EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNAG00000021352 (Gene tree)
Gene ID: 108431725
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC108431725
Gene Type: protein_coding
Species: Pygocentrus_nattereri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21578 bases
Position: chrKV575392.1:1670145-1691722
Accession: 108431725
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNAP00000032992	MMR_HSR1	PF01926.23	3.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNAT00000023452	-	1513	XM_017705070	ENSPNAP00000032992	449 (aa)	XP_017560559	UPI0008148101

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	60.310

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	81.960	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	81.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Amphilophus_citrinellus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Amphilophus_citrinellus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	82.628	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	82.628	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Amphiprion_percula
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	82.405	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	82.405	Amphiprion_percula
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	82.405	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	82.405	Anabas_testudineus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Anabas_testudineus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.499	ENSACAG00000028632	-	99	58.940	Anolis_carolinensis
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Astatotilapia_calliptera
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Astatotilapia_calliptera
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	90.646	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	90.646	Astyanax_mexicanus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.823	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.823	Astyanax_mexicanus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	81	59.401	ENSCING00000020807	-	97	59.401	Ciona_intestinalis
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	55.580	ENSCSAVG00000009987	-	99	55.804	Ciona_savignyi
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	79.596	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	94	79.951	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Cyprinodon_variegatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.624	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	80.624	Cyprinodon_variegatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.469	Danio_rerio
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	98	84.545	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.545	Danio_rerio
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	81	55.372	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	55.372	Eptatretus_burgeri
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.178	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	80.178	Esox_lucius
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	79.733	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	79.733	Fundulus_heteroclitus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Fundulus_heteroclitus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	89	55.112	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.112	Gadus_morhua
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Gambusia_affinis
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.624	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	80.624	Gambusia_affinis
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	82	66.486	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	62.035	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	58	91.120	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	91.120	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Haplochromis_burtoni
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Haplochromis_burtoni
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	60.398	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	60.398	Hippocampus_comes
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	77.477	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	77.477	Hippocampus_comes
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	85	57.592	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	84	57.592	Ictalurus_punctatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	96	59.540	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.447	Ictalurus_punctatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	83.964	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	83.964	Ictalurus_punctatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	81.069	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	81.069	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	79.733	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	79.733	Labrus_bergylta
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	63.029	ENSLACG00000004899	-	99	63.029	Latimeria_chalumnae
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	68.071	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	68.071	Latimeria_chalumnae
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	61.573	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.486	Latimeria_chalumnae
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	74.049	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.049	Lepisosteus_oculatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.401	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	80.401	Mastacembelus_armatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	96	59.815	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.815	Mastacembelus_armatus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Maylandia_zebra
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Maylandia_zebra
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.901	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.901	Mola_mola
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Monopterus_albus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	98	79.545	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	79.545	Monopterus_albus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	96	60.690	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.690	Neolamprologus_brichardi
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.624	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	80.624	Neolamprologus_brichardi
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Oreochromis_niloticus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Oreochromis_niloticus
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Oryzias_latipes
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.991	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Oryzias_latipes
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	79.065	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	79.065	Oryzias_latipes_hni
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Oryzias_latipes_hni
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	79.510	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	79.510	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	59.430	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_melastigma
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.624	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	80.690	Oryzias_melastigma
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	57.684	ENSPKIG00000023918	-	98	57.684	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	58.643	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	76.169	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	76.169	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	78.174	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	78.174	Periophthalmus_magnuspinnatus
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