089	nrde2	82	63.399	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	63.399	Takifugu_rubripes
ENSPMGG00000024089	nrde2	89	46.004	ENSTBEG00000011834	NRDE2	86	46.638	Tupaia_belangeri
ENSPMGG00000024089	nrde2	90	44.942	ENSTTRG00000013583	NRDE2	91	44.384	Tursiops_truncatus
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	45.215	ENSUAMG00000004159	NRDE2	95	44.630	Ursus_americanus
ENSPMGG00000024089	nrde2	91	45.010	ENSUMAG00000006393	NRDE2	94	44.220	Ursus_maritimus
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	44.712	ENSVVUG00000018202	NRDE2	87	45.793	Vulpes_vulpes
ENSPMGG00000024089	nrde2	95	44.793	ENSXETG00000015708	nrde2	93	44.995	Xenopus_tropicalis
ENSPMGG00000024089	nrde2	94	65.577	ENSXCOG00000013298	nrde2	97	65.673	Xiphophorus_couchianus
ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.969	ENSXMAG00000009320	nrde2	98	63.055	Xiphophorus_maculatus