EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPMGG00000024099 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: -
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Periophthalmus_magnuspinnatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9496 bases
Position: chrKN460915.1:3528-13023
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPMGP00000029957	PAZ	PF02170.22	5.5e-29	1	1
ENSPMGP00000029957	Piwi	PF02171.17	1.2e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPMGT00000031886	-	2094	-	ENSPMGP00000029957	697 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSG00000092847	AGO1	88	97.384	Homo_sapiens
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSAPOG00000024299	ago1	96	98.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSAMEG00000000504	AGO1	80	97.384	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPMGG00000024099	ago1	99	94.485	ENSACIG00000005298	ago1	96	94.485	Amphilophus_citrinellus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSAOCG00000017727	ago1	80	98.547	Amphiprion_ocellaris
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSAPEG00000004458	ago1	81	98.547	Amphiprion_percula
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSATEG00000008523	ago1	80	98.547	Anabas_testudineus
ENSPMGG00000024099	ago1	96	90.262	ENSAPLG00000010440	AGO1	79	90.262	Anas_platyrhynchos
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSACAG00000029174	AGO1	88	97.384	Anolis_carolinensis
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSANAG00000037711	AGO1	80	97.384	Aotus_nancymaae
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.401	ENSACLG00000000890	ago1	87	93.003	Astatotilapia_calliptera
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.688	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.688	Astyanax_mexicanus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSBTAG00000012253	AGO1	80	97.384	Bos_taurus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCJAG00000032023	AGO1	80	97.384	Callithrix_jacchus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCAFG00000003443	AGO1	80	97.384	Canis_familiaris
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCAFG00020009251	AGO1	83	96.952	Canis_lupus_dingo
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.668	ENSCHIG00000011848	-	81	96.392	Capra_hircus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	77.405	ENSTSYG00000032426	-	96	77.405	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSTSYG00000009767	-	81	97.384	Carlito_syrichta
ENSPMGG00000024099	ago1	87	91.718	ENSCAPG00000010228	AGO1	86	91.042	Cavia_aperea
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCPOG00000011568	AGO1	80	97.384	Cavia_porcellus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCCAG00000011823	AGO1	80	97.384	Cebus_capucinus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCATG00000031521	AGO1	88	97.384	Cercocebus_atys
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCLAG00000011507	AGO1	81	97.384	Chinchilla_lanigera
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCSAG00000001091	AGO1	80	97.384	Chlorocebus_sabaeus
ENSPMGG00000024099	ago1	82	90.698	ENSCHOG00000011591	AGO1	67	90.698	Choloepus_hoffmanni
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCPBG00000018594	AGO1	80	97.384	Chrysemys_picta_bellii
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCANG00000039798	AGO1	80	97.384	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCGRG00001022708	Ago1	80	97.384	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSCGRG00000010386	Ago1	81	97.384	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPMGG00000024099	ago1	98	96.302	ENSCSEG00000001051	ago1	81	96.302	Cynoglossus_semilaevis
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSCVAG00000018173	ago1	80	98.547	Cyprinodon_variegatus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.256	ENSDARG00000092644	ago1	80	98.256	Danio_rerio
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSDNOG00000008077	AGO1	88	97.384	Dasypus_novemcinctus
ENSPMGG00000024099	ago1	90	98.228	ENSDORG00000008494	Ago1	80	98.228	Dipodomys_ordii
ENSPMGG00000024099	ago1	79	90.381	ENSETEG00000007626	AGO1	77	90.381	Echinops_telfairi
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSEASG00005012086	AGO1	80	97.384	Equus_asinus_asinus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSECAG00000024353	AGO1	80	97.384	Equus_caballus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	88.047	ENSEEUG00000005349	AGO1	80	88.047	Erinaceus_europaeus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSELUG00000016803	ago1	88	98.547	Esox_lucius
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSFCAG00000000746	AGO1	80	97.384	Felis_catus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	93.478	ENSFALG00000000790	AGO1	88	93.478	Ficedula_albicollis
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSFDAG00000017210	AGO1	80	97.384	Fukomys_damarensis
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSFHEG00000017927	ago1	83	98.547	Fundulus_heteroclitus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	84.716	ENSGMOG00000019413	ago1	92	84.716	Gadus_morhua
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSGALG00000002249	AGO1	80	97.384	Gallus_gallus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSGAFG00000009775	ago1	80	98.547	Gambusia_affinis
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.403	ENSGACG00000012443	ago1	92	98.403	Gasterosteus_aculeatus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSGAGG00000012893	-	88	97.384	Gopherus_agassizii
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSGGOG00000003316	AGO1	80	97.384	Gorilla_gorilla
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.401	ENSHBUG00000010459	ago1	87	93.003	Haplochromis_burtoni
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.668	ENSHGLG00000011540	AGO1	80	97.668	Heterocephalus_glaber_female
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.668	ENSHGLG00100005568	AGO1	80	97.668	Heterocephalus_glaber_male
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSHCOG00000005708	ago1	81	98.547	Hippocampus_comes
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.256	ENSIPUG00000023216	ago1	88	94.737	Ictalurus_punctatus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.668	ENSSTOG00000010857	AGO1	80	97.384	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSJJAG00000019449	Ago1	80	97.384	Jaculus_jaculus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSKMAG00000019464	ago1	80	98.547	Kryptolebias_marmoratus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSLBEG00000007694	ago1	100	94.310	Labrus_bergylta
ENSPMGG00000024099	ago1	98	90.435	ENSLACG00000017009	AGO1	81	90.435	Latimeria_chalumnae
ENSPMGG00000024099	ago1	98	94.331	ENSLOCG00000000504	AGO1	80	94.331	Lepisosteus_oculatus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSLAFG00000010835	AGO1	81	97.384	Loxodonta_africana
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMFAG00000002846	AGO1	80	97.384	Macaca_fascicularis
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ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMNEG00000028881	AGO1	88	97.384	Macaca_nemestrina
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMLEG00000038388	AGO1	80	97.384	Mandrillus_leucophaeus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSMAMG00000008381	ago1	99	95.627	Mastacembelus_armatus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.401	ENSMZEG00005007996	ago1	87	93.003	Maylandia_zebra
ENSPMGG00000024099	ago1	99	91.026	ENSMGAG00000003822	AGO1	81	91.026	Meleagris_gallopavo
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMAUG00000015189	Ago1	80	97.384	Mesocricetus_auratus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMICG00000016147	AGO1	80	97.384	Microcebus_murinus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMOCG00000000537	Ago1	80	97.384	Microtus_ochrogaster
ENSPMGG00000024099	ago1	97	97.664	ENSMMOG00000018459	ago1	95	97.664	Mola_mola
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.238	ENSMODG00000023335	AGO1	80	97.238	Monodelphis_domestica
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.401	ENSMALG00000011057	ago1	82	98.401	Monopterus_albus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	96.745	Mus_caroli
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	96.745	Mus_musculus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	96.745	Mus_pahari
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	96.745	Mus_spretus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSMPUG00000014872	AGO1	96	97.384	Mustela_putorius_furo
ENSPMGG00000024099	ago1	52	98.329	ENSMLUG00000009628	AGO1	69	98.329	Myotis_lucifugus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSNGAG00000017448	Ago1	81	97.384	Nannospalax_galili
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.688	ENSNBRG00000010867	ago1	88	98.688	Neolamprologus_brichardi
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSNLEG00000011181	AGO1	80	97.384	Nomascus_leucogenys
ENSPMGG00000024099	ago1	89	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	79	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSPMGG00000024099	ago1	89	98.299	ENSOPRG00000012325	AGO1	73	98.299	Ochotona_princeps
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSODEG00000005321	AGO1	80	97.384	Octodon_degus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.401	ENSONIG00000016345	ago1	81	98.401	Oreochromis_niloticus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	87.954	ENSOANG00000002080	AGO1	80	87.954	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.238	ENSOCUG00000023116	AGO1	80	97.238	Oryctolagus_cuniculus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSORLG00000014965	ago1	80	98.547	Oryzias_latipes
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSORLG00020018253	ago1	80	98.547	Oryzias_latipes_hni
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSORLG00015003287	ago1	80	98.547	Oryzias_latipes_hsok
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSOMEG00000020528	ago1	80	98.547	Oryzias_melastigma
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSOGAG00000010279	AGO1	80	97.384	Otolemur_garnettii
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSOARG00000019591	AGO1	80	97.384	Ovis_aries
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSPPAG00000034838	AGO1	80	97.384	Pan_paniscus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSPPRG00000006475	AGO1	80	97.384	Panthera_pardus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.093	ENSPTIG00000020991	AGO1	80	97.093	Panthera_tigris_altaica
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSPTRG00000000528	AGO1	80	97.384	Pan_troglodytes
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSPANG00000009060	AGO1	80	97.384	Papio_anubis
ENSPMGG00000024099	ago1	98	96.377	ENSPSIG00000017482	AGO1	82	96.377	Pelodiscus_sinensis
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSPEMG00000023313	Ago1	80	97.384	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.238	ENSPCIG00000000172	AGO1	80	97.238	Phascolarctos_cinereus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	ENSPFOG00000005867	ago1	80	98.547	Poecilia_formosa
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ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	ENSPVAG00000005082	AGO1	80	97.384	Pteropus_vampyrus
ENSPMGG00000024099	ago1	98	93.003	ENSPNYG00000012586	ago1	87	93.003	Pundamilia_nyererei
ENSPMGG00000024099	ago1	93	92.945	ENSPNAG00000000597	ago1	81	92.945	Pygocentrus_nattereri
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