EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNAG00000012490 (Gene tree)
Gene ID: 108413926
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Pygocentrus_nattereri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19700 bases
Position: chrKV575298.1:5078619-5098318
Accession: 108413926
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNAP00000006389	GTP_EFTU	PF00009.27	3.9e-45	1	1
ENSPNAP00000027010	GTP_EFTU	PF00009.27	6e-38	1	1
ENSPNAP00000006389	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7e-13	1	1
ENSPNAP00000027010	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7e-13	1	1
ENSPNAP00000027010	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-24	1	1
ENSPNAP00000006389	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNAT00000003650	-	4357	XM_017686645	ENSPNAP00000006389	971 (aa)	XP_017542134	UPI0008149052
ENSPNAT00000003708	-	2850	-	ENSPNAP00000027010	949 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPNAG00000012490's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPNAG00000012490's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNAG00000012490	eftud2	86	38.079	ENSPNAG00000012086	-	99	38.079
ENSPNAG00000012490	eftud2	57	31.852	ENSPNAG00000018467	gfm2	67	33.088
ENSPNAG00000012490	eftud2	87	37.963	ENSPNAG00000027010	eef2b	99	38.002
ENSPNAG00000012490	eftud2	87	38.014	ENSPNAG00000010655	eef2l2	99	38.014

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.057	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	95.057	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.975	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.864	ENSACIG00000009096	eftud2	100	91.864	Amphilophus_citrinellus
ENSPNAG00000012490	eftud2	88	91.059	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	91.059	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.954	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	94.954	Amphiprion_percula
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.057	ENSATEG00000000457	eftud2	100	95.057	Anabas_testudineus
ENSPNAG00000012490	eftud2	99	89.186	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.465	Anas_platyrhynchos
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.872	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.358	Anolis_carolinensis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.975	Aotus_nancymaae
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.851	ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.851	Astatotilapia_calliptera
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	97.748	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	97.748	Astyanax_mexicanus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.770	Bos_taurus
ENSPNAG00000012490	eftud2	99	70.661	WBGene00001166	eftu-2	99	70.248	Caenorhabditis_elegans
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.975	Callithrix_jacchus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.975	Canis_familiaris
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.975	Canis_lupus_dingo
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.770	Capra_hircus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	Carlito_syrichta
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.872	Cavia_aperea
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.872	Cavia_porcellus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.975	Cebus_capucinus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.975	Cercocebus_atys
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	Chinchilla_lanigera
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.975	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNAG00000012490	eftud2	91	81.419	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.419	Choloepus_hoffmanni
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.078	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.564	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	78.029	ENSCING00000009372	-	100	77.823	Ciona_intestinalis
ENSPNAG00000012490	eftud2	99	77.732	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.363	Ciona_savignyi
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.975	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.284	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.181	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.284	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	92.181	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.851	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.851	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.645	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.645	Cyprinodon_variegatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.786	ENSDARG00000012261	eftud2	100	95.786	Danio_rerio
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.284	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.770	Dasypus_novemcinctus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.872	Dipodomys_ordii
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	74.359	Drosophila_melanogaster
ENSPNAG00000012490	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSPNAG00000012490	eftud2	76	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.761	Eptatretus_burgeri
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.975	Equus_asinus_asinus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.872	Equus_caballus
ENSPNAG00000012490	eftud2	84	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.645	ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.542	Esox_lucius
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.872	Felis_catus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.078	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.461	Ficedula_albicollis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.872	Fukomys_damarensis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.439	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	94.439	Fundulus_heteroclitus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.748	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.748	Gadus_morhua
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.078	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.015	Gallus_gallus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	94.542	Gambusia_affinis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.542	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.975	Gorilla_gorilla
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.748	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.748	Haplochromis_burtoni
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.975	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	92.078	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.975	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.078	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.033	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.033	Hippocampus_comes
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	97.322	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	97.322	Ictalurus_punctatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	91	93.468	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.257	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	95	94.124	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.124	Jaculus_jaculus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	94.542	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNAG00000012490	eftud2	95	94.816	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.882	Labrus_bergylta
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.482	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.482	Latimeria_chalumnae
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.336	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.336	Lepisosteus_oculatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.770	Loxodonta_africana
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.975	Macaca_fascicularis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.975	Macaca_nemestrina
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.975	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.366	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	96.193	Mastacembelus_armatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.851	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	94.851	Maylandia_zebra
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.889	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.170	Meleagris_gallopavo
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	92.078	Mesocricetus_auratus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.975	Microcebus_murinus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSMOCG00000009039	-	100	92.078	Microtus_ochrogaster
ENSPNAG00000012490	eftud2	92	75.506	ENSMOCG00000017653	-	90	75.056	Microtus_ochrogaster
ENSPNAG00000012490	eftud2	88	96.941	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	96.941	Mola_mola
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.975	Monodelphis_domestica
ENSPNAG00000012490	eftud2	88	95.529	ENSMALG00000014501	eftud2	100	95.529	Monopterus_albus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	92.078	Mus_caroli
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.078	Mus_musculus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	Mus_pahari
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	92.078	Mus_spretus
ENSPNAG00000012490	eftud2	97	92.161	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.737	Mustela_putorius_furo
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.975	Myotis_lucifugus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.975	Nannospalax_galili
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.748	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.748	Neolamprologus_brichardi
ENSPNAG00000012490	eftud2	97	90.436	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.904	Nomascus_leucogenys
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	88.786	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.272	Notamacropus_eugenii
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	84.671	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.951	Ochotona_princeps
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.284	ENSODEG00000018041	-	100	91.667	Octodon_degus
ENSPNAG00000012490	eftud2	93	75.466	ENSODEG00000003385	-	100	75.575	Octodon_degus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.851	ENSONIG00000000912	eftud2	100	94.851	Oreochromis_niloticus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.975	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.439	ENSORLG00000003109	eftud2	100	94.439	Oryzias_latipes
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.336	ENSORLG00020009865	eftud2	100	94.336	Oryzias_latipes_hni
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.336	ENSORLG00015002611	eftud2	100	96.623	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	90.741	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.226	Otolemur_garnettii
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.770	Ovis_aries
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	92.078	Pan_paniscus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.975	Panthera_pardus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.975	Panthera_tigris_altaica
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	Pan_troglodytes
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.975	Papio_anubis
ENSPNAG00000012490	eftud2	93	90.408	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.967	Pelodiscus_sinensis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	86.200	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	86.200	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.284	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.975	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.975	Phascolarctos_cinereus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	94.542	Poecilia_formosa
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	94.542	Poecilia_latipinna
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	94.542	Poecilia_mexicana
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.152	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.638	Pongo_abelii
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	88.477	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.963	Procavia_capensis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.975	Propithecus_coquereli
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	88.066	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.449	Pteropus_vampyrus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.851	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	94.851	Pundamilia_nyererei
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.070	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.070	Rattus_norvegicus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.872	Rhinopithecus_bieti
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.872	Rhinopithecus_roxellana
ENSPNAG00000012490	eftud2	97	34.260	YKL173W	SNU114	97	33.766	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.975	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPNAG00000012490	eftud2	95	94.124	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.124	Sarcophilus_harrisii
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.675	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.366	Scleropages_formosus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.336	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	94.336	Scophthalmus_maximus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.160	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	95.160	Seriola_dumerili
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.263	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	95.263	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	84.259	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.642	Sorex_araneus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.461	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.255	Sphenodon_punctatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.954	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	94.954	Stegastes_partitus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	Sus_scrofa
ENSPNAG00000012490	eftud2	82	93.026	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.026	Taeniopygia_guttata
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.027	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	94.027	Takifugu_rubripes
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	89.231	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	89.231	Tetraodon_nigroviridis
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	87.140	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.626	Tupaia_belangeri
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	84.362	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.238	Tursiops_truncatus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.461	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.143	Ursus_americanus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.975	Ursus_maritimus
ENSPNAG00000012490	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.975	Vulpes_vulpes
ENSPNAG00000012490	eftud2	97	92.537	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.478	Xenopus_tropicalis
ENSPNAG00000012490	eftud2	81	96.556	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.556	Xiphophorus_couchianus
ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.542	Xiphophorus_maculatus