EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNAG00000015570 (Gene tree)
Gene ID: 108426156
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pygocentrus_nattereri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12739 bases
Position: chrKV575324.1:3627147-3639885
Accession: 108426156
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNAP00000029464	SYF2	PF08231.12	1.5e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNAT00000016607	-	1264	XM_017695461	ENSPNAP00000029464	238 (aa)	XP_017550950	UPI0008148F18

Gene Model

Click here to download ENSPNAG00000015570's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPNAG00000015570's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSG00000117614	SYF2	100	79.424	Homo_sapiens
ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	ENSAPOG00000001174	syf2	100	86.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	80.169	ENSAMEG00000010115	-	98	80.169	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNAG00000015570	syf2	82	84.615	ENSAMEG00000010134	-	100	84.615	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNAG00000015570	syf2	95	86.222	ENSACIG00000023688	syf2	90	86.222	Amphilophus_citrinellus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	ENSAOCG00000022046	syf2	99	87.179	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000015570	syf2	93	85.973	ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.973	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.975	Amphiprion_percula
ENSPNAG00000015570	syf2	91	89.401	ENSATEG00000007745	syf2	100	85.714	Anabas_testudineus
ENSPNAG00000015570	syf2	84	84.422	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.000	Anas_platyrhynchos
ENSPNAG00000015570	syf2	86	81.863	ENSACAG00000013653	-	100	81.863	Anolis_carolinensis
ENSPNAG00000015570	syf2	70	70.060	ENSACAG00000026777	-	100	70.060	Anolis_carolinensis
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.424	ENSANAG00000032473	SYF2	100	79.835	Aotus_nancymaae
ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.454	ENSACLG00000019916	syf2	100	84.454	Astatotilapia_calliptera
ENSPNAG00000015570	syf2	100	94.118	ENSAMXG00000004051	syf2	100	94.118	Astyanax_mexicanus
ENSPNAG00000015570	syf2	99	81.013	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	81.013	Bos_taurus
ENSPNAG00000015570	syf2	87	51.429	WBGene00019402	syf-2	97	48.246	Caenorhabditis_elegans
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.424	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	79.835	Callithrix_jacchus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	75.652	ENSCAFG00000030331	-	96	75.652	Canis_familiaris
ENSPNAG00000015570	syf2	97	79.747	ENSCAFG00000012895	-	96	80.252	Canis_familiaris
ENSPNAG00000015570	syf2	97	79.747	ENSCAFG00020021091	-	96	80.252	Canis_lupus_dingo
ENSPNAG00000015570	syf2	76	76.374	ENSCAFG00020021094	-	95	76.374	Canis_lupus_dingo
ENSPNAG00000015570	syf2	99	80.591	ENSCHIG00000020874	SYF2	97	80.591	Capra_hircus
ENSPNAG00000015570	syf2	99	79.583	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	79.583	Carlito_syrichta
ENSPNAG00000015570	syf2	83	84.848	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.848	Cavia_aperea
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.689	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	78.689	Cavia_porcellus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.424	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	80.247	Cebus_capucinus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSCATG00000026917	SYF2	100	79.012	Cercocebus_atys
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	80.738	Chinchilla_lanigera
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.601	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	78.601	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNAG00000015570	syf2	74	64.088	ENSCHOG00000005273	-	100	64.088	Choloepus_hoffmanni
ENSPNAG00000015570	syf2	93	85.135	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	81.857	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNAG00000015570	syf2	93	52.466	ENSCING00000003017	-	93	52.915	Ciona_intestinalis
ENSPNAG00000015570	syf2	89	50.000	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.000	Ciona_savignyi
ENSPNAG00000015570	syf2	100	69.959	ENSCANG00000037322	SYF2	100	69.959	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.579	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	80.579	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNAG00000015570	syf2	82	85.714	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.427	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNAG00000015570	syf2	92	84.404	ENSCSEG00000000117	syf2	97	81.385	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNAG00000015570	syf2	94	86.099	ENSCVAG00000019543	syf2	100	82.427	Cyprinodon_variegatus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	88.655	ENSDARG00000004706	syf2	100	88.655	Danio_rerio
ENSPNAG00000015570	syf2	97	81.356	ENSDNOG00000047605	SYF2	96	81.356	Dasypus_novemcinctus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.689	ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.689	Dipodomys_ordii
ENSPNAG00000015570	syf2	92	57.014	FBgn0033556	CG12343	98	57.014	Drosophila_melanogaster
ENSPNAG00000015570	syf2	87	70.192	ENSETEG00000015729	SYF2	100	67.249	Echinops_telfairi
ENSPNAG00000015570	syf2	83	58.883	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSPNAG00000015570	syf2	96	74.236	ENSEASG00005004232	-	93	74.236	Equus_asinus_asinus
ENSPNAG00000015570	syf2	99	80.591	ENSEASG00005004224	-	95	80.591	Equus_asinus_asinus
ENSPNAG00000015570	syf2	99	81.435	ENSECAG00000012023	-	96	81.435	Equus_caballus
ENSPNAG00000015570	syf2	99	80.591	ENSECAG00000010440	-	98	80.591	Equus_caballus
ENSPNAG00000015570	syf2	74	69.318	ENSEEUG00000015084	SYF2	95	69.318	Erinaceus_europaeus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	88.235	ENSELUG00000003465	syf2	99	88.235	Esox_lucius
ENSPNAG00000015570	syf2	97	80.591	ENSFCAG00000043095	-	96	80.591	Felis_catus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.000	ENSFCAG00000010324	-	85	80.000	Felis_catus
ENSPNAG00000015570	syf2	86	81.863	ENSFALG00000000460	SYF2	91	80.000	Ficedula_albicollis
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.247	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	80.247	Fukomys_damarensis
ENSPNAG00000015570	syf2	95	71.681	ENSFHEG00000007238	syf2	100	71.681	Fundulus_heteroclitus
ENSPNAG00000015570	syf2	92	89.041	ENSGMOG00000019138	syf2	98	89.041	Gadus_morhua
ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.234	ENSGALG00000013639	SYF2	88	84.234	Gallus_gallus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.513	ENSGAFG00000019435	syf2	100	81.513	Gambusia_affinis
ENSPNAG00000015570	syf2	93	86.937	ENSGACG00000007305	syf2	100	83.264	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNAG00000015570	syf2	93	85.135	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	82.278	Gopherus_agassizii
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	79.424	Gorilla_gorilla
ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.034	ENSHBUG00000020477	syf2	97	87.111	Haplochromis_burtoni
ENSPNAG00000015570	syf2	93	74.324	ENSHGLG00000004304	-	100	71.429	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.738	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.738	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNAG00000015570	syf2	100	83.613	ENSHCOG00000012904	syf2	78	83.613	Hippocampus_comes
ENSPNAG00000015570	syf2	100	89.121	ENSIPUG00000019859	syf2	100	89.121	Ictalurus_punctatus
ENSPNAG00000015570	syf2	61	80.137	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPNAG00000015570	syf2	84	85.427	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.427	Jaculus_jaculus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.353	ENSKMAG00000013856	syf2	100	82.353	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNAG00000015570	syf2	91	90.323	ENSLBEG00000014425	syf2	100	85.714	Labrus_bergylta
ENSPNAG00000015570	syf2	97	79.310	ENSLACG00000012064	SYF2	97	79.310	Latimeria_chalumnae
ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.874	ENSLOCG00000002728	syf2	95	84.874	Lepisosteus_oculatus
ENSPNAG00000015570	syf2	77	58.824	ENSLAFG00000030814	-	100	58.824	Loxodonta_africana
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.776	ENSLAFG00000023150	-	100	78.776	Loxodonta_africana
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	79.012	Macaca_fascicularis
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.601	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	79.012	Macaca_mulatta
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	79.012	Macaca_nemestrina
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	79.012	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.034	ENSMAMG00000010403	syf2	98	84.034	Mastacembelus_armatus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.454	ENSMZEG00005006429	syf2	100	84.454	Maylandia_zebra
ENSPNAG00000015570	syf2	84	84.422	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.422	Meleagris_gallopavo
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.818	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	81.818	Mesocricetus_auratus
ENSPNAG00000015570	syf2	84	85.427	ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	Microcebus_murinus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.231	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	82.231	Microtus_ochrogaster
ENSPNAG00000015570	syf2	95	84.889	ENSMMOG00000002396	syf2	94	84.889	Mola_mola
ENSPNAG00000015570	syf2	93	80.804	ENSMODG00000013951	-	98	80.804	Monodelphis_domestica
ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.158	ENSMALG00000010706	syf2	100	82.573	Monopterus_albus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.818	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	81.818	Mus_caroli
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.818	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	81.818	Mus_musculus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.818	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	81.818	Mus_pahari
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.818	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	81.818	Mus_spretus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	79.747	ENSMPUG00000015802	-	96	79.747	Mustela_putorius_furo
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.455	ENSMPUG00000015801	-	100	78.455	Mustela_putorius_furo
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.992	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.992	Myotis_lucifugus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.455	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	Nannospalax_galili
ENSPNAG00000015570	syf2	100	75.620	ENSNBRG00000010720	syf2	99	75.620	Neolamprologus_brichardi
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	79.424	Nomascus_leucogenys
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.012	Ochotona_princeps
ENSPNAG00000015570	syf2	95	82.301	ENSODEG00000017664	-	95	82.301	Octodon_degus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	71.311	ENSODEG00000014338	-	100	72.269	Octodon_degus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.454	ENSONIG00000008213	syf2	100	84.454	Oreochromis_niloticus
ENSPNAG00000015570	syf2	85	84.158	ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.158	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	81.148	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNAG00000015570	syf2	98	81.116	ENSORLG00000028820	syf2	100	81.116	Oryzias_latipes
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.092	ENSORLG00020018333	syf2	100	81.092	Oryzias_latipes_hni
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.513	ENSORLG00015014665	syf2	100	81.513	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNAG00000015570	syf2	100	83.193	ENSOMEG00000013911	syf2	100	83.193	Oryzias_melastigma
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.328	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	80.328	Otolemur_garnettii
ENSPNAG00000015570	syf2	99	79.916	ENSOARG00000006348	-	96	79.916	Ovis_aries
ENSPNAG00000015570	syf2	82	58.462	ENSOARG00000006269	-	100	57.949	Ovis_aries
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	79.424	Pan_paniscus
ENSPNAG00000015570	syf2	99	79.508	ENSPPRG00000001638	-	99	79.508	Panthera_pardus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	80.591	ENSPPRG00000001651	-	96	80.591	Panthera_pardus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	80.591	ENSPTIG00000007036	-	96	80.591	Panthera_tigris_altaica
ENSPNAG00000015570	syf2	91	85.648	ENSPTIG00000005711	-	81	84.234	Panthera_tigris_altaica
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	79.424	Pan_troglodytes
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSPANG00000008139	SYF2	100	79.012	Papio_anubis
ENSPNAG00000015570	syf2	100	85.062	ENSPKIG00000008130	syf2	100	85.062	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000015570	syf2	96	81.624	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	81.624	Pelodiscus_sinensis
ENSPNAG00000015570	syf2	98	84.979	ENSPMGG00000008755	syf2	91	84.979	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.405	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	81.405	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.685	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	78.400	Phascolarctos_cinereus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	83.478	ENSPFOG00000004116	syf2	95	83.478	Poecilia_formosa
ENSPNAG00000015570	syf2	97	83.043	ENSPLAG00000006691	syf2	99	83.043	Poecilia_latipinna
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.412	ENSPMEG00000011684	syf2	99	80.519	Poecilia_mexicana
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.513	ENSPREG00000003009	syf2	100	81.513	Poecilia_reticulata
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.424	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	79.424	Pongo_abelii
ENSPNAG00000015570	syf2	100	57.613	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	57.613	Propithecus_coquereli
ENSPNAG00000015570	syf2	93	74.775	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	74.775	Pteropus_vampyrus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.454	ENSPNYG00000004979	syf2	100	84.454	Pundamilia_nyererei
ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.818	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	81.818	Rattus_norvegicus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	76.955	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	76.955	Rhinopithecus_bieti
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	ENSRROG00000001347	SYF2	100	79.012	Rhinopithecus_roxellana
ENSPNAG00000015570	syf2	91	85.185	ENSSBOG00000020184	SYF2	95	81.818	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPNAG00000015570	syf2	86	84.951	ENSSHAG00000007152	-	100	84.951	Sarcophilus_harrisii
ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.234	ENSSHAG00000015630	-	100	76.587	Sarcophilus_harrisii
ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	ENSSFOG00015023647	syf2	100	86.975	Scleropages_formosus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.672	ENSSMAG00000009867	syf2	100	80.672	Scophthalmus_maximus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	85.294	ENSSDUG00000013072	syf2	100	85.294	Seriola_dumerili
ENSPNAG00000015570	syf2	100	85.294	ENSSLDG00000012677	syf2	100	85.294	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPNAG00000015570	syf2	100	63.525	ENSSARG00000012889	SYF2	100	63.525	Sorex_araneus
ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.234	ENSSPUG00000005251	SYF2	88	84.234	Sphenodon_punctatus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	83.613	ENSSPAG00000009626	syf2	100	83.613	Stegastes_partitus
ENSPNAG00000015570	syf2	99	80.169	ENSSSCG00000037481	SYF2	96	80.169	Sus_scrofa
ENSPNAG00000015570	syf2	71	57.059	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	58.537	Taeniopygia_guttata
ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.417	ENSTRUG00000001499	syf2	91	83.260	Takifugu_rubripes
ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.234	ENSTNIG00000016912	syf2	99	84.234	Tetraodon_nigroviridis
ENSPNAG00000015570	syf2	100	60.082	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.671	Tupaia_belangeri
ENSPNAG00000015570	syf2	100	77.869	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	78.689	Tursiops_truncatus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	80.169	ENSUAMG00000002897	SYF2	96	80.169	Ursus_americanus
ENSPNAG00000015570	syf2	97	79.747	ENSUMAG00000013108	SYF2	96	79.747	Ursus_maritimus
ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.098	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	79.098	Vicugna_pacos
ENSPNAG00000015570	syf2	100	77.016	ENSVVUG00000027181	-	100	77.510	Vulpes_vulpes
ENSPNAG00000015570	syf2	97	79.747	ENSVVUG00000027175	-	96	80.252	Vulpes_vulpes
ENSPNAG00000015570	syf2	97	74.694	ENSXETG00000022797	syf2	98	74.694	Xenopus_tropicalis
ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.353	ENSXMAG00000022698	syf2	100	82.353	Xiphophorus_maculatus