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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPNAG00000021484 (Gene tree)
Gene ID: 108427972
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pygocentrus_nattereri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36256 bases
Position: chrKV575288.1:2436475-2472730
Accession: 108427972
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPNAP00000033061	IBN_N	PF03810.19	8.5e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPNAT00000023596	-	3038	XM_017698602	ENSPNAP00000033061	892 (aa)	XP_017554091	UPI000814B461

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	86.277	ENSPNAG00000024491	tnpo2	99	85.602
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	85.602	ENSPNAG00000026208	-	99	85.264

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.507	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.058	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	91.667	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.343	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPNAG00000021484	tnpo1	87	93.557	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.428	Amphilophus_citrinellus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.507	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.058	Amphiprion_ocellaris
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.507	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.058	Amphiprion_percula
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.283	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.834	Anabas_testudineus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	89.402	ENSAPLG00000009619	-	97	90.482	Anas_platyrhynchos
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.386	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.937	Anolis_carolinensis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	61.062	ENSANAG00000027118	-	99	61.215	Aotus_nancymaae
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.152	ENSANAG00000022453	-	99	91.825	Aotus_nancymaae
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	83.632	ENSANAG00000025351	-	99	83.632	Aotus_nancymaae
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.265	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.152	Astatotilapia_calliptera
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	97.534	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	97.534	Astyanax_mexicanus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.049	Bos_taurus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.265	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	91.825	Callithrix_jacchus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	92.782	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.326	Canis_familiaris
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	90.022	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	89.586	Canis_lupus_dingo
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.825	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.161	Capra_hircus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	89.290	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.142	Carlito_syrichta
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.152	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.713	Cebus_capucinus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.161	Cercocebus_atys
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.152	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	91.713	Chinchilla_lanigera
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.161	Chlorocebus_sabaeus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	94	80.737	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.116	Choloepus_hoffmanni
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.498	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.498	Chrysemys_picta_bellii
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	75.812	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.812	Ciona_savignyi
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.161	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.265	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	93.116	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.649	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.152	Cynoglossus_semilaevis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.498	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.049	Cyprinodon_variegatus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.843	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.395	Danio_rerio
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	87.039	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.277	Dasypus_novemcinctus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	93	92.788	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.548	Dipodomys_ordii
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	58.221	FBgn0035693	CG8219	99	57.883	Drosophila_melanogaster
ENSPNAG00000021484	tnpo1	86	94.007	ENSETEG00000017805	TNPO1	80	95.946	Echinops_telfairi
ENSPNAG00000021484	tnpo1	94	85.629	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.273	Eptatretus_burgeri
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.161	Equus_asinus_asinus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.825	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.385	Equus_caballus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	88.235	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.126	Esox_lucius
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.161	Felis_catus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.049	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.601	Ficedula_albicollis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.265	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	91.825	Fukomys_damarensis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.722	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.274	Fundulus_heteroclitus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.385	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.385	Gadus_morhua
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.265	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	91.928	Gallus_gallus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.834	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.834	Gambusia_affinis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.274	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.825	Gasterosteus_aculeatus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.161	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	92.713	Gopherus_agassizii
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.161	Gorilla_gorilla
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	77.691	ENSGGOG00000022535	-	98	77.691	Gorilla_gorilla
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.722	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.274	Haplochromis_burtoni
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.377	ENSHGLG00000000970	-	99	91.713	Heterocephalus_glaber_female
ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	92.657	ENSHGLG00100017090	-	99	91.967	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNAG00000021484	tnpo1	97	72.854	ENSHGLG00100000963	-	99	72.422	Heterocephalus_glaber_male
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.937	Jaculus_jaculus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.170	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.722	Kryptolebias_marmoratus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	91	91.256	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.394	Labrus_bergylta
ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	87.123	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.311	Latimeria_chalumnae
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.507	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	93.610	Lepisosteus_oculatus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	97	92.166	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.715	Loxodonta_africana
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.161	Macaca_fascicularis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.489	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.238	Macaca_mulatta
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.161	Macaca_nemestrina
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.161	Mandrillus_leucophaeus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.843	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.395	Mastacembelus_armatus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.498	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.386	Maylandia_zebra
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.135	Mesocricetus_auratus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	88.789	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.354	Microcebus_murinus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.265	Microtus_ochrogaster
ENSPNAG00000021484	tnpo1	87	93.814	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.814	Mola_mola
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	93.617	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.617	Monodelphis_domestica
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.049	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.601	Monopterus_albus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.825	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	92.377	Mus_caroli
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	92.265	Mus_musculus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.825	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.336	Mus_pahari
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	92.213	Mus_spretus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.489	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.049	Mustela_putorius_furo
ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	92.334	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	91.879	Myotis_lucifugus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.825	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.377	Nannospalax_galili
ENSPNAG00000021484	tnpo1	87	93.686	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.557	Neolamprologus_brichardi
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.161	Nomascus_leucogenys
ENSPNAG00000021484	tnpo1	90	88.179	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.179	Ochotona_princeps
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.152	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.713	Octodon_degus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.984	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.539	Oreochromis_niloticus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	92	93.309	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	92.822	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	87.296	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.612	Oryctolagus_cuniculus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	87	93.402	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.402	Oryzias_latipes
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	93.813	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.813	Oryzias_latipes_hni
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	93.926	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.476	Oryzias_latipes_hsok
ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	93.363	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.026	Oryzias_melastigma
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.161	Otolemur_garnettii
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.713	Ovis_aries
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.161	Pan_paniscus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.161	Panthera_pardus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.161	Panthera_tigris_altaica
ENSPNAG00000021484	tnpo1	94	81.492	ENSPTRG00000047731	-	100	81.492	Pan_troglodytes
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.161	Pan_troglodytes
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.601	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.161	Papio_anubis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	90.919	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.471	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.498	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.049	Pelodiscus_sinensis
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	90.929	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	91.041	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	93.116	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.649	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.386	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	92.721	Phascolarctos_cinereus
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.953	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.953	Poecilia_formosa
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.953	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.953	Poecilia_latipinna
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.946	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.498	Poecilia_mexicana
ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.283	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	94.283	Poecilia_reticulata
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