EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNAG00000012458 (Gene tree)
Gene ID: 108413690
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pygocentrus_nattereri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16140 bases
Position: chrKV576566.1:80321-96460
Accession: 108413690
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNAP00000027064	eRF1_2	PF03464.15	3.1e-33	1	1
ENSPNAP00000027064	eRF1_3	PF03465.15	1.6e-25	1	1
ENSPNAP00000027064	eRF1_1	PF03463.15	4e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNAT00000003547	-	6407	XM_017686330	ENSPNAP00000027064	386 (aa)	XP_017541819	UPI0008148638

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.519	ENSG00000152684	PELO	97	81.769	Homo_sapiens
ENSPNAG00000012458	pelo	64	93.117	ENSAPOG00000000616	pelo	90	93.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.688	ENSAPOG00000023072	pelo	97	92.225	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000012458	pelo	64	93.117	ENSAPOG00000023700	-	90	93.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSAMEG00000007734	PELO	97	81.501	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNAG00000012458	pelo	97	87.936	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.195	Amphilophus_citrinellus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.948	ENSAOCG00000023717	pelo	97	92.493	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.948	ENSAPEG00000011235	pelo	97	92.493	Amphiprion_percula
ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.688	ENSATEG00000019550	pelo	97	92.493	Anabas_testudineus
ENSPNAG00000012458	pelo	77	71.477	ENSAPLG00000013265	PELO	96	72.378	Anas_platyrhynchos
ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.067	ENSACAG00000004352	PELO	97	81.233	Anolis_carolinensis
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSANAG00000014096	PELO	97	81.501	Aotus_nancymaae
ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.870	ENSACLG00000010305	pelo	97	91.153	Astatotilapia_calliptera
ENSPNAG00000012458	pelo	100	96.114	ENSAMXG00000020299	pelo	100	96.114	Astyanax_mexicanus
ENSPNAG00000012458	pelo	100	80.311	ENSBTAG00000003268	PELO	97	81.501	Bos_taurus
ENSPNAG00000012458	pelo	97	60.533	WBGene00011280	pelo-1	98	60.858	Caenorhabditis_elegans
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.000	ENSCJAG00000035190	PELO	97	81.233	Callithrix_jacchus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.519	ENSCAFG00020023234	PELO	97	81.769	Canis_lupus_dingo
ENSPNAG00000012458	pelo	100	80.052	ENSCHIG00000016410	PELO	97	81.233	Capra_hircus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.779	ENSTSYG00000005203	PELO	97	82.038	Carlito_syrichta
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.779	ENSCPOG00000027406	PELO	97	82.038	Cavia_porcellus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.000	ENSCCAG00000035600	PELO	97	81.233	Cebus_capucinus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSCATG00000011829	PELO	97	81.501	Cercocebus_atys
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSCLAG00000005043	PELO	97	81.501	Chinchilla_lanigera
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSCSAG00000016692	PELO	97	81.501	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.519	ENSCHOG00000000523	PELO	97	81.769	Choloepus_hoffmanni
ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.333	ENSCPBG00000007544	PELO	97	81.501	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNAG00000012458	pelo	97	65.952	ENSCING00000001979	-	97	65.952	Ciona_intestinalis
ENSPNAG00000012458	pelo	100	66.580	ENSCSAVG00000006158	-	97	67.292	Ciona_savignyi
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSCANG00000023382	PELO	97	81.501	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNAG00000012458	pelo	97	82.038	ENSCGRG00001024665	Pelo	97	82.038	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNAG00000012458	pelo	97	82.574	ENSCGRG00000004570	Pelo	97	82.574	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.909	ENSCSEG00000008807	pelo	97	91.957	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.429	ENSCVAG00000016082	pelo	97	92.761	Cyprinodon_variegatus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	93.247	ENSDARG00000055477	pelo	97	94.370	Danio_rerio
ENSPNAG00000012458	pelo	99	77.202	ENSDNOG00000036721	PELO	97	78.342	Dasypus_novemcinctus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.818	ENSDORG00000016689	Pelo	97	83.110	Dipodomys_ordii
ENSPNAG00000012458	pelo	96	67.027	FBgn0011207	pelo	94	66.756	Drosophila_melanogaster
ENSPNAG00000012458	pelo	70	78.363	ENSEBUG00000004955	pelo	95	78.363	Eptatretus_burgeri
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.519	ENSEASG00005013348	PELO	97	81.769	Equus_asinus_asinus
ENSPNAG00000012458	pelo	100	92.746	ENSELUG00000023229	pelo	98	92.958	Esox_lucius
ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.039	ENSFCAG00000032341	PELO	97	82.306	Felis_catus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.558	ENSFALG00000004559	PELO	97	82.574	Ficedula_albicollis
ENSPNAG00000012458	pelo	74	82.042	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.042	Fukomys_damarensis
ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.130	ENSFHEG00000009769	pelo	97	91.689	Fundulus_heteroclitus
ENSPNAG00000012458	pelo	98	90.186	ENSGMOG00000005849	pelo	97	90.349	Gadus_morhua
ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.390	ENSGAFG00000019350	pelo	97	91.957	Gambusia_affinis
ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.351	ENSGACG00000007245	pelo	97	92.308	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.600	ENSGAGG00000004018	PELO	97	81.769	Gopherus_agassizii
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.870	ENSHBUG00000005866	pelo	97	91.153	Haplochromis_burtoni
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	78.442	ENSHGLG00100017627	PELO	97	79.625	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.351	ENSHCOG00000016782	pelo	97	90.349	Hippocampus_comes
ENSPNAG00000012458	pelo	99	93.247	ENSIPUG00000020627	pelo	97	94.370	Ictalurus_punctatus
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	78.442	ENSJJAG00000015032	Pelo	97	79.625	Jaculus_jaculus
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ENSPNAG00000012458	pelo	100	91.451	ENSLBEG00000022399	pelo	97	92.493	Labrus_bergylta
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.299	ENSMAUG00000009770	Pelo	97	82.574	Mesocricetus_auratus
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.779	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	97	82.038	Mus_spretus
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.558	ENSNGAG00000019331	Pelo	97	82.574	Nannospalax_galili
ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.870	ENSNBRG00000011799	pelo	97	91.153	Neolamprologus_brichardi
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	79.221	ENSMEUG00000005468	PELO	97	80.429	Notamacropus_eugenii
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.299	ENSODEG00000017579	PELO	97	82.574	Octodon_degus
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	88.571	ENSORLG00020016456	pelo	97	89.812	Oryzias_latipes_hni
ENSPNAG00000012458	pelo	99	88.571	ENSORLG00015014447	pelo	97	89.812	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.390	ENSOMEG00000021567	pelo	97	91.421	Oryzias_melastigma
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.779	ENSOGAG00000027940	PELO	97	82.038	Otolemur_garnettii
ENSPNAG00000012458	pelo	100	80.311	ENSOARG00000008324	PELO	97	81.501	Ovis_aries
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.039	ENSPTIG00000019988	PELO	97	82.306	Panthera_tigris_altaica
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ENSPNAG00000012458	pelo	100	93.264	ENSPKIG00000015190	pelo	97	94.102	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.067	ENSPSIG00000004971	PELO	97	81.233	Pelodiscus_sinensis
ENSPNAG00000012458	pelo	66	91.339	ENSPMGG00000014561	pelo	94	91.339	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.039	ENSPEMG00000015584	Pelo	97	82.306	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSPCIG00000004880	PELO	97	81.501	Phascolarctos_cinereus
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ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.501	ENSPPYG00000015451	PELO	93	81.501	Pongo_abelii
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ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.299	ENSRNOG00000061128	Pelo	97	82.574	Rattus_norvegicus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	ENSRBIG00000007299	PELO	97	81.501	Rhinopithecus_bieti
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ENSPNAG00000012458	pelo	98	32.727	YNL001W	-	97	32.804	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPNAG00000012458	pelo	99	79.740	ENSSBOG00000036140	PELO	97	80.965	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSPNAG00000012458	pelo	98	94.164	ENSSFOG00015013399	pelo	97	94.370	Scleropages_formosus
ENSPNAG00000012458	pelo	100	90.415	ENSSMAG00000017171	pelo	97	91.153	Scophthalmus_maximus
ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.130	ENSSDUG00000022938	pelo	97	91.421	Seriola_dumerili
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