EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNAG00000015521 (Gene tree)
Gene ID: 108426781
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Pygocentrus_nattereri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10300 bases
Position: chrKV575331.1:787343-797642
Accession: 108426781
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNAP00000029376	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.4e-29	1	2
ENSPNAP00000029376	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.4e-29	2	2
ENSPNAP00000029405	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.5e-29	1	2
ENSPNAP00000029405	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.5e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNAT00000016455	-	2223	-	ENSPNAP00000029376	740 (aa)	-	-
ENSPNAT00000016443	-	3093	XM_017696504	ENSPNAP00000029405	746 (aa)	XP_017551993	UPI0008143E10

Gene Model

Click here to download ENSPNAG00000015521's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPNAG00000015521's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNAG00000015521	papolg	99	60.354	ENSPNAG00000010467	papola	99	61.330

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.510	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.752	Homo_sapiens
ENSPNAG00000015521	papolg	100	79.840	ENSAPOG00000004798	papolg	99	79.840	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000015521	papolg	99	73.755	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	73.253	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.169	ENSACIG00000010546	papolg	99	75.169	Amphilophus_citrinellus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	79.840	ENSAOCG00000010254	papolg	99	79.840	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000015521	papolg	100	79.840	ENSAPEG00000006944	papolg	99	79.840	Amphiprion_percula
ENSPNAG00000015521	papolg	100	79.573	ENSATEG00000009007	papolg	99	79.573	Anabas_testudineus
ENSPNAG00000015521	papolg	99	66.313	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.313	Anas_platyrhynchos
ENSPNAG00000015521	papolg	81	59.314	ENSACAG00000015048	-	100	59.314	Anolis_carolinensis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.861	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	72.861	Aotus_nancymaae
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.938	ENSACLG00000015592	papolg	99	77.083	Astatotilapia_calliptera
ENSPNAG00000015521	papolg	100	90.933	ENSAMXG00000004611	papolg	100	90.933	Astyanax_mexicanus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.190	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	73.190	Bos_taurus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.128	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	73.128	Callithrix_jacchus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.369	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	73.369	Canis_familiaris
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.360	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	73.360	Canis_lupus_dingo
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.190	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	73.190	Capra_hircus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.128	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	73.128	Carlito_syrichta
ENSPNAG00000015521	papolg	51	81.365	ENSCAPG00000014901	-	100	81.365	Cavia_aperea
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.396	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	73.396	Cavia_porcellus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.262	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	73.262	Cebus_capucinus
ENSPNAG00000015521	papolg	91	81.385	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	81.385	Cercocebus_atys
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.698	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	73.698	Chinchilla_lanigera
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.245	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	73.245	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNAG00000015521	papolg	89	71.684	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	71.684	Choloepus_hoffmanni
ENSPNAG00000015521	papolg	68	63.762	ENSCING00000024664	-	94	63.762	Ciona_intestinalis
ENSPNAG00000015521	papolg	65	64.536	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.536	Ciona_savignyi
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.245	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	73.245	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNAG00000015521	papolg	99	72.678	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	72.678	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNAG00000015521	papolg	99	72.678	ENSCGRG00000005552	-	100	72.678	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.300	ENSCSEG00000000771	papolg	99	75.941	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.636	ENSCVAG00000016602	papolg	90	88.889	Cyprinodon_variegatus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	85.600	ENSDARG00000012141	papolg	100	85.600	Danio_rerio
ENSPNAG00000015521	papolg	100	70.989	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	70.989	Dasypus_novemcinctus
ENSPNAG00000015521	papolg	58	86.247	ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	Dipodomys_ordii
ENSPNAG00000015521	papolg	100	58.136	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	58.377	Echinops_telfairi
ENSPNAG00000015521	papolg	59	70.408	ENSEBUG00000004020	papolg	89	70.408	Eptatretus_burgeri
ENSPNAG00000015521	papolg	63	57.325	ENSEBUG00000005042	-	79	57.849	Eptatretus_burgeri
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.930	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	73.930	Equus_asinus_asinus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.930	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	73.790	Equus_caballus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	64.589	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.589	Erinaceus_europaeus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	81.818	ENSELUG00000014497	papolg	96	82.440	Esox_lucius
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.164	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	73.164	Felis_catus
ENSPNAG00000015521	papolg	99	60.261	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	60.261	Ficedula_albicollis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.448	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	73.448	Fukomys_damarensis
ENSPNAG00000015521	papolg	66	68.462	ENSFHEG00000019080	papolg	90	69.745	Fundulus_heteroclitus
ENSPNAG00000015521	papolg	89	88.571	ENSGMOG00000018772	papolg	94	88.710	Gadus_morhua
ENSPNAG00000015521	papolg	100	64.597	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	64.597	Gallus_gallus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.033	ENSGAFG00000003263	papolg	99	75.033	Gambusia_affinis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.381	ENSGACG00000002718	papolg	100	78.100	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.396	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	73.396	Gorilla_gorilla
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.938	ENSHBUG00000004882	papolg	99	77.573	Haplochromis_burtoni
ENSPNAG00000015521	papolg	99	73.557	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	72.995	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.369	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	73.369	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.807	ENSHCOG00000006782	papolg	99	77.807	Hippocampus_comes
ENSPNAG00000015521	papolg	100	90.267	ENSIPUG00000021642	papolg	100	90.541	Ictalurus_punctatus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.396	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	73.396	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNAG00000015521	papolg	58	86.480	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	86.480	Jaculus_jaculus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.837	ENSKMAG00000016439	papolg	99	77.837	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	74.177	ENSLBEG00000023218	papolg	99	75.349	Labrus_bergylta
ENSPNAG00000015521	papolg	99	67.729	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	67.643	Latimeria_chalumnae
ENSPNAG00000015521	papolg	100	80.366	ENSLOCG00000016130	papolg	100	80.366	Lepisosteus_oculatus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.630	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.548	Loxodonta_africana
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.360	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	73.510	Macaca_fascicularis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.360	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	73.510	Macaca_mulatta
ENSPNAG00000015521	papolg	100	66.008	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	66.184	Macaca_nemestrina
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.226	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	73.226	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	79.439	ENSMAMG00000010667	papolg	99	79.973	Mastacembelus_armatus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.938	ENSMZEG00005018140	papolg	99	77.083	Maylandia_zebra
ENSPNAG00000015521	papolg	100	63.963	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	63.963	Meleagris_gallopavo
ENSPNAG00000015521	papolg	99	73.154	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	73.154	Mesocricetus_auratus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.494	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	73.494	Microcebus_murinus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.190	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	73.190	Microtus_ochrogaster
ENSPNAG00000015521	papolg	100	78.695	ENSMMOG00000008020	papolg	99	78.695	Mola_mola
ENSPNAG00000015521	papolg	98	73.082	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	73.082	Monodelphis_domestica
ENSPNAG00000015521	papolg	100	78.371	ENSMALG00000007012	papolg	99	78.371	Monopterus_albus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.959	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	87.294	Mus_caroli
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.959	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.294	Mus_musculus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.557	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.788	Mus_pahari
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.825	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.294	Mus_spretus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.360	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	73.360	Mustela_putorius_furo
ENSPNAG00000015521	papolg	99	72.800	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	72.400	Myotis_lucifugus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.825	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	72.825	Nannospalax_galili
ENSPNAG00000015521	papolg	99	68.116	ENSNBRG00000011943	papolg	99	68.568	Neolamprologus_brichardi
ENSPNAG00000015521	papolg	58	86.014	ENSNLEG00000009507	-	100	86.014	Nomascus_leucogenys
ENSPNAG00000015521	papolg	79	69.863	ENSMEUG00000013605	-	86	68.243	Notamacropus_eugenii
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.861	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	72.861	Ochotona_princeps
ENSPNAG00000015521	papolg	58	82.864	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	82.864	Octodon_degus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	71.220	ENSONIG00000002985	papolg	100	71.696	Oreochromis_niloticus
ENSPNAG00000015521	papolg	99	73.901	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	73.901	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.128	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	73.128	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.748	ENSORLG00000001577	papolg	99	78.146	Oryzias_latipes
ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.719	ENSORLG00020002482	papolg	99	78.117	Oryzias_latipes_hni
ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.483	ENSORLG00015008836	papolg	99	77.881	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNAG00000015521	papolg	100	78.013	ENSOMEG00000001406	papolg	99	77.734	Oryzias_melastigma
ENSPNAG00000015521	papolg	58	64.384	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	64.384	Otolemur_garnettii
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.056	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	73.056	Ovis_aries
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.510	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	73.510	Pan_paniscus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.164	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	73.164	Panthera_pardus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.031	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	73.031	Panthera_tigris_altaica
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.510	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	73.510	Pan_troglodytes
ENSPNAG00000015521	papolg	100	69.974	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	69.974	Papio_anubis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	78.457	ENSPKIG00000003313	papolg	100	78.457	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000015521	papolg	93	78.429	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	78.429	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000015521	papolg	99	71.102	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	71.102	Pelodiscus_sinensis
ENSPNAG00000015521	papolg	99	73.423	ENSPEMG00000008960	-	100	73.423	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNAG00000015521	papolg	98	52.174	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.825	Petromyzon_marinus
ENSPNAG00000015521	papolg	67	63.783	ENSPMAG00000004864	-	98	63.783	Petromyzon_marinus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.955	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	72.955	Phascolarctos_cinereus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.098	ENSPFOG00000012909	papolg	99	75.491	Poecilia_formosa
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.462	ENSPLAG00000018445	papolg	99	75.858	Poecilia_latipinna
ENSPNAG00000015521	papolg	100	74.837	ENSPMEG00000003961	papolg	99	75.785	Poecilia_mexicana
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.602	ENSPREG00000010358	papolg	99	74.674	Poecilia_reticulata
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.245	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	73.396	Pongo_abelii
ENSPNAG00000015521	papolg	99	65.811	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	65.811	Procavia_capensis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	66.176	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	66.176	Propithecus_coquereli
ENSPNAG00000015521	papolg	87	81.387	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.685	Pteropus_vampyrus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	76.113	ENSPNYG00000006729	papolg	99	77.083	Pundamilia_nyererei
ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.884	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	72.884	Rattus_norvegicus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	68.541	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	68.700	Rhinopithecus_bieti
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.360	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	73.529	Rhinopithecus_roxellana
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.245	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.262	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPNAG00000015521	papolg	94	73.174	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	73.174	Sarcophilus_harrisii
ENSPNAG00000015521	papolg	100	76.658	ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.658	Scleropages_formosus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	66.711	ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.711	Scleropages_formosus
ENSPNAG00000015521	papolg	88	88.014	ENSSMAG00000015598	papolg	98	75.226	Scophthalmus_maximus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	78.877	ENSSDUG00000000912	papolg	99	78.877	Seriola_dumerili
ENSPNAG00000015521	papolg	100	79.011	ENSSLDG00000001217	papolg	99	79.011	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPNAG00000015521	papolg	100	70.628	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	70.628	Sphenodon_punctatus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.373	ENSSPAG00000009004	papolg	99	77.633	Stegastes_partitus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.565	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	73.565	Sus_scrofa
ENSPNAG00000015521	papolg	72	71.617	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	71.617	Taeniopygia_guttata
ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.904	ENSTRUG00000006410	papolg	99	75.904	Takifugu_rubripes
ENSPNAG00000015521	papolg	100	71.751	ENSTNIG00000017106	papolg	100	71.751	Tetraodon_nigroviridis
ENSPNAG00000015521	papolg	99	66.847	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	66.847	Tupaia_belangeri
ENSPNAG00000015521	papolg	100	69.559	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	69.559	Tursiops_truncatus
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.592	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.720	Ursus_americanus
ENSPNAG00000015521	papolg	99	73.720	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	73.720	Ursus_maritimus
ENSPNAG00000015521	papolg	99	71.102	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	71.102	Vicugna_pacos
ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.635	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	73.635	Vulpes_vulpes
ENSPNAG00000015521	papolg	100	69.622	ENSXETG00000002208	papolg	100	69.622	Xenopus_tropicalis
ENSPNAG00000015521	papolg	67	89.980	ENSXCOG00000006611	papolg	73	89.980	Xiphophorus_couchianus
ENSPNAG00000015521	papolg	73	87.400	ENSXMAG00000007383	papolg	94	87.400	Xiphophorus_maculatus